Protein–RNA interactions for Protein: Q07409

Cntn3, Contactin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn3Q07409 Olfr1361-202ENSMUST00000214321 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Cntn3Q07409 Gm16427-202ENSMUST00000200745 1749 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Cntn3Q07409 Lipk-201ENSMUST00000054260 2125 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Cntn3Q07409 Lrrc40-201ENSMUST00000072080 4142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Cntn3Q07409 Trrap-215ENSMUST00000213013 12398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Cntn3Q07409 Phf3-205ENSMUST00000186733 7567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Cntn3Q07409 AI182371-207ENSMUST00000226972 1642 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Cntn3Q07409 Rpe65-201ENSMUST00000029824 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Cntn3Q07409 Abcc1-201ENSMUST00000100167 6792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Cntn3Q07409 5330409N07Rik-201ENSMUST00000222069 3518 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Cntn3Q07409 Gm44220-201ENSMUST00000203784 2487 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Cntn3Q07409 Cyp4a30b-201ENSMUST00000119958 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Cntn3Q07409 Gm9314-201ENSMUST00000199881 1528 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Cntn3Q07409 Apbb1ip-201ENSMUST00000014290 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Cntn3Q07409 Olfr860-201ENSMUST00000086482 1686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Cntn3Q07409 Ugt2b34-201ENSMUST00000031181 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Cntn3Q07409 Patj-203ENSMUST00000102792 3755 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Cntn3Q07409 Fastkd1-202ENSMUST00000102706 2511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Cntn3Q07409 Slc26a2-201ENSMUST00000037603 2802 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Cntn3Q07409 Gm13030-201ENSMUST00000105805 655 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Cntn3Q07409 Apoa2-202ENSMUST00000111319 458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Cntn3Q07409 Tceal7-201ENSMUST00000113116 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Cntn3Q07409 Gm13744-201ENSMUST00000118953 850 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Cntn3Q07409 Gm11991-201ENSMUST00000119652 1074 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Cntn3Q07409 Gm15030-201ENSMUST00000119804 484 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Cntn3Q07409 Gm5135-201ENSMUST00000121100 573 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Cntn3Q07409 Gm15227-201ENSMUST00000121844 399 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Cntn3Q07409 Gm13860-201ENSMUST00000125185 452 ntTSL 3 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Cntn3Q07409 Gm12911-201ENSMUST00000140639 703 ntTSL 3 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Cntn3Q07409 4930547E08Rik-201ENSMUST00000143559 541 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Cntn3Q07409 Gm23059-201ENSMUST00000158978 107 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Cntn3Q07409 Gm16026-202ENSMUST00000159695 772 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Cntn3Q07409 Defa27-201ENSMUST00000167683 282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Cntn3Q07409 Svs4-201ENSMUST00000017142 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Cntn3Q07409 Trav12d-3-201ENSMUST00000177703 347 ntAPPRIS P1 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Cntn3Q07409 Gm26801-201ENSMUST00000180591 1219 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Cntn3Q07409 Gm26587-201ENSMUST00000180795 989 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Cntn3Q07409 Gm27026-201ENSMUST00000183003 892 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Cntn3Q07409 Gm28340-201ENSMUST00000189218 202 ntTSL 3 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Cntn3Q07409 Gm37809-201ENSMUST00000195050 931 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Cntn3Q07409 1700113A16Rik-202ENSMUST00000197172 776 ntTSL 2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Cntn3Q07409 Gm43391-203ENSMUST00000198110 1001 ntTSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
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Cntn3Q07409 AC122428.4-201ENSMUST00000213494 589 ntTSL 3 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Cntn3Q07409 Odf3l1-202ENSMUST00000215694 1212 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Cntn3Q07409 4930579P08Rik-201ENSMUST00000218193 1227 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Cntn3Q07409 Olfr602-ps1-202ENSMUST00000218213 1169 ntTSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Cntn3Q07409 Smim15-203ENSMUST00000224361 830 ntAPPRIS P1 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Cntn3Q07409 Apcs-201ENSMUST00000027824 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Cntn3Q07409 Vmn1r74-201ENSMUST00000050416 915 ntAPPRIS P1 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Cntn3Q07409 Tceal8-201ENSMUST00000060101 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Cntn3Q07409 Olfr357-201ENSMUST00000069578 1092 ntAPPRIS P1 BASIC7.74□□□□□ -1.17
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Cntn3Q07409 Bglap3-201ENSMUST00000075523 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
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Cntn3Q07409 Olfr259-201ENSMUST00000099862 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Cntn3Q07409 Dsc3-203ENSMUST00000225110 3123 ntAPPRIS P2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
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Cntn3Q07409 Rab39b-201ENSMUST00000033545 3401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
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Cntn3Q07409 Mecp2-205ENSMUST00000170481 10175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
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Cntn3Q07409 Pomk-201ENSMUST00000061850 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Cntn3Q07409 CT009757.6-201ENSMUST00000220661 2312 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Cntn3Q07409 C1s1-204ENSMUST00000162443 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Cntn3Q07409 Amd1-201ENSMUST00000099945 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Cntn3Q07409 AC163032.1-201ENSMUST00000220671 2970 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Cntn3Q07409 Olfr1564-204ENSMUST00000213751 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Cntn3Q07409 Gm10143-202ENSMUST00000150038 3332 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Cntn3Q07409 Olfr316-202ENSMUST00000215071 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Cntn3Q07409 Smarca2-246ENSMUST00000209085 1841 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Cntn3Q07409 Olfr285-202ENSMUST00000216901 5330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Cntn3Q07409 Gm18537-202ENSMUST00000206215 1503 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Cntn3Q07409 Gm7842-201ENSMUST00000217691 1379 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Cntn3Q07409 Plxna4os2-201ENSMUST00000152538 2044 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Cntn3Q07409 Gm37915-201ENSMUST00000195134 3261 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Cntn3Q07409 A730011C13Rik-202ENSMUST00000141787 1877 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Cntn3Q07409 Kcna2-203ENSMUST00000197470 4370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Cntn3Q07409 Slc6a19-201ENSMUST00000022048 3936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Cntn3Q07409 Gm37151-201ENSMUST00000194631 5007 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Cntn3Q07409 Zfp385b-211ENSMUST00000171063 2668 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Cntn3Q07409 Slc4a4-201ENSMUST00000113216 2518 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Cntn3Q07409 Olfr740-202ENSMUST00000214792 4103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Cntn3Q07409 Slc25a53-202ENSMUST00000113069 3189 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Cntn3Q07409 Gm25757-201ENSMUST00000103986 123 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Cntn3Q07409 Gm12287-201ENSMUST00000119770 707 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Cntn3Q07409 Gm12807-201ENSMUST00000121546 962 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Cntn3Q07409 Gm12224-202ENSMUST00000127107 726 ntTSL 3 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Cntn3Q07409 Gm16984-201ENSMUST00000130003 982 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Cntn3Q07409 Trav8-2-201ENSMUST00000130122 337 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Cntn3Q07409 Gm13421-202ENSMUST00000142511 803 ntTSL 3 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Cntn3Q07409 Gm14764-201ENSMUST00000147130 313 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86 ms