Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Gm5799-201ENSMUST00000169023 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
PtprmP28828 Klb-201ENSMUST00000031096 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
PtprmP28828 Atp13a4-202ENSMUST00000057018 4054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
PtprmP28828 Blm-202ENSMUST00000170315 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
PtprmP28828 Bdnf-201ENSMUST00000053317 4266 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
PtprmP28828 AC138284.1-201ENSMUST00000214258 3236 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
PtprmP28828 Gm40770-201ENSMUST00000220040 1502 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
PtprmP28828 Itk-201ENSMUST00000020664 4272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
PtprmP28828 AC115746.1-201ENSMUST00000228949 3617 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
PtprmP28828 Zzef1-207ENSMUST00000172220 11249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
PtprmP28828 Usp29-201ENSMUST00000054055 2610 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
PtprmP28828 Utrn-206ENSMUST00000219003 5751 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
PtprmP28828 Ifit3b-201ENSMUST00000076249 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
PtprmP28828 Gm23669-201ENSMUST00000157470 128 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
PtprmP28828 Gm3053-201ENSMUST00000161709 616 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
PtprmP28828 Gm9064-201ENSMUST00000163579 566 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
PtprmP28828 Gm27853-201ENSMUST00000184176 250 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
PtprmP28828 Gm28783-201ENSMUST00000188872 359 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
PtprmP28828 4930563H07Rik-201ENSMUST00000203494 628 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
PtprmP28828 Gm45122-201ENSMUST00000206376 784 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
PtprmP28828 1700047O18Rik-201ENSMUST00000209738 743 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
PtprmP28828 Gm32817-201ENSMUST00000210007 689 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
PtprmP28828 Gm17950-201ENSMUST00000214617 646 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
PtprmP28828 AC159979.1-201ENSMUST00000227927 342 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
PtprmP28828 Pcdh12-201ENSMUST00000025311 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
PtprmP28828 Tns3-201ENSMUST00000020695 7483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
PtprmP28828 Gm37730-201ENSMUST00000192432 2211 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
PtprmP28828 Ttc21b-202ENSMUST00000125446 4061 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
PtprmP28828 Mrpl19-201ENSMUST00000032124 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
PtprmP28828 Trerf1-205ENSMUST00000190080 7045 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
PtprmP28828 Gpr35-203ENSMUST00000169198 4214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
PtprmP28828 Ank1-213ENSMUST00000141784 6566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
PtprmP28828 Gpbp1l1-202ENSMUST00000106475 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
PtprmP28828 Nt5c2-201ENSMUST00000086961 3745 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
PtprmP28828 Mtpap-201ENSMUST00000025077 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
PtprmP28828 Olfr770-203ENSMUST00000204250 1644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
PtprmP28828 Gm36908-201ENSMUST00000218080 1662 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
PtprmP28828 Rgs4-201ENSMUST00000027991 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
PtprmP28828 Map2-207ENSMUST00000114018 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
PtprmP28828 Ddb1-201ENSMUST00000025649 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
PtprmP28828 Ripor2-204ENSMUST00000110383 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
PtprmP28828 Cd59a-203ENSMUST00000168176 1806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
PtprmP28828 Vmn2r88-201ENSMUST00000022438 2574 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
PtprmP28828 Gria3-201ENSMUST00000076349 5192 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
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PtprmP28828 Trav6n-5-201ENSMUST00000103611 338 ntAPPRIS P1 BASIC9.48□□□□□ -0.89
PtprmP28828 Gm21103-201ENSMUST00000112737 984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
PtprmP28828 Gm8761-201ENSMUST00000121507 955 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
PtprmP28828 Gm26312-201ENSMUST00000157769 165 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
PtprmP28828 Gm3047-201ENSMUST00000164069 822 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
PtprmP28828 Gm3029-201ENSMUST00000168306 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
PtprmP28828 Trav6d-7-201ENSMUST00000178650 358 ntAPPRIS P1 BASIC9.48□□□□□ -0.89
PtprmP28828 Trav6n-7-201ENSMUST00000179607 358 ntAPPRIS P1 BASIC9.48□□□□□ -0.89
PtprmP28828 Rpl9-ps1-202ENSMUST00000182502 576 ntAPPRIS P1 BASIC9.48□□□□□ -0.89
PtprmP28828 Gm6931-201ENSMUST00000183103 371 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
PtprmP28828 Trav6d-6-201ENSMUST00000197754 344 ntAPPRIS P1 BASIC9.48□□□□□ -0.89
PtprmP28828 Gm43055-201ENSMUST00000198859 879 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
PtprmP28828 Gm44251-201ENSMUST00000204963 442 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
PtprmP28828 E330011O21Rik-208ENSMUST00000211650 1225 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
PtprmP28828 AC164567.4-201ENSMUST00000219708 483 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
PtprmP28828 Vmn1r37-201ENSMUST00000077482 909 ntAPPRIS P2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
PtprmP28828 Gm42874-201ENSMUST00000198888 1774 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
PtprmP28828 CT010470.1-201ENSMUST00000225364 1876 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
PtprmP28828 4921521D15Rik-201ENSMUST00000197578 1927 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
PtprmP28828 Olfr1340-204ENSMUST00000217334 2001 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
PtprmP28828 Slc45a4-207ENSMUST00000151288 7509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
PtprmP28828 Slc25a40-202ENSMUST00000170496 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
PtprmP28828 Olfr686-202ENSMUST00000214147 2646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
PtprmP28828 Stat4-201ENSMUST00000027277 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
PtprmP28828 Eif4e2-202ENSMUST00000076362 3394 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
PtprmP28828 Olfr615-202ENSMUST00000214345 3403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
PtprmP28828 Il1rl1-202ENSMUST00000097772 5302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
PtprmP28828 Olfr338-203ENSMUST00000217511 5724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
PtprmP28828 Adam22-202ENSMUST00000050166 8969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
PtprmP28828 Erc2-205ENSMUST00000210135 6233 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
PtprmP28828 Ftx-205ENSMUST00000156211 4215 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
PtprmP28828 Avpr1b-201ENSMUST00000027690 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
PtprmP28828 Lars2-201ENSMUST00000038863 3894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
PtprmP28828 Rps6ka6-201ENSMUST00000065976 3867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
PtprmP28828 Synj2-204ENSMUST00000115785 3778 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
PtprmP28828 Gm12532-201ENSMUST00000148448 2684 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
PtprmP28828 Marf1-201ENSMUST00000090300 7765 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
PtprmP28828 Dach2-203ENSMUST00000113379 2512 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
PtprmP28828 Pum1-204ENSMUST00000105991 4614 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
PtprmP28828 C530043A13Rik-202ENSMUST00000188155 1512 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
PtprmP28828 Gucy2c-202ENSMUST00000078095 3863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
PtprmP28828 Ighv2-7-201ENSMUST00000103456 355 ntAPPRIS P1 BASIC9.47□□□□□ -0.89
PtprmP28828 Mptx2-201ENSMUST00000111224 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
PtprmP28828 Mir1188-201ENSMUST00000116756 120 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
PtprmP28828 Gm15233-201ENSMUST00000118747 400 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
PtprmP28828 Gng2-ps1-201ENSMUST00000120523 217 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
PtprmP28828 Ufm1-202ENSMUST00000122330 637 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
PtprmP28828 Gm13629-202ENSMUST00000152740 645 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
PtprmP28828 Gm22596-201ENSMUST00000157601 316 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
PtprmP28828 Vmn2r-ps12-201ENSMUST00000175833 623 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
PtprmP28828 Prl3c1-201ENSMUST00000018066 823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
PtprmP28828 Mir6963-201ENSMUST00000183535 71 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
PtprmP28828 Gm28777-201ENSMUST00000191402 535 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
PtprmP28828 Tmem243-203ENSMUST00000198935 849 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
PtprmP28828 Gm18007-201ENSMUST00000205019 844 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
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