Protein–RNA interactions for Protein: P07309

Ttr, Transthyretin, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtrP07309 Ssbp1-202ENSMUST00000114779 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
TtrP07309 Adgb-205ENSMUST00000179956 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
TtrP07309 Igkv4-80-201ENSMUST00000103341 348 ntAPPRIS P1 BASIC4.77□□□□□ -1.65
TtrP07309 Gm25498-201ENSMUST00000104424 129 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
TtrP07309 Serpina3a-202ENSMUST00000109965 1204 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
TtrP07309 Gm12242-201ENSMUST00000118824 738 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
TtrP07309 Prkd3-203ENSMUST00000118991 1265 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
TtrP07309 Gm13163-201ENSMUST00000119875 336 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
TtrP07309 Gm13525-201ENSMUST00000120607 478 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
TtrP07309 Gm11688-201ENSMUST00000122145 308 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
TtrP07309 Tmem216-203ENSMUST00000123788 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
TtrP07309 Gm15473-201ENSMUST00000140746 1179 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
TtrP07309 Gm23220-201ENSMUST00000158115 137 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
TtrP07309 Gm24735-201ENSMUST00000158859 118 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
TtrP07309 Dctd-205ENSMUST00000174278 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
TtrP07309 Gm8245-201ENSMUST00000182434 987 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
TtrP07309 Gm28100-201ENSMUST00000186560 582 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
TtrP07309 Gm29529-201ENSMUST00000187154 714 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
TtrP07309 Gm29175-201ENSMUST00000189500 402 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
TtrP07309 Gm553-201ENSMUST00000189527 701 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
TtrP07309 Gstp3-202ENSMUST00000189808 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
TtrP07309 Gm37825-201ENSMUST00000193141 904 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
TtrP07309 Gm37493-201ENSMUST00000193167 433 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
TtrP07309 Gm37560-201ENSMUST00000194289 1000 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
TtrP07309 Gm38305-201ENSMUST00000194825 223 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
TtrP07309 4930566N20Rik-201ENSMUST00000195173 1199 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
TtrP07309 Gm42707-202ENSMUST00000196668 618 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
TtrP07309 Gm45196-201ENSMUST00000206751 825 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
TtrP07309 Gm7394-201ENSMUST00000209138 1032 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
TtrP07309 Gm7392-201ENSMUST00000217815 345 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
TtrP07309 AC127224.1-201ENSMUST00000218094 453 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
TtrP07309 AC154834.1-201ENSMUST00000224697 358 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
TtrP07309 Gm21762-202ENSMUST00000225881 830 ntAPPRIS P1 BASIC4.77□□□□□ -1.65
TtrP07309 Clec4a2-201ENSMUST00000032248 1261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
TtrP07309 1700049L16Rik-201ENSMUST00000049520 543 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
TtrP07309 Olfr574-201ENSMUST00000052997 1041 ntAPPRIS P2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
TtrP07309 Tas2r105-201ENSMUST00000053652 964 ntAPPRIS P1 BASIC4.77□□□□□ -1.65
TtrP07309 Mir412-201ENSMUST00000083636 80 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
TtrP07309 Gm37086-201ENSMUST00000193082 3452 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
TtrP07309 Gm28874-201ENSMUST00000190917 3134 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
TtrP07309 Slc22a29-201ENSMUST00000113298 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
TtrP07309 Lgi1-209ENSMUST00000199812 2262 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
TtrP07309 1810018F18Rik-202ENSMUST00000189546 1447 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
TtrP07309 Gm20300-201ENSMUST00000214634 3440 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
TtrP07309 Olfr1247-202ENSMUST00000111532 6070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
TtrP07309 Kcnma1-209ENSMUST00000179097 4596 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
TtrP07309 Gm2080-201ENSMUST00000211299 1573 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
TtrP07309 D330045A20Rik-202ENSMUST00000113030 3736 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
TtrP07309 9330159M07Rik-201ENSMUST00000180712 2702 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
TtrP07309 Gm6614-202ENSMUST00000181628 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
TtrP07309 Gm21122-201ENSMUST00000191548 3452 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
TtrP07309 Gm44229-201ENSMUST00000203211 2487 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
TtrP07309 Gm37140-201ENSMUST00000192914 1684 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
TtrP07309 Mrpl1-201ENSMUST00000036437 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
TtrP07309 Ifi207-201ENSMUST00000042610 3422 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
TtrP07309 Olfr1301-202ENSMUST00000207590 4820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
TtrP07309 Enpp2-201ENSMUST00000041591 3095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
TtrP07309 Atf2-204ENSMUST00000112007 4195 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
TtrP07309 Vmn1r203-202ENSMUST00000227520 8227 ntAPPRIS P1 BASIC4.76□□□□□ -1.65
TtrP07309 Taf13-204ENSMUST00000143054 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
TtrP07309 Gria4-204ENSMUST00000212533 5207 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
TtrP07309 Angptl1-202ENSMUST00000111720 1332 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
TtrP07309 Poln-205ENSMUST00000202409 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
TtrP07309 Tnrc6a-201ENSMUST00000094053 8183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
TtrP07309 Ncr1-201ENSMUST00000006792 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
TtrP07309 Gla-201ENSMUST00000033621 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
TtrP07309 Gm17690-201ENSMUST00000180958 3467 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
TtrP07309 Nucb2-203ENSMUST00000183175 1913 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
TtrP07309 Rnd3-203ENSMUST00000154545 2967 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
TtrP07309 Olfr1321-202ENSMUST00000215373 4482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
TtrP07309 Olfr446-201ENSMUST00000101461 927 ntAPPRIS P1 BASIC4.76□□□□□ -1.65
TtrP07309 Gm25725-201ENSMUST00000104528 130 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
TtrP07309 Mrps23-202ENSMUST00000107915 332 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
TtrP07309 Smpx-203ENSMUST00000112521 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
TtrP07309 Lage3-202ENSMUST00000114152 746 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
TtrP07309 Gm7803-201ENSMUST00000117176 1015 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
TtrP07309 Gm14886-201ENSMUST00000117208 2629 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
TtrP07309 Gm13679-201ENSMUST00000118678 484 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
TtrP07309 Gm5387-201ENSMUST00000119776 857 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
TtrP07309 Gm12297-201ENSMUST00000121380 979 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
TtrP07309 Dnah2os-201ENSMUST00000124108 859 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
TtrP07309 4930594O21Rik-202ENSMUST00000144981 682 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
TtrP07309 4930403D09Rik-201ENSMUST00000147359 635 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
TtrP07309 Gm8893-201ENSMUST00000172146 1242 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
TtrP07309 Pkn2-210ENSMUST00000174422 2904 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
TtrP07309 Vmn1r-ps18-201ENSMUST00000176901 876 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
TtrP07309 Obox4-ps36-201ENSMUST00000177206 723 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
TtrP07309 Obox4-ps16-201ENSMUST00000177624 1137 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
TtrP07309 Obox4-ps17-201ENSMUST00000178341 1137 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
TtrP07309 Obox4-ps18-201ENSMUST00000179441 1137 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
TtrP07309 1700066B17Rik-202ENSMUST00000187091 675 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
TtrP07309 Ly6c2-204ENSMUST00000191451 538 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
TtrP07309 Gm37383-201ENSMUST00000191750 745 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
TtrP07309 Tdrkh-205ENSMUST00000197495 2476 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
TtrP07309 Gm43157-201ENSMUST00000198223 412 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
TtrP07309 Gm44418-201ENSMUST00000204219 705 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
TtrP07309 Gm44984-201ENSMUST00000207802 394 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
TtrP07309 Rps12-ps4-201ENSMUST00000208689 397 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
TtrP07309 Gm2767-201ENSMUST00000209582 473 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
TtrP07309 Gm45520-201ENSMUST00000210109 2031 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.2 ms