Protein–RNA interactions for Protein: Q99PQ1

Trim12a, Tripartite motif-containing protein 12A, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim12aQ99PQ1 Gm43124-201ENSMUST00000201878 278 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Trim12aQ99PQ1 Pip-202ENSMUST00000203244 736 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Trim12aQ99PQ1 Olfr793-ps1-201ENSMUST00000205161 895 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Trim12aQ99PQ1 Gm45072-201ENSMUST00000208673 929 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Trim12aQ99PQ1 Gm30694-201ENSMUST00000209278 1230 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Trim12aQ99PQ1 Gm2221-201ENSMUST00000209342 418 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Trim12aQ99PQ1 Olfr967-202ENSMUST00000213358 1210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Trim12aQ99PQ1 Gm26797-203ENSMUST00000216452 706 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Trim12aQ99PQ1 4930555G07Rik-201ENSMUST00000218226 634 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Trim12aQ99PQ1 Gm35188-201ENSMUST00000218869 535 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Trim12aQ99PQ1 Gm46231-201ENSMUST00000220152 314 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Trim12aQ99PQ1 AC174082.2-201ENSMUST00000222094 543 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Trim12aQ99PQ1 Gm17872-201ENSMUST00000222550 532 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Trim12aQ99PQ1 9230112D13Rik-201ENSMUST00000022325 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Trim12aQ99PQ1 Fsip1-201ENSMUST00000028820 1025 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Trim12aQ99PQ1 Gm2840-201ENSMUST00000048361 411 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Trim12aQ99PQ1 Vmn1r195-201ENSMUST00000091736 1088 ntAPPRIS P1 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Trim12aQ99PQ1 Faddos-201ENSMUST00000097928 1053 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Trim12aQ99PQ1 Pus3-202ENSMUST00000121246 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Trim12aQ99PQ1 Vmn2r10-201ENSMUST00000079163 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Trim12aQ99PQ1 Dsg1b-201ENSMUST00000076737 3965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Trim12aQ99PQ1 Tcf7l2-213ENSMUST00000111662 3715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Trim12aQ99PQ1 Zbtb14-202ENSMUST00000112674 3743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
Trim12aQ99PQ1 AC138284.1-201ENSMUST00000214258 3236 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Trim12aQ99PQ1 2810021J22Rik-201ENSMUST00000073924 3866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Trim12aQ99PQ1 Sntg1-210ENSMUST00000191683 4510 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.28
Trim12aQ99PQ1 Vamp4-207ENSMUST00000155003 1428 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.28
Trim12aQ99PQ1 Haus2-202ENSMUST00000110706 3055 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.28
Trim12aQ99PQ1 Cdh2-202ENSMUST00000115850 3785 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.28
Trim12aQ99PQ1 CT010470.1-201ENSMUST00000225364 1876 ntBASIC7.09□□□□□ -1.28
Trim12aQ99PQ1 Cphx1-204ENSMUST00000184016 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.28
Trim12aQ99PQ1 Nudt12-201ENSMUST00000025065 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Trim12aQ99PQ1 Zfp941-202ENSMUST00000106052 3851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Trim12aQ99PQ1 CT009604.1-201ENSMUST00000223900 1328 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Trim12aQ99PQ1 Mbd4-202ENSMUST00000122816 2415 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Trim12aQ99PQ1 Rpp40-201ENSMUST00000171686 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Trim12aQ99PQ1 Zc3h11a-204ENSMUST00000191896 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Trim12aQ99PQ1 Gm37945-201ENSMUST00000192536 4367 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Trim12aQ99PQ1 Olfr615-203ENSMUST00000215673 3469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Trim12aQ99PQ1 Dcun1d4-202ENSMUST00000087181 4117 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Trim12aQ99PQ1 Ccl9-201ENSMUST00000019266 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Trim12aQ99PQ1 Lrtm1-201ENSMUST00000055662 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
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Trim12aQ99PQ1 Gm23768-201ENSMUST00000104440 131 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Trim12aQ99PQ1 Gm14212-201ENSMUST00000122023 826 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Trim12aQ99PQ1 0610043K17Rik-201ENSMUST00000123107 614 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Trim12aQ99PQ1 Prlr-204ENSMUST00000128450 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Trim12aQ99PQ1 Gm15551-201ENSMUST00000132762 535 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Trim12aQ99PQ1 Mhrt-202ENSMUST00000185798 447 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Trim12aQ99PQ1 Ly6e-206ENSMUST00000187284 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Trim12aQ99PQ1 Gm7867-201ENSMUST00000189856 546 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Trim12aQ99PQ1 Gm37322-201ENSMUST00000193409 337 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Trim12aQ99PQ1 Gm43656-201ENSMUST00000197882 434 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Trim12aQ99PQ1 Gm17822-201ENSMUST00000204307 351 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Trim12aQ99PQ1 Ghrl-207ENSMUST00000204533 323 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
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Trim12aQ99PQ1 A930002H02Rik-201ENSMUST00000208672 1178 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Trim12aQ99PQ1 Agr2-201ENSMUST00000020898 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
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Trim12aQ99PQ1 Gm45301-201ENSMUST00000211359 933 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
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Trim12aQ99PQ1 Gm36278-201ENSMUST00000217030 918 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Trim12aQ99PQ1 9130015A21Rik-202ENSMUST00000222153 837 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
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Trim12aQ99PQ1 A730017C20Rik-201ENSMUST00000058633 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Trim12aQ99PQ1 Enpp6-201ENSMUST00000039840 4970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Trim12aQ99PQ1 Mpdz-202ENSMUST00000107258 7241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Trim12aQ99PQ1 Pik3ca-202ENSMUST00000108242 6171 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
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Trim12aQ99PQ1 Gm16523-202ENSMUST00000203640 4750 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Trim12aQ99PQ1 Zfp599-201ENSMUST00000086281 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Trim12aQ99PQ1 Zfp2-201ENSMUST00000109128 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Trim12aQ99PQ1 Acsm2-207ENSMUST00000167935 6738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Trim12aQ99PQ1 Pramel-201ENSMUST00000118979 1383 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Trim12aQ99PQ1 Olfr1226-205ENSMUST00000216445 7046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Trim12aQ99PQ1 Olfr338-201ENSMUST00000072114 5780 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Trim12aQ99PQ1 Gm26691-201ENSMUST00000180471 4401 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Trim12aQ99PQ1 Slc22a6-201ENSMUST00000010250 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Trim12aQ99PQ1 Gsdme-202ENSMUST00000101405 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Trim12aQ99PQ1 Cpne3-201ENSMUST00000029885 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Trim12aQ99PQ1 Anks4b-201ENSMUST00000033201 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Trim12aQ99PQ1 Olfr1275-203ENSMUST00000217539 1661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Trim12aQ99PQ1 Pcsk1-201ENSMUST00000022075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Trim12aQ99PQ1 Irgm2-203ENSMUST00000209079 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Trim12aQ99PQ1 Myot-201ENSMUST00000025349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Trim12aQ99PQ1 Olfr1555-ps1-201ENSMUST00000207679 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
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