Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Z2

Prpf39, Pre-mRNA-processing factor 39, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf39Q8K2Z2 Wnk1-218ENSMUST00000161512 1426 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Prpf39Q8K2Z2 Gm43557-201ENSMUST00000197100 2370 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Prpf39Q8K2Z2 Gm43421-201ENSMUST00000200044 2905 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Prpf39Q8K2Z2 Gm8113-201ENSMUST00000160298 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Prpf39Q8K2Z2 Ccdc175-201ENSMUST00000021494 2622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Prpf39Q8K2Z2 Acsm2-207ENSMUST00000167935 6738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Prpf39Q8K2Z2 Grik2-207ENSMUST00000218823 9427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Prpf39Q8K2Z2 Phf6-202ENSMUST00000101587 3639 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
Prpf39Q8K2Z2 Gm20121-201ENSMUST00000198547 1594 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Prpf39Q8K2Z2 Scn9a-203ENSMUST00000112354 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Prpf39Q8K2Z2 Spam1-203ENSMUST00000202569 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Prpf39Q8K2Z2 Stat4-202ENSMUST00000168302 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Prpf39Q8K2Z2 Gm44194-201ENSMUST00000204222 3229 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Prpf39Q8K2Z2 Olfr3-202ENSMUST00000213988 2018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Prpf39Q8K2Z2 B130024G19Rik-203ENSMUST00000190320 5451 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Prpf39Q8K2Z2 AC139941.2-201ENSMUST00000221565 1824 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Prpf39Q8K2Z2 Gm22256-201ENSMUST00000102291 107 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Prpf39Q8K2Z2 Gm23748-201ENSMUST00000104227 131 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Prpf39Q8K2Z2 Gm13141-201ENSMUST00000117417 456 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Prpf39Q8K2Z2 Olfr1063-ps1-201ENSMUST00000118807 942 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Prpf39Q8K2Z2 Gm13222-201ENSMUST00000119638 138 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Prpf39Q8K2Z2 Gm15311-201ENSMUST00000119682 282 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Prpf39Q8K2Z2 Gm15305-201ENSMUST00000120354 288 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Prpf39Q8K2Z2 Gm11820-201ENSMUST00000139614 664 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
Prpf39Q8K2Z2 Gm14764-201ENSMUST00000147130 313 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Prpf39Q8K2Z2 Mup8-202ENSMUST00000163931 986 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Prpf39Q8K2Z2 Ulbp1-201ENSMUST00000169796 1093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Prpf39Q8K2Z2 Gm23810-201ENSMUST00000175150 74 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Prpf39Q8K2Z2 Vmn2r-ps131-201ENSMUST00000176094 1046 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Prpf39Q8K2Z2 Gm20615-201ENSMUST00000177503 705 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Prpf39Q8K2Z2 Gm20738-201ENSMUST00000177666 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Prpf39Q8K2Z2 Gm20823-201ENSMUST00000179949 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Prpf39Q8K2Z2 Gm20865-202ENSMUST00000181163 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Prpf39Q8K2Z2 Mir7033-201ENSMUST00000184259 81 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Prpf39Q8K2Z2 Gm21868-201ENSMUST00000185623 1230 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Prpf39Q8K2Z2 Gm29049-201ENSMUST00000185705 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Prpf39Q8K2Z2 Gm20924-202ENSMUST00000186910 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Prpf39Q8K2Z2 1810041H14Rik-203ENSMUST00000187773 416 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Prpf39Q8K2Z2 Gm20816-202ENSMUST00000187846 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Prpf39Q8K2Z2 Gm20809-202ENSMUST00000187943 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Prpf39Q8K2Z2 Ly6a-204ENSMUST00000187994 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Prpf39Q8K2Z2 Gm21728-201ENSMUST00000188442 695 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Prpf39Q8K2Z2 Gm28117-201ENSMUST00000188472 371 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Prpf39Q8K2Z2 Gm21889-201ENSMUST00000188487 695 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Prpf39Q8K2Z2 Gm20932-201ENSMUST00000189115 694 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Prpf39Q8K2Z2 Gm21721-202ENSMUST00000189253 1225 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
Prpf39Q8K2Z2 Gm21920-201ENSMUST00000190042 695 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Prpf39Q8K2Z2 Gm28171-201ENSMUST00000190100 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Prpf39Q8K2Z2 Gm29141-201ENSMUST00000190357 882 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Prpf39Q8K2Z2 Gm20803-202ENSMUST00000190968 1230 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Prpf39Q8K2Z2 Gm20867-202ENSMUST00000190987 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Prpf39Q8K2Z2 4930533L02Rik-201ENSMUST00000194425 1160 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Prpf39Q8K2Z2 Gm7270-201ENSMUST00000195818 1128 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Prpf39Q8K2Z2 Gm42543-201ENSMUST00000198756 353 ntAPPRIS P1 BASIC7□□□□□ -1.29
Prpf39Q8K2Z2 Gm31812-201ENSMUST00000210323 1170 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
Prpf39Q8K2Z2 Gm45307-201ENSMUST00000211122 751 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
Prpf39Q8K2Z2 Gm45732-201ENSMUST00000212460 586 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Prpf39Q8K2Z2 AC102582.2-201ENSMUST00000214658 1137 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Prpf39Q8K2Z2 Gm17849-201ENSMUST00000219788 853 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Prpf39Q8K2Z2 CT009718.2-202ENSMUST00000222092 704 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
Prpf39Q8K2Z2 AC154816.1-201ENSMUST00000222688 634 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
Prpf39Q8K2Z2 CT009495.1-201ENSMUST00000224221 862 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Prpf39Q8K2Z2 AC161275.1-201ENSMUST00000224668 208 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Prpf39Q8K2Z2 AC091237.1-201ENSMUST00000224911 637 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Prpf39Q8K2Z2 AC138329.1-201ENSMUST00000225040 471 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Prpf39Q8K2Z2 Gm6887-201ENSMUST00000080945 482 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Prpf39Q8K2Z2 Gm43189-201ENSMUST00000196040 3069 ntBASIC7□□□□□ -1.29
Prpf39Q8K2Z2 Nck1-201ENSMUST00000112874 1513 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Prpf39Q8K2Z2 Gabrb2-205ENSMUST00000192403 1539 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Prpf39Q8K2Z2 Ralgapa2-205ENSMUST00000131824 5624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Prpf39Q8K2Z2 Adgrl2-215ENSMUST00000199750 4399 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Prpf39Q8K2Z2 Gm45949-201ENSMUST00000221550 1895 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Prpf39Q8K2Z2 Mettl6-201ENSMUST00000055303 3946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Prpf39Q8K2Z2 Ankrd66-201ENSMUST00000178772 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
Prpf39Q8K2Z2 Smurf2-206ENSMUST00000167787 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Prpf39Q8K2Z2 Otub2-205ENSMUST00000179684 2890 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Prpf39Q8K2Z2 Nckap5-204ENSMUST00000112583 7212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Prpf39Q8K2Z2 Gm13219-203ENSMUST00000154223 1843 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Prpf39Q8K2Z2 Gm12800-201ENSMUST00000075999 1455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Prpf39Q8K2Z2 Fbxw19-201ENSMUST00000076617 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Prpf39Q8K2Z2 Olfr190-203ENSMUST00000216495 8240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Prpf39Q8K2Z2 Vmn1r181-204ENSMUST00000227637 4587 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Prpf39Q8K2Z2 Ttc12-201ENSMUST00000055096 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Prpf39Q8K2Z2 Ctnna2-206ENSMUST00000162273 3277 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Prpf39Q8K2Z2 Gm10735-201ENSMUST00000099162 2943 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Prpf39Q8K2Z2 Scn8a-205ENSMUST00000108910 11232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Prpf39Q8K2Z2 Gm9573-201ENSMUST00000164502 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Prpf39Q8K2Z2 Gm43395-201ENSMUST00000198717 2240 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Prpf39Q8K2Z2 Krt222-202ENSMUST00000103132 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Prpf39Q8K2Z2 Gm30329-201ENSMUST00000211572 3077 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Prpf39Q8K2Z2 Slc38a6-208ENSMUST00000153941 3927 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Prpf39Q8K2Z2 Igkv12-44-201ENSMUST00000103367 401 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Prpf39Q8K2Z2 Snord88a-201ENSMUST00000116723 90 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Prpf39Q8K2Z2 Gm14158-201ENSMUST00000118409 308 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Prpf39Q8K2Z2 Gm15007-201ENSMUST00000119982 710 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Prpf39Q8K2Z2 Gm2200-201ENSMUST00000124814 764 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Prpf39Q8K2Z2 Gm2117-201ENSMUST00000130478 764 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Prpf39Q8K2Z2 Gm2101-202ENSMUST00000131997 764 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Prpf39Q8K2Z2 Gm13746-201ENSMUST00000133981 605 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Prpf39Q8K2Z2 Gm2165-203ENSMUST00000137981 764 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
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