Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJZ8

Cnga3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga3Q9JJZ8 Nat8f2-201ENSMUST00000045008 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Cnga3Q9JJZ8 AC156636.1-201ENSMUST00000218639 2229 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Cnga3Q9JJZ8 Gm17491-201ENSMUST00000180411 2311 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Cnga3Q9JJZ8 Rdh11-203ENSMUST00000161204 3262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Cnga3Q9JJZ8 Angptl1-202ENSMUST00000111720 1332 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.24
Cnga3Q9JJZ8 Gm8177-201ENSMUST00000181591 1336 ntBASIC7.27□□□□□ -1.24
Cnga3Q9JJZ8 Il5ra-203ENSMUST00000205004 2271 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.24
Cnga3Q9JJZ8 Fbln5-203ENSMUST00000222587 2371 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.24
Cnga3Q9JJZ8 AC192333.5-201ENSMUST00000224620 2350 ntBASIC7.27□□□□□ -1.24
Cnga3Q9JJZ8 Vmn2r105-201ENSMUST00000167382 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Cnga3Q9JJZ8 Gdap1-201ENSMUST00000026879 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Cnga3Q9JJZ8 Add3-203ENSMUST00000111741 4520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Cnga3Q9JJZ8 Ccdc175-201ENSMUST00000021494 2622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Cnga3Q9JJZ8 AC159002.2-201ENSMUST00000228843 4874 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Cnga3Q9JJZ8 Shprh-202ENSMUST00000054814 7225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Cnga3Q9JJZ8 Brox-202ENSMUST00000163528 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Cnga3Q9JJZ8 Gm25760-201ENSMUST00000103989 132 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Cnga3Q9JJZ8 Gm25877-201ENSMUST00000104326 129 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Cnga3Q9JJZ8 Rps12-ps7-201ENSMUST00000117169 385 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Cnga3Q9JJZ8 Gm12135-201ENSMUST00000119170 466 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Cnga3Q9JJZ8 Gm14489-201ENSMUST00000120868 901 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Cnga3Q9JJZ8 Gm13837-201ENSMUST00000126326 337 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Cnga3Q9JJZ8 Gm11697-201ENSMUST00000149226 525 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Cnga3Q9JJZ8 Gm23031-201ENSMUST00000157998 119 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Cnga3Q9JJZ8 1700120O09Rik-201ENSMUST00000177127 977 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Cnga3Q9JJZ8 Gm20738-201ENSMUST00000177666 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Cnga3Q9JJZ8 Gm20823-201ENSMUST00000179949 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Cnga3Q9JJZ8 Gm20865-202ENSMUST00000181163 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Cnga3Q9JJZ8 Gm21868-201ENSMUST00000185623 1230 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Cnga3Q9JJZ8 Gm29049-201ENSMUST00000185705 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Cnga3Q9JJZ8 Gm20924-202ENSMUST00000186910 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Cnga3Q9JJZ8 Gm20816-202ENSMUST00000187846 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Cnga3Q9JJZ8 Gm20809-202ENSMUST00000187943 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Cnga3Q9JJZ8 Gm21728-201ENSMUST00000188442 695 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Cnga3Q9JJZ8 Gm21889-201ENSMUST00000188487 695 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Cnga3Q9JJZ8 Gm20932-201ENSMUST00000189115 694 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Cnga3Q9JJZ8 Gm21721-202ENSMUST00000189253 1225 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Cnga3Q9JJZ8 Gm21920-201ENSMUST00000190042 695 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Cnga3Q9JJZ8 Gm28171-201ENSMUST00000190100 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Cnga3Q9JJZ8 Gm20803-202ENSMUST00000190968 1230 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Cnga3Q9JJZ8 Gm20867-202ENSMUST00000190987 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Cnga3Q9JJZ8 Gm37493-201ENSMUST00000193167 433 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Cnga3Q9JJZ8 Gm7019-201ENSMUST00000194122 369 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Cnga3Q9JJZ8 Gm43849-201ENSMUST00000201086 215 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Cnga3Q9JJZ8 AC154248.1-201ENSMUST00000222072 495 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Cnga3Q9JJZ8 Gm6575-201ENSMUST00000222946 697 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Cnga3Q9JJZ8 CT009711.2-201ENSMUST00000225352 934 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Cnga3Q9JJZ8 AC156016.2-201ENSMUST00000228200 525 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Cnga3Q9JJZ8 Klre1-201ENSMUST00000053708 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Cnga3Q9JJZ8 Gm2531-201ENSMUST00000075609 512 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Cnga3Q9JJZ8 n-R5s97-201ENSMUST00000082585 113 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Cnga3Q9JJZ8 n-R5s95-201ENSMUST00000082684 118 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Cnga3Q9JJZ8 Mir7b-201ENSMUST00000083557 111 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Cnga3Q9JJZ8 E330034G19Rik-204ENSMUST00000162224 1350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Cnga3Q9JJZ8 Gm37090-201ENSMUST00000195694 4105 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Cnga3Q9JJZ8 Gm39465-201ENSMUST00000213810 9813 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Cnga3Q9JJZ8 4930432O09Rik-201ENSMUST00000219710 1986 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Cnga3Q9JJZ8 Mbd5-202ENSMUST00000112745 6037 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Cnga3Q9JJZ8 Vmn2r118-201ENSMUST00000168440 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Cnga3Q9JJZ8 Gm9752-201ENSMUST00000048965 2659 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Cnga3Q9JJZ8 Gm21663-201ENSMUST00000196214 2864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Cnga3Q9JJZ8 Ddx24-201ENSMUST00000044923 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Cnga3Q9JJZ8 Gm35850-201ENSMUST00000210956 4653 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Cnga3Q9JJZ8 Vmn1r184-205ENSMUST00000227790 4334 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Cnga3Q9JJZ8 Wdr64-203ENSMUST00000194087 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Cnga3Q9JJZ8 Matr3-215ENSMUST00000190121 2638 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Cnga3Q9JJZ8 5830416I19Rik-201ENSMUST00000198687 2627 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Cnga3Q9JJZ8 Tshr-204ENSMUST00000221216 1638 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Cnga3Q9JJZ8 AC144772.2-201ENSMUST00000228830 2859 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Cnga3Q9JJZ8 Gk-206ENSMUST00000142152 4229 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Cnga3Q9JJZ8 5430421F17Rik-202ENSMUST00000210268 2295 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Cnga3Q9JJZ8 Fam107a-203ENSMUST00000121887 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Cnga3Q9JJZ8 Adam28-202ENSMUST00000111072 3025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Cnga3Q9JJZ8 Eya4-202ENSMUST00000092665 5304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Cnga3Q9JJZ8 Olfr1555-ps1-202ENSMUST00000219261 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Cnga3Q9JJZ8 Gm15789-201ENSMUST00000118992 1359 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Cnga3Q9JJZ8 Gm14896-201ENSMUST00000121311 1351 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Cnga3Q9JJZ8 E330018M18Rik-201ENSMUST00000209455 1383 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Cnga3Q9JJZ8 Bbx-203ENSMUST00000089404 4024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Cnga3Q9JJZ8 Gm16073-201ENSMUST00000116032 517 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Cnga3Q9JJZ8 Gm14550-201ENSMUST00000117918 407 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Cnga3Q9JJZ8 Smim24-202ENSMUST00000118206 949 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Cnga3Q9JJZ8 Olfr1063-ps1-201ENSMUST00000118807 942 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Cnga3Q9JJZ8 Gm5601-201ENSMUST00000118909 972 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Cnga3Q9JJZ8 Tex35-203ENSMUST00000119526 679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Cnga3Q9JJZ8 Gm14863-201ENSMUST00000119648 307 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Cnga3Q9JJZ8 Gm14531-201ENSMUST00000120845 285 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Cnga3Q9JJZ8 Gm12540-201ENSMUST00000121938 319 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Cnga3Q9JJZ8 Gm12531-201ENSMUST00000126099 487 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Cnga3Q9JJZ8 1700027A07Rik-201ENSMUST00000150472 458 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Cnga3Q9JJZ8 C230035I16Rik-202ENSMUST00000153753 643 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Cnga3Q9JJZ8 Gm8922-201ENSMUST00000170057 1167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Cnga3Q9JJZ8 Vmn2r-ps131-201ENSMUST00000176094 1046 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Cnga3Q9JJZ8 Gm26671-201ENSMUST00000180423 1157 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Cnga3Q9JJZ8 Gm17895-201ENSMUST00000194028 874 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Cnga3Q9JJZ8 4930412E21Rik-201ENSMUST00000194267 778 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Cnga3Q9JJZ8 Igkv4-83-201ENSMUST00000196933 334 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Cnga3Q9JJZ8 Gm8190-201ENSMUST00000199603 586 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Cnga3Q9JJZ8 Gm44386-201ENSMUST00000204288 429 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Cnga3Q9JJZ8 Gm44279-201ENSMUST00000205154 472 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.7 ms