Protein–RNA interactions for Protein: P23336

Ggta1, N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, mousemouse

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Length 394 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggta1P23336 1700020M21Rik-201ENSMUST00000188320 644 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Ggta1P23336 2310046K23Rik-201ENSMUST00000193521 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Ggta1P23336 1700054O19Rik-201ENSMUST00000193604 868 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
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Ggta1P23336 Olfr809-201ENSMUST00000059891 1100 ntAPPRIS P1 BASIC6.32□□□□□ -1.4
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Ggta1P23336 Tek-203ENSMUST00000102798 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Ggta1P23336 Gm4847-201ENSMUST00000046662 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
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Ggta1P23336 Il15ra-210ENSMUST00000128156 1624 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Ggta1P23336 4933421A08Rik-201ENSMUST00000135313 1638 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Ggta1P23336 Gm10466-201ENSMUST00000101450 2466 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
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Ggta1P23336 Snord88a-201ENSMUST00000116723 90 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Ggta1P23336 Gm6382-201ENSMUST00000118873 942 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Ggta1P23336 Gm14489-201ENSMUST00000120868 901 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Ggta1P23336 Gm13462-201ENSMUST00000121472 961 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Ggta1P23336 Gm4886-201ENSMUST00000121874 1176 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Ggta1P23336 0610043K17Rik-202ENSMUST00000142581 372 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Ggta1P23336 6030442E23Rik-201ENSMUST00000186618 642 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Ggta1P23336 C78334-201ENSMUST00000186632 600 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
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