Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Gm6776-201ENSMUST00000057752 900 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Hoxd10P28359 Olfr481-201ENSMUST00000067143 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Hoxd10P28359 Olfr1457-201ENSMUST00000075170 954 ntAPPRIS P1 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Hoxd10P28359 Ogfod1-203ENSMUST00000109556 5310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Hoxd10P28359 4930402F06Rik-202ENSMUST00000113010 1372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Hoxd10P28359 Xlr5a-203ENSMUST00000114521 1474 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Hoxd10P28359 CT025535.2-201ENSMUST00000228572 7441 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Hoxd10P28359 Gm33968-201ENSMUST00000211015 1562 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Hoxd10P28359 4922502D21Rik-201ENSMUST00000051283 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Hoxd10P28359 Hsd11b1-201ENSMUST00000016338 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Hoxd10P28359 Stambpl1-202ENSMUST00000119603 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Hoxd10P28359 Xpnpep2-201ENSMUST00000077775 3498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Hoxd10P28359 Speer5-ps1-203ENSMUST00000217649 7431 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Hoxd10P28359 Gm38300-201ENSMUST00000194245 1870 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Hoxd10P28359 Gm43211-201ENSMUST00000196901 1899 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Hoxd10P28359 Lars2-201ENSMUST00000038863 3894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Hoxd10P28359 Uba1y-201ENSMUST00000115894 3981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Hoxd10P28359 Bnc2-201ENSMUST00000102820 4133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Hoxd10P28359 Vmn1r51-208ENSMUST00000227876 4160 ntAPPRIS P1 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Hoxd10P28359 Xiap-204ENSMUST00000115095 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Hoxd10P28359 Olfr1241-203ENSMUST00000215055 2441 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Hoxd10P28359 Gm43842-201ENSMUST00000202890 2982 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Hoxd10P28359 Ttc9c-202ENSMUST00000096751 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Hoxd10P28359 F830112A20Rik-201ENSMUST00000194249 3552 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Hoxd10P28359 Kcnj16-202ENSMUST00000106636 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Hoxd10P28359 Adsl-201ENSMUST00000023043 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Hoxd10P28359 Nxpe4-203ENSMUST00000216998 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Hoxd10P28359 Ephb2-202ENSMUST00000105845 10902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Hoxd10P28359 Zzz3-202ENSMUST00000106100 7607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Hoxd10P28359 n-R5s72-201ENSMUST00000104518 119 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Hoxd10P28359 Lrrc51-208ENSMUST00000106968 766 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Hoxd10P28359 Prl8a6-203ENSMUST00000110355 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Hoxd10P28359 Gm13224-201ENSMUST00000119586 94 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Hoxd10P28359 Rps29-ps-201ENSMUST00000122083 172 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Hoxd10P28359 1700047F07Rik-202ENSMUST00000143064 463 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Hoxd10P28359 Gm13629-202ENSMUST00000152740 645 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Hoxd10P28359 1700024B05Rik-202ENSMUST00000168972 1573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Hoxd10P28359 Mir7220-201ENSMUST00000183978 60 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Hoxd10P28359 4930579H20Rik-201ENSMUST00000187815 1516 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Hoxd10P28359 Gm28209-201ENSMUST00000187956 775 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Hoxd10P28359 Gm29508-202ENSMUST00000191414 710 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Hoxd10P28359 Gm37573-201ENSMUST00000193993 931 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Hoxd10P28359 Gm19024-201ENSMUST00000194681 1319 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Hoxd10P28359 Gm43533-201ENSMUST00000202933 2936 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Hoxd10P28359 Gm44221-201ENSMUST00000203552 388 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Hoxd10P28359 Gm44386-201ENSMUST00000204288 429 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Hoxd10P28359 Gm44770-201ENSMUST00000205395 1264 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Hoxd10P28359 Gm18600-201ENSMUST00000207205 505 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Hoxd10P28359 Gm44930-201ENSMUST00000207545 489 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Hoxd10P28359 Olfr1055-203ENSMUST00000213564 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Hoxd10P28359 Slc17a4-201ENSMUST00000021769 1604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Hoxd10P28359 Gm2139-201ENSMUST00000222569 1075 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Hoxd10P28359 AC161252.1-201ENSMUST00000225536 467 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Hoxd10P28359 AC158750.1-201ENSMUST00000226163 634 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Hoxd10P28359 AC154616.2-201ENSMUST00000227978 398 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Hoxd10P28359 AC138765.3-201ENSMUST00000227981 423 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Hoxd10P28359 Vmn1r44-213ENSMUST00000228700 2004 ntAPPRIS P1 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Hoxd10P28359 Mlip-201ENSMUST00000034910 1227 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Hoxd10P28359 Prl8a6-202ENSMUST00000080762 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Hoxd10P28359 n-R5-8s1-201ENSMUST00000083988 148 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Hoxd10P28359 Gm10205-201ENSMUST00000087431 234 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Hoxd10P28359 Olfr1085-201ENSMUST00000099879 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Hoxd10P28359 Zkscan1-202ENSMUST00000066617 8042 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.19
Hoxd10P28359 Mov10l1-201ENSMUST00000015509 4052 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.19
Hoxd10P28359 Cbll1-203ENSMUST00000101499 3900 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
Hoxd10P28359 Adgrf1-201ENSMUST00000047399 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
Hoxd10P28359 C1qtnf7-201ENSMUST00000076939 3879 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
Hoxd10P28359 Bdnf-203ENSMUST00000111043 3839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
Hoxd10P28359 Gm15228-201ENSMUST00000142044 3440 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
Hoxd10P28359 Gm18194-202ENSMUST00000210952 3442 ntBASIC7.65□□□□□ -1.19
Hoxd10P28359 Mx1-201ENSMUST00000023655 3385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.19
Hoxd10P28359 Eif4e2-202ENSMUST00000076362 3394 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
Hoxd10P28359 Ccdc127-201ENSMUST00000022063 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
Hoxd10P28359 Cxcr2-202ENSMUST00000106899 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
Hoxd10P28359 Gm10440-201ENSMUST00000197424 2753 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
Hoxd10P28359 Zwint-202ENSMUST00000105431 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
Hoxd10P28359 Gm43254-201ENSMUST00000199187 2491 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Hoxd10P28359 Gm37956-201ENSMUST00000195208 2010 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Hoxd10P28359 Olfr286-201ENSMUST00000073612 3821 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Hoxd10P28359 Gm9839-201ENSMUST00000195252 1437 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Hoxd10P28359 Trip4-210ENSMUST00000179395 7055 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Hoxd10P28359 Olfr1215-202ENSMUST00000214809 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Hoxd10P28359 Agbl1-202ENSMUST00000107442 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Hoxd10P28359 Igkv4-71-201ENSMUST00000101325 288 ntAPPRIS P1 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Hoxd10P28359 Gm26067-201ENSMUST00000103789 110 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Hoxd10P28359 Gm14733-201ENSMUST00000117680 133 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Hoxd10P28359 Gm7700-201ENSMUST00000120273 970 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Hoxd10P28359 Gm23426-201ENSMUST00000122483 318 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Hoxd10P28359 Gm12631-201ENSMUST00000130576 637 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Hoxd10P28359 Gm12119-201ENSMUST00000136083 700 ntTSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Hoxd10P28359 A330102I10Rik-203ENSMUST00000145801 737 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Hoxd10P28359 Nudt12os-202ENSMUST00000152750 849 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Hoxd10P28359 Mgst2-203ENSMUST00000159554 486 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Hoxd10P28359 Gm20401-201ENSMUST00000173717 212 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Hoxd10P28359 Gm22655-201ENSMUST00000174949 96 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Hoxd10P28359 Ccl27b-201ENSMUST00000177785 425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Hoxd10P28359 Sbp-203ENSMUST00000182519 368 ntTSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Hoxd10P28359 Gm29519-201ENSMUST00000186994 398 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Hoxd10P28359 Gm37135-201ENSMUST00000192652 534 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Hoxd10P28359 Gm42584-201ENSMUST00000201404 220 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 105.9 ms