Protein–RNA interactions for Protein: P55066

Ncan, Neurocan core protein, mousemouse

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Length 1,268 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcanP55066 Tmem216-203ENSMUST00000123788 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
NcanP55066 Gm20778-201ENSMUST00000178524 627 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
NcanP55066 Mir7031-201ENSMUST00000183860 65 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
NcanP55066 Gm23011-202ENSMUST00000197855 275 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
NcanP55066 Gm8999-201ENSMUST00000204951 969 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
NcanP55066 Gm45069-201ENSMUST00000208604 317 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
NcanP55066 5330439M10Rik-201ENSMUST00000218667 348 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
NcanP55066 AC079681.1-201ENSMUST00000219437 639 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
NcanP55066 n-R5s58-201ENSMUST00000093682 119 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
NcanP55066 Calcoco2-202ENSMUST00000097162 968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
NcanP55066 Olfr1012-201ENSMUST00000099916 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
NcanP55066 Pax6-208ENSMUST00000111088 4427 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
NcanP55066 4930422C21Rik-201ENSMUST00000212419 2362 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
NcanP55066 Slc7a2-204ENSMUST00000118432 3681 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
NcanP55066 Trub1-201ENSMUST00000026072 4300 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
NcanP55066 Ccnb2-ps-202ENSMUST00000170898 2296 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
NcanP55066 Agbl1-202ENSMUST00000107442 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
NcanP55066 Unc79-201ENSMUST00000085079 7762 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
NcanP55066 Gm10439-201ENSMUST00000101181 1977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
NcanP55066 Gm44669-201ENSMUST00000207774 1969 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
NcanP55066 Arhgap1-203ENSMUST00000111330 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
NcanP55066 Dock7-214ENSMUST00000205650 6297 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
NcanP55066 Ncoa4-202ENSMUST00000163336 4065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
NcanP55066 Atf7ip-201ENSMUST00000032335 8059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
NcanP55066 Hdlbp-202ENSMUST00000170883 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
NcanP55066 Cyld-203ENSMUST00000109626 7945 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
NcanP55066 Slc4a4-208ENSMUST00000156238 3494 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
NcanP55066 Prepl-202ENSMUST00000171795 3830 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
NcanP55066 Gm45464-201ENSMUST00000210728 2844 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
NcanP55066 Cd209a-201ENSMUST00000012847 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
NcanP55066 Gm13102-203ENSMUST00000105761 2281 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
NcanP55066 Olfr521-202ENSMUST00000219663 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
NcanP55066 Olfr521-203ENSMUST00000220001 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
NcanP55066 Gm13102-202ENSMUST00000097800 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
NcanP55066 Ugt2b34-201ENSMUST00000031181 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
NcanP55066 Gm6249-201ENSMUST00000211142 3314 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
NcanP55066 Olfr1509-206ENSMUST00000215030 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
NcanP55066 Ddx4-201ENSMUST00000075748 2762 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
NcanP55066 Foxp2-202ENSMUST00000115469 1293 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
NcanP55066 Gm14550-201ENSMUST00000117918 407 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
NcanP55066 Gm12242-201ENSMUST00000118824 738 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
NcanP55066 Gm11481-201ENSMUST00000120069 255 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
NcanP55066 Rpl36a-ps4-201ENSMUST00000121019 296 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
NcanP55066 Gm14237-201ENSMUST00000122080 430 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
NcanP55066 4930405D11Rik-203ENSMUST00000142521 645 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
NcanP55066 4930412L05Rik-202ENSMUST00000146501 1241 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
NcanP55066 Gm25116-201ENSMUST00000157191 122 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
NcanP55066 Gm22523-201ENSMUST00000158696 100 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
NcanP55066 Gm24733-201ENSMUST00000158863 253 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
NcanP55066 4930448H16Rik-201ENSMUST00000159838 580 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
NcanP55066 Gm16164-201ENSMUST00000160078 468 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
NcanP55066 Vwc2l-204ENSMUST00000162182 1195 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
NcanP55066 Lrrc4-202ENSMUST00000171353 883 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
NcanP55066 Gm16430-202ENSMUST00000178145 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
NcanP55066 Gm16405-202ENSMUST00000180150 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
NcanP55066 4930445N18Rik-201ENSMUST00000180631 886 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
NcanP55066 Gm27018-201ENSMUST00000181136 225 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
NcanP55066 Gm28620-201ENSMUST00000190463 439 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
NcanP55066 Gm42580-201ENSMUST00000197223 753 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
NcanP55066 Gm44330-201ENSMUST00000200106 143 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
NcanP55066 Gm2011-203ENSMUST00000203750 435 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
NcanP55066 Stx3-206ENSMUST00000211047 870 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
NcanP55066 AC147782.1-201ENSMUST00000219169 475 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
NcanP55066 AC079680.1-202ENSMUST00000219835 654 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
NcanP55066 Cox7b-201ENSMUST00000033582 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
NcanP55066 Olfr732-201ENSMUST00000071208 1044 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
NcanP55066 Olfr547-201ENSMUST00000098229 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
NcanP55066 Gm15114-201ENSMUST00000112788 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
NcanP55066 Gm37984-201ENSMUST00000191641 3733 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
NcanP55066 Gm16123-201ENSMUST00000118647 1517 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
NcanP55066 Rsad2-201ENSMUST00000020970 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
NcanP55066 Trappc2-202ENSMUST00000112194 1418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
NcanP55066 A730091E23Rik-201ENSMUST00000221700 3825 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
NcanP55066 1110008L16Rik-205ENSMUST00000184766 2250 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
NcanP55066 Olfr76-202ENSMUST00000213471 3109 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
NcanP55066 Gm37170-201ENSMUST00000194488 1934 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
NcanP55066 Gm28333-201ENSMUST00000186034 2168 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
NcanP55066 Gm28315-201ENSMUST00000189948 2168 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
NcanP55066 Kpna2-ps-201ENSMUST00000120025 1569 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
NcanP55066 Olfr744-202ENSMUST00000213668 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
NcanP55066 Nin-211ENSMUST00000222237 9919 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
NcanP55066 AC105958.1-201ENSMUST00000214783 2144 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
NcanP55066 F13b-201ENSMUST00000027615 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
NcanP55066 4921528I07Rik-202ENSMUST00000213446 3798 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
NcanP55066 Ppp3r2-201ENSMUST00000029991 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
NcanP55066 Pet2-201ENSMUST00000113959 4183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
NcanP55066 Pet2-202ENSMUST00000113960 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
NcanP55066 Rp1-203ENSMUST00000208660 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
NcanP55066 Xrn2-201ENSMUST00000028921 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
NcanP55066 Mup19-202ENSMUST00000107477 720 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
NcanP55066 Gm14388-201ENSMUST00000118119 477 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
NcanP55066 Gm14775-201ENSMUST00000122089 310 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
NcanP55066 Gm8648-201ENSMUST00000122457 221 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
NcanP55066 Gm10658-201ENSMUST00000128125 1241 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
NcanP55066 Gm13610-201ENSMUST00000128298 951 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
NcanP55066 Gm15963-201ENSMUST00000131387 876 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
NcanP55066 AI646519-201ENSMUST00000140987 351 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
NcanP55066 Gm24685-201ENSMUST00000157764 285 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
NcanP55066 Gm18199-201ENSMUST00000173820 835 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
NcanP55066 Gm18191-201ENSMUST00000174624 824 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
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