Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 Gm32717-201ENSMUST00000219147 2409 ntAPPRIS P1 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Hoxd13P70217 Gm9029-201ENSMUST00000219232 2410 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Hoxd13P70217 Gm32802-201ENSMUST00000219565 2409 ntAPPRIS P1 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Hoxd13P70217 Gm9045-201ENSMUST00000219760 2409 ntAPPRIS P1 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Hoxd13P70217 Gm14418-201ENSMUST00000108955 1415 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Hoxd13P70217 Gm7337-202ENSMUST00000181439 2655 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Hoxd13P70217 Tmem232-201ENSMUST00000062161 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Hoxd13P70217 Olfr45-202ENSMUST00000214637 6157 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Hoxd13P70217 Zc4h2-202ENSMUST00000119640 2075 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Hoxd13P70217 Pfkfb1-202ENSMUST00000112713 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Hoxd13P70217 Gja5-201ENSMUST00000072600 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Hoxd13P70217 Slmap-204ENSMUST00000112330 3962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Hoxd13P70217 Gm11590-201ENSMUST00000118999 1455 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Hoxd13P70217 4921511C10Rik-201ENSMUST00000200412 1463 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Hoxd13P70217 Mir760-201ENSMUST00000103257 119 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Hoxd13P70217 Trav19-201ENSMUST00000103674 446 ntAPPRIS P1 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Hoxd13P70217 Crisp4-202ENSMUST00000115340 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Hoxd13P70217 Gm12842-201ENSMUST00000117298 476 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Hoxd13P70217 Tex35-203ENSMUST00000119526 679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Hoxd13P70217 Gm15311-201ENSMUST00000119682 282 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Hoxd13P70217 Gm15305-201ENSMUST00000120354 288 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Hoxd13P70217 Gm12978-201ENSMUST00000121250 522 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Hoxd13P70217 Gm14840-201ENSMUST00000122135 594 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Hoxd13P70217 Gm25178-201ENSMUST00000122633 325 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Hoxd13P70217 Gm16152-201ENSMUST00000131663 872 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Hoxd13P70217 Gm22428-201ENSMUST00000158554 132 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Hoxd13P70217 Gm15680-201ENSMUST00000161597 465 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Hoxd13P70217 Gm17727-201ENSMUST00000171898 643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Hoxd13P70217 Scgb2b19-201ENSMUST00000179688 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Hoxd13P70217 Gm29044-202ENSMUST00000188980 300 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Hoxd13P70217 Gm20877-202ENSMUST00000191358 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Hoxd13P70217 Gm412-201ENSMUST00000193360 948 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Hoxd13P70217 Gm38232-201ENSMUST00000193602 411 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Hoxd13P70217 A730082K24Rik-201ENSMUST00000205365 465 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Hoxd13P70217 Spcs2-203ENSMUST00000207137 881 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Hoxd13P70217 4930434F21Rik-201ENSMUST00000214381 742 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Hoxd13P70217 4930455C13Rik-201ENSMUST00000218108 1018 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Hoxd13P70217 Gm1000-201ENSMUST00000220520 801 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Hoxd13P70217 AC163684.1-201ENSMUST00000223766 927 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Hoxd13P70217 CT009711.4-201ENSMUST00000225685 198 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Hoxd13P70217 AC105324.1-201ENSMUST00000227844 386 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Hoxd13P70217 4930447F04Rik-201ENSMUST00000033525 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Hoxd13P70217 Gm26437-201ENSMUST00000082595 105 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Hoxd13P70217 Gm24621-201ENSMUST00000082679 140 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Hoxd13P70217 Olfr1307-202ENSMUST00000099606 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Hoxd13P70217 Olfr1233-201ENSMUST00000099784 1042 ntAPPRIS P1 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Hoxd13P70217 Abca17-202ENSMUST00000121226 5317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Hoxd13P70217 Igf1os-202ENSMUST00000146581 2595 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Hoxd13P70217 Mdc1-201ENSMUST00000082337 7335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Hoxd13P70217 AC153945.1-201ENSMUST00000217761 1722 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Hoxd13P70217 Phlpp2-201ENSMUST00000034175 7839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Hoxd13P70217 Fbxw10-203ENSMUST00000150989 3267 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Hoxd13P70217 Crb1-204ENSMUST00000198445 6135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Hoxd13P70217 CT009604.1-201ENSMUST00000223900 1328 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Hoxd13P70217 Tnik-205ENSMUST00000160307 4404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Hoxd13P70217 Mbd5-202ENSMUST00000112745 6037 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Hoxd13P70217 Amy2b-201ENSMUST00000120184 1577 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Hoxd13P70217 Gm20121-201ENSMUST00000198547 1594 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Hoxd13P70217 Bdnf-204ENSMUST00000111044 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Hoxd13P70217 Tlr11-201ENSMUST00000063570 2993 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Hoxd13P70217 Usp8-202ENSMUST00000110416 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Hoxd13P70217 Phactr4-202ENSMUST00000084249 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Hoxd13P70217 Pcdh17-201ENSMUST00000071370 11451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Hoxd13P70217 AC159264.1-201ENSMUST00000224844 4257 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Hoxd13P70217 A830010M20Rik-203ENSMUST00000100951 4545 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Hoxd13P70217 Cdh9-201ENSMUST00000026432 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Hoxd13P70217 Gm37745-201ENSMUST00000193304 8163 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Hoxd13P70217 Serpinb9-201ENSMUST00000006391 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Hoxd13P70217 Ankrd49-206ENSMUST00000216372 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Hoxd13P70217 Vwa3a-204ENSMUST00000166668 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Hoxd13P70217 4933400C23Rik-201ENSMUST00000188610 1708 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Hoxd13P70217 Mmp10-201ENSMUST00000034488 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Hoxd13P70217 Psg29-201ENSMUST00000075934 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Hoxd13P70217 Lilra6-202ENSMUST00000090689 1977 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Hoxd13P70217 Cmah-209ENSMUST00000224953 2221 ntAPPRIS P1 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Hoxd13P70217 Top3b-203ENSMUST00000119787 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Hoxd13P70217 Pcsk2os1-201ENSMUST00000126735 4233 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Hoxd13P70217 Aox4-201ENSMUST00000040442 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Hoxd13P70217 Srpk2-201ENSMUST00000088392 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Hoxd13P70217 Mapk1ip1l-201ENSMUST00000164235 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Hoxd13P70217 Bcl2l11-203ENSMUST00000103210 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Hoxd13P70217 Gm37403-201ENSMUST00000193775 3521 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Hoxd13P70217 Bank1-201ENSMUST00000041577 3268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Hoxd13P70217 Gm18409-201ENSMUST00000218988 2506 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Hoxd13P70217 Gm26806-201ENSMUST00000180403 1519 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Hoxd13P70217 Gm8281-201ENSMUST00000100893 612 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Hoxd13P70217 Gm26143-201ENSMUST00000104480 108 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Hoxd13P70217 Gm12101-201ENSMUST00000121590 390 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Hoxd13P70217 Gm16249-201ENSMUST00000124055 1258 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Hoxd13P70217 Gm13746-201ENSMUST00000133981 605 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Hoxd13P70217 Gm13175-201ENSMUST00000139479 466 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Hoxd13P70217 Gm12279-201ENSMUST00000142533 294 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Hoxd13P70217 Gm11335-201ENSMUST00000148743 1080 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Hoxd13P70217 Gm16006-201ENSMUST00000160938 566 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Hoxd13P70217 Gm23968-201ENSMUST00000175047 125 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Hoxd13P70217 Gm26455-201ENSMUST00000175300 92 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Hoxd13P70217 Gm8237-202ENSMUST00000178594 447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Hoxd13P70217 Gm29277-201ENSMUST00000185226 602 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Hoxd13P70217 Gm29337-201ENSMUST00000185425 284 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Hoxd13P70217 Gm29089-201ENSMUST00000186209 602 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.9 ms