Protein–RNA interactions for Protein: P16546

Sptan1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptan1P16546 Grik2-205ENSMUST00000218598 3245 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Sptan1P16546 Gprasp1-206ENSMUST00000166554 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Sptan1P16546 Vmn1r176-202ENSMUST00000226319 2930 ntAPPRIS P1 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Sptan1P16546 Htr1d-201ENSMUST00000088677 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Sptan1P16546 Pirt-201ENSMUST00000123434 4200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Sptan1P16546 Ezh1-203ENSMUST00000107285 4193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Sptan1P16546 Exph5-201ENSMUST00000051014 5957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Sptan1P16546 Olfr1199-202ENSMUST00000124021 2967 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Sptan1P16546 Lrrc40-201ENSMUST00000072080 4142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Sptan1P16546 Sin3a-204ENSMUST00000167715 4961 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Sptan1P16546 Cd244-201ENSMUST00000004829 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Sptan1P16546 Mbnl2-201ENSMUST00000088419 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Sptan1P16546 Clasp1-204ENSMUST00000178710 7566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Sptan1P16546 Cd209a-201ENSMUST00000012847 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Sptan1P16546 Gm5512-201ENSMUST00000218013 1353 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Sptan1P16546 Bbx-203ENSMUST00000089404 4024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Sptan1P16546 Gm15073-201ENSMUST00000117432 634 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Sptan1P16546 C030037D09Rik-201ENSMUST00000125967 367 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Sptan1P16546 Gm15736-201ENSMUST00000141710 420 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Sptan1P16546 Gm20432-201ENSMUST00000173716 250 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Sptan1P16546 Gm45589-201ENSMUST00000209366 895 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Sptan1P16546 Gm38590-201ENSMUST00000209515 970 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Sptan1P16546 AC154634.2-201ENSMUST00000225983 1184 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Sptan1P16546 Klrc3-201ENSMUST00000071149 715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Sptan1P16546 Klf10-202ENSMUST00000226363 2917 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Sptan1P16546 Arhgef3-202ENSMUST00000224981 3618 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Sptan1P16546 AC164623.1-201ENSMUST00000217947 2709 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Sptan1P16546 Olfr666-202ENSMUST00000214757 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Sptan1P16546 Pkd1l1-203ENSMUST00000178195 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Sptan1P16546 Olfr435-202ENSMUST00000215565 2491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Sptan1P16546 Lifr-207ENSMUST00000227727 2489 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Sptan1P16546 Gm12021-201ENSMUST00000121061 1746 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Sptan1P16546 Pja2-202ENSMUST00000024889 4345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Sptan1P16546 Olfr517-202ENSMUST00000216500 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Sptan1P16546 Gm14548-201ENSMUST00000070639 2128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Sptan1P16546 Cdk5rap2-206ENSMUST00000144099 11847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Sptan1P16546 Fchsd2-201ENSMUST00000032931 4453 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Sptan1P16546 Soat1-207ENSMUST00000189661 8371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Sptan1P16546 Nox1-201ENSMUST00000033610 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Sptan1P16546 Exd1-203ENSMUST00000171024 5290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Sptan1P16546 Gm11853-201ENSMUST00000119687 1384 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
Sptan1P16546 Gm14070-201ENSMUST00000120773 428 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
Sptan1P16546 Gm11585-201ENSMUST00000120901 569 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
Sptan1P16546 1700123O12Rik-202ENSMUST00000141312 660 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Sptan1P16546 Gm16093-201ENSMUST00000141455 392 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Sptan1P16546 Gm11292-201ENSMUST00000146121 1153 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Sptan1P16546 Gm12227-201ENSMUST00000147847 563 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Sptan1P16546 Gm26323-201ENSMUST00000157743 175 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
Sptan1P16546 Gm6507-201ENSMUST00000159767 652 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Sptan1P16546 Gm19840-201ENSMUST00000169624 882 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
Sptan1P16546 Gm4141-201ENSMUST00000174364 921 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Sptan1P16546 Gm4201-201ENSMUST00000174775 921 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Sptan1P16546 Olr1-203ENSMUST00000182784 570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Sptan1P16546 Gm29289-201ENSMUST00000188358 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Sptan1P16546 Gm28266-201ENSMUST00000191410 439 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
Sptan1P16546 Csde1-206ENSMUST00000197488 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Sptan1P16546 Gm5110-201ENSMUST00000203122 1063 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
Sptan1P16546 Reg1-202ENSMUST00000204601 766 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Sptan1P16546 Gm18467-201ENSMUST00000208805 434 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
Sptan1P16546 Gm19256-201ENSMUST00000218550 231 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
Sptan1P16546 AC159205.2-201ENSMUST00000223759 816 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
Sptan1P16546 AC159205.7-201ENSMUST00000225988 692 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
Sptan1P16546 Gm2840-201ENSMUST00000048361 411 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
Sptan1P16546 Krtap26-1-201ENSMUST00000095934 973 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Sptan1P16546 Irgm1-201ENSMUST00000049519 2259 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Sptan1P16546 Heatr5a-201ENSMUST00000040583 7763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Sptan1P16546 March1-201ENSMUST00000039540 2733 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Sptan1P16546 Ugt1a6b-201ENSMUST00000113137 2249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Sptan1P16546 Olfr859-203ENSMUST00000217280 9596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Sptan1P16546 4933425L06Rik-201ENSMUST00000022232 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Sptan1P16546 Nlrc4-201ENSMUST00000052124 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Sptan1P16546 Synj2bp-203ENSMUST00000163402 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Sptan1P16546 Gm7982-202ENSMUST00000136313 1536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Sptan1P16546 Trim43c-202ENSMUST00000186363 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Sptan1P16546 Krr1-203ENSMUST00000163048 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Sptan1P16546 Ccdc170-202ENSMUST00000138112 3350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Sptan1P16546 Fam49a-202ENSMUST00000069066 9452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Sptan1P16546 Spag11b-202ENSMUST00000110767 1740 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Sptan1P16546 Pikfyve-201ENSMUST00000081154 11237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Sptan1P16546 Mapk9-204ENSMUST00000109178 1302 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Sptan1P16546 Igkv16-104-201ENSMUST00000103323 378 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Sptan1P16546 Gm23910-201ENSMUST00000104597 132 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Sptan1P16546 Odf2-204ENSMUST00000113756 3826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Sptan1P16546 Gm11256-201ENSMUST00000118109 829 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Sptan1P16546 Gm15503-201ENSMUST00000141541 449 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Sptan1P16546 Gm26970-201ENSMUST00000182990 964 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Sptan1P16546 Gm28952-201ENSMUST00000189285 681 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Sptan1P16546 Gm38226-201ENSMUST00000192207 521 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Sptan1P16546 Gm36793-201ENSMUST00000199211 922 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Sptan1P16546 Gm42813-201ENSMUST00000200057 615 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Sptan1P16546 Mrln-201ENSMUST00000020090 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Sptan1P16546 1700019F05Rik-201ENSMUST00000202487 533 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Sptan1P16546 Gm35037-201ENSMUST00000203144 506 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Sptan1P16546 Gm18943-201ENSMUST00000207357 1216 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Sptan1P16546 AC121788.1-201ENSMUST00000218514 1046 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Sptan1P16546 AC140930.1-201ENSMUST00000221889 389 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Sptan1P16546 Olfr161-201ENSMUST00000061541 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Sptan1P16546 Olfr114-201ENSMUST00000076914 1000 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Sptan1P16546 Gm28403-201ENSMUST00000188743 2710 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Sptan1P16546 1700074P13Rik-201ENSMUST00000031935 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.7 ms