Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Perm1-201ENSMUST00000105572 3901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Col5a3Q9JLI2 Vmn2r85-201ENSMUST00000171811 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Col5a3Q9JLI2 Gatad2b-205ENSMUST00000199754 7438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Col5a3Q9JLI2 Tbpl2-201ENSMUST00000080453 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Col5a3Q9JLI2 Cdh9-201ENSMUST00000026432 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.28
Col5a3Q9JLI2 Ugt2a2-201ENSMUST00000079811 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.28
Col5a3Q9JLI2 Rdh11-203ENSMUST00000161204 3262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Col5a3Q9JLI2 Ankef1-210ENSMUST00000180246 2726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Col5a3Q9JLI2 Pik3ca-203ENSMUST00000108243 6689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Col5a3Q9JLI2 Gm38028-201ENSMUST00000193309 2169 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Col5a3Q9JLI2 AC125409.2-201ENSMUST00000221888 2158 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Col5a3Q9JLI2 Fam107a-203ENSMUST00000121887 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Col5a3Q9JLI2 Gm13872-202ENSMUST00000143995 1408 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Col5a3Q9JLI2 9330111N05Rik-201ENSMUST00000180409 1407 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Col5a3Q9JLI2 Gm5949-201ENSMUST00000213468 1421 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Col5a3Q9JLI2 Papolg-201ENSMUST00000020513 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Col5a3Q9JLI2 Gm15930-201ENSMUST00000156603 2037 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Col5a3Q9JLI2 Gm42653-201ENSMUST00000200644 2839 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Col5a3Q9JLI2 Ifi207-201ENSMUST00000042610 3422 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Col5a3Q9JLI2 Gm14743-201ENSMUST00000114026 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Col5a3Q9JLI2 Gm13626-201ENSMUST00000119435 402 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Col5a3Q9JLI2 Olfr405-ps1-201ENSMUST00000120649 936 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Col5a3Q9JLI2 Gm15527-202ENSMUST00000144094 770 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Col5a3Q9JLI2 Gm13179-202ENSMUST00000151994 978 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Col5a3Q9JLI2 Gm16269-201ENSMUST00000160532 409 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Col5a3Q9JLI2 Gm6918-201ENSMUST00000167622 1222 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Col5a3Q9JLI2 Gm6061-201ENSMUST00000175860 492 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Col5a3Q9JLI2 Naa60-210ENSMUST00000176224 501 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Col5a3Q9JLI2 Gm19560-201ENSMUST00000177510 514 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Col5a3Q9JLI2 Gm25244-201ENSMUST00000178089 132 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Col5a3Q9JLI2 Panct2-201ENSMUST00000181489 3849 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Col5a3Q9JLI2 AC133207.2-201ENSMUST00000218430 237 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Col5a3Q9JLI2 Gm18405-201ENSMUST00000220743 511 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Col5a3Q9JLI2 Ccdc54-201ENSMUST00000062439 1296 ntAPPRIS P1 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Col5a3Q9JLI2 Cacna1c-220ENSMUST00000189520 6570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Col5a3Q9JLI2 Gm28112-201ENSMUST00000190898 1875 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Col5a3Q9JLI2 Trim16-201ENSMUST00000055006 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Col5a3Q9JLI2 Pnpla8-202ENSMUST00000122902 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Col5a3Q9JLI2 Cyld-205ENSMUST00000209532 7990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Col5a3Q9JLI2 Gm12695-201ENSMUST00000107071 1904 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Col5a3Q9JLI2 Gm29198-201ENSMUST00000190102 1512 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Col5a3Q9JLI2 Tg-201ENSMUST00000065916 8454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Col5a3Q9JLI2 Gm8844-201ENSMUST00000119460 2614 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Col5a3Q9JLI2 Sh2d4b-201ENSMUST00000070328 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Col5a3Q9JLI2 Luzp4-201ENSMUST00000101185 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Col5a3Q9JLI2 Sis-201ENSMUST00000094190 5887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Col5a3Q9JLI2 Cacna1c-204ENSMUST00000112793 6669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Col5a3Q9JLI2 Peg13-201ENSMUST00000202826 4725 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Col5a3Q9JLI2 Adgrl4-201ENSMUST00000046977 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Col5a3Q9JLI2 Arhgap19-202ENSMUST00000163265 5058 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Col5a3Q9JLI2 Zfp451-202ENSMUST00000044455 11876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Col5a3Q9JLI2 AC151904.1-201ENSMUST00000219945 1498 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
Col5a3Q9JLI2 Wdfy3-205ENSMUST00000174598 10581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Col5a3Q9JLI2 Zzz3-202ENSMUST00000106100 7607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
Col5a3Q9JLI2 AC165260.6-205ENSMUST00000224190 9762 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Col5a3Q9JLI2 Gm13013-201ENSMUST00000119087 523 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Col5a3Q9JLI2 Olfr349-ps1-201ENSMUST00000121879 609 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Col5a3Q9JLI2 Gm12596-201ENSMUST00000124589 673 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Col5a3Q9JLI2 Gm12631-201ENSMUST00000130576 637 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
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Col5a3Q9JLI2 Gm5717-201ENSMUST00000198243 1062 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Col5a3Q9JLI2 Gm8930-201ENSMUST00000201693 768 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Col5a3Q9JLI2 Gm17918-201ENSMUST00000205315 574 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Col5a3Q9JLI2 Gm45514-201ENSMUST00000211531 689 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Col5a3Q9JLI2 AC163743.1-201ENSMUST00000224309 270 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Col5a3Q9JLI2 Olfr734-201ENSMUST00000050928 1033 ntAPPRIS P1 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Col5a3Q9JLI2 Olfr1354-201ENSMUST00000075859 1095 ntAPPRIS P1 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Col5a3Q9JLI2 Phf6-202ENSMUST00000101587 3639 ntTSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Col5a3Q9JLI2 Thada-201ENSMUST00000047524 7884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
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Col5a3Q9JLI2 Cdh3-201ENSMUST00000080797 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Col5a3Q9JLI2 Pum1-204ENSMUST00000105991 4614 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Col5a3Q9JLI2 Gm10687-201ENSMUST00000180670 3233 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Col5a3Q9JLI2 Gria1-202ENSMUST00000094179 5399 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Col5a3Q9JLI2 Nup214-201ENSMUST00000065398 6605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Col5a3Q9JLI2 Scn2b-201ENSMUST00000093855 3958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Col5a3Q9JLI2 Ccdc146-202ENSMUST00000115245 3389 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Col5a3Q9JLI2 Mir124a-1hg-201ENSMUST00000180610 4103 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Col5a3Q9JLI2 Cfhr2-201ENSMUST00000094489 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Col5a3Q9JLI2 Depdc5-202ENSMUST00000087897 8216 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Col5a3Q9JLI2 Nsun4-202ENSMUST00000030475 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Col5a3Q9JLI2 4933411E08Rik-201ENSMUST00000217950 1689 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Col5a3Q9JLI2 Col12a1-202ENSMUST00000121227 9953 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Col5a3Q9JLI2 Gm44626-201ENSMUST00000207035 2715 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Col5a3Q9JLI2 Senp7-203ENSMUST00000089362 4825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Col5a3Q9JLI2 Ctnnd1-207ENSMUST00000111676 5852 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Col5a3Q9JLI2 Pkd1l3-201ENSMUST00000057344 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Col5a3Q9JLI2 D630023O14Rik-201ENSMUST00000191913 3099 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Col5a3Q9JLI2 Gm10862-201ENSMUST00000193956 3350 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Col5a3Q9JLI2 Gm14762-201ENSMUST00000105109 1771 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Col5a3Q9JLI2 Gm38335-201ENSMUST00000195727 1789 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Col5a3Q9JLI2 Lipn-201ENSMUST00000025682 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Col5a3Q9JLI2 Olfr1320-203ENSMUST00000214375 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Col5a3Q9JLI2 4930402F06Rik-201ENSMUST00000113009 1150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Col5a3Q9JLI2 Taf7l-202ENSMUST00000113223 1155 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Col5a3Q9JLI2 Gm11198-201ENSMUST00000119771 974 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Col5a3Q9JLI2 Gm22917-201ENSMUST00000180116 110 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Col5a3Q9JLI2 4930590H14Rik-201ENSMUST00000193999 551 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Col5a3Q9JLI2 Gm43945-201ENSMUST00000203595 754 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Col5a3Q9JLI2 Gm45026-201ENSMUST00000205292 833 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
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