Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGG7

Ubash3b, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein B, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubash3bQ8BGG7 Gm15241-201ENSMUST00000125700 474 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ubash3bQ8BGG7 Banf2os-202ENSMUST00000145504 386 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ubash3bQ8BGG7 Platr14-205ENSMUST00000146553 770 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ubash3bQ8BGG7 Tmem132cos-202ENSMUST00000154361 699 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ubash3bQ8BGG7 Obox4-ps38-201ENSMUST00000175961 724 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Ubash3bQ8BGG7 Gm5473-201ENSMUST00000179326 642 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Ubash3bQ8BGG7 4930556G22Rik-201ENSMUST00000185689 741 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ubash3bQ8BGG7 Gm18970-201ENSMUST00000186040 938 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Ubash3bQ8BGG7 Gm29356-201ENSMUST00000186935 373 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Ubash3bQ8BGG7 Arhgap26-218ENSMUST00000187912 312 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ubash3bQ8BGG7 Gm29439-201ENSMUST00000189996 509 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ubash3bQ8BGG7 Gm28803-201ENSMUST00000190385 764 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Ubash3bQ8BGG7 Gm17953-201ENSMUST00000192061 667 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Ubash3bQ8BGG7 Gm38289-201ENSMUST00000194273 597 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ubash3bQ8BGG7 Gm37371-201ENSMUST00000194837 392 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Ubash3bQ8BGG7 Gm37871-201ENSMUST00000194973 688 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Ubash3bQ8BGG7 Gm42952-206ENSMUST00000199324 506 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ubash3bQ8BGG7 4933439J24Rik-201ENSMUST00000200866 853 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Ubash3bQ8BGG7 Bc1-ps1-201ENSMUST00000208471 318 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Ubash3bQ8BGG7 Gm5338-201ENSMUST00000209530 639 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Ubash3bQ8BGG7 AC153729.3-201ENSMUST00000213319 781 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ubash3bQ8BGG7 Gm4800-201ENSMUST00000215776 1266 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Ubash3bQ8BGG7 Gm11427-204ENSMUST00000216233 999 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ubash3bQ8BGG7 Gm6477-201ENSMUST00000217098 764 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Ubash3bQ8BGG7 AC154904.1-201ENSMUST00000219510 312 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Ubash3bQ8BGG7 AC154851.1-201ENSMUST00000221591 655 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Ubash3bQ8BGG7 CT572983.1-201ENSMUST00000226895 514 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Ubash3bQ8BGG7 AC152394.2-202ENSMUST00000228503 1064 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Ubash3bQ8BGG7 Smr3a-201ENSMUST00000031211 635 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ubash3bQ8BGG7 Mlip-201ENSMUST00000034910 1227 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ubash3bQ8BGG7 Olfr729-201ENSMUST00000061020 972 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ubash3bQ8BGG7 Olfr1356-201ENSMUST00000061289 963 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ubash3bQ8BGG7 Olfr1451-201ENSMUST00000063144 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ubash3bQ8BGG7 Ube2d4-201ENSMUST00000075109 406 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ubash3bQ8BGG7 Zfp781-201ENSMUST00000076281 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ubash3bQ8BGG7 Olfr798-201ENSMUST00000079810 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ubash3bQ8BGG7 Gm25739-201ENSMUST00000082886 107 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Ubash3bQ8BGG7 Zfp438-201ENSMUST00000063989 3209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ubash3bQ8BGG7 Apobec1-202ENSMUST00000112586 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ubash3bQ8BGG7 Gm16233-201ENSMUST00000136170 1623 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ubash3bQ8BGG7 Zbtb38-201ENSMUST00000093798 4091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ubash3bQ8BGG7 AC135083.2-201ENSMUST00000228599 1456 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Ubash3bQ8BGG7 Gm10623-201ENSMUST00000209081 2639 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Ubash3bQ8BGG7 Luzp1-201ENSMUST00000001116 7246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ubash3bQ8BGG7 Dsc3-203ENSMUST00000225110 3123 ntAPPRIS P2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ubash3bQ8BGG7 Ktn1-210ENSMUST00000187839 7945 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ubash3bQ8BGG7 Clcn7-204ENSMUST00000160961 3983 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ubash3bQ8BGG7 Fcgr3-201ENSMUST00000164044 1347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ubash3bQ8BGG7 Med12-203ENSMUST00000117203 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ubash3bQ8BGG7 Smc1b-201ENSMUST00000023068 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Ubash3bQ8BGG7 Gm21043-201ENSMUST00000199316 1517 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Ubash3bQ8BGG7 Dmd-202ENSMUST00000113992 1858 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Ubash3bQ8BGG7 Ceacam15-201ENSMUST00000108498 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Ubash3bQ8BGG7 D030068K23Rik-204ENSMUST00000212085 1351 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Ubash3bQ8BGG7 AC154681.1-201ENSMUST00000225876 1735 ntBASIC7.21□□□□□ -1.25
Ubash3bQ8BGG7 Pomk-201ENSMUST00000061850 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Ubash3bQ8BGG7 Kcnb2-202ENSMUST00000175681 3963 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
Ubash3bQ8BGG7 Klrb1c-201ENSMUST00000167691 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Ubash3bQ8BGG7 Kcnmb2-204ENSMUST00000191869 1552 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
Ubash3bQ8BGG7 Olfr510-204ENSMUST00000217170 2997 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
Ubash3bQ8BGG7 Adgrl2-205ENSMUST00000196526 5615 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
Ubash3bQ8BGG7 Gm28497-201ENSMUST00000189646 3029 ntBASIC7.21□□□□□ -1.25
Ubash3bQ8BGG7 Tex52-202ENSMUST00000130785 1424 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Ubash3bQ8BGG7 Vps13a-201ENSMUST00000068156 10838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 Dock9-208ENSMUST00000212376 8107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 Gm45406-201ENSMUST00000210161 1637 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 Gm16409-201ENSMUST00000100510 747 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 Eaf2-203ENSMUST00000114825 668 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 Clec4a3-202ENSMUST00000117173 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 Rhox11-ps2-201ENSMUST00000117962 451 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 Mgst1-202ENSMUST00000118091 1030 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 Rps6-ps4-201ENSMUST00000118499 750 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 Mgst1-203ENSMUST00000120230 1027 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 Gm9143-201ENSMUST00000120745 745 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 Gm8172-201ENSMUST00000120762 750 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 Gm14411-201ENSMUST00000121798 914 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 Gm25052-201ENSMUST00000122661 158 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 St8sia3os-203ENSMUST00000127716 667 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 4930599N23Rik-201ENSMUST00000146981 880 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 Gm12031-201ENSMUST00000156150 627 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 Gm23663-201ENSMUST00000158045 80 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 Vmn1r170-201ENSMUST00000170166 915 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 Gm21293-201ENSMUST00000170919 864 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 Gm4252-201ENSMUST00000174823 313 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 Gm29413-201ENSMUST00000186019 880 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 4933400F21Rik-201ENSMUST00000186098 1007 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 Gm28870-201ENSMUST00000187033 880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 Gm20832-201ENSMUST00000189076 665 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 AV026068-209ENSMUST00000189143 517 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 Gm30638-201ENSMUST00000195570 656 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 Gm36728-201ENSMUST00000195782 665 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 Gm42625-201ENSMUST00000198611 922 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 Gm19764-201ENSMUST00000203630 649 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 4930557K07Rik-201ENSMUST00000205110 363 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 Olfr1422-ps1-201ENSMUST00000208076 743 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 Gm38843-201ENSMUST00000209189 323 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 Gm45454-201ENSMUST00000211484 455 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 Gm36485-201ENSMUST00000214286 464 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 AC133948.1-201ENSMUST00000214867 599 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Ubash3bQ8BGG7 AC153561.1-201ENSMUST00000215943 469 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.8 ms