Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9L4

Usp49, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 49, mousemouse

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Length 685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp49Q6P9L4 Mir7b-201ENSMUST00000083557 111 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Usp49Q6P9L4 March1-208ENSMUST00000110259 3181 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Usp49Q6P9L4 E330034G19Rik-204ENSMUST00000162224 1350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Usp49Q6P9L4 Rsrc2-201ENSMUST00000050827 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Usp49Q6P9L4 Plch1-202ENSMUST00000059973 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Usp49Q6P9L4 Srrm4os-201ENSMUST00000126959 3360 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Usp49Q6P9L4 Slc22a8-201ENSMUST00000010251 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Usp49Q6P9L4 Rnf180-202ENSMUST00000224011 3785 ntAPPRIS P2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Usp49Q6P9L4 Gm37877-201ENSMUST00000191630 2709 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Usp49Q6P9L4 Cntn1-202ENSMUST00000068378 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Usp49Q6P9L4 Serpina7-202ENSMUST00000060824 1895 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Usp49Q6P9L4 Gm37423-201ENSMUST00000194246 3342 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Usp49Q6P9L4 Gm9603-201ENSMUST00000165814 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Usp49Q6P9L4 Gm3542-201ENSMUST00000169362 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Usp49Q6P9L4 Gm44441-201ENSMUST00000203642 2475 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Usp49Q6P9L4 Gal3st2c-201ENSMUST00000097632 9667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
Usp49Q6P9L4 Gm14635-202ENSMUST00000146535 1409 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
Usp49Q6P9L4 Gm16123-201ENSMUST00000118647 1517 ntBASIC7.52□□□□□ -1.2
Usp49Q6P9L4 Gm40893-201ENSMUST00000220507 1508 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
Usp49Q6P9L4 Slc7a12-201ENSMUST00000037321 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
Usp49Q6P9L4 Gm20706-201ENSMUST00000175985 2023 ntBASIC7.52□□□□□ -1.2
Usp49Q6P9L4 Slc16a4-201ENSMUST00000029502 2248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
Usp49Q6P9L4 Zdhhc9-202ENSMUST00000088935 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Usp49Q6P9L4 Ston2-201ENSMUST00000052969 9896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Usp49Q6P9L4 Gm44677-201ENSMUST00000209151 3739 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Usp49Q6P9L4 Gm10845-202ENSMUST00000228217 3389 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Usp49Q6P9L4 Prame-202ENSMUST00000113159 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Usp49Q6P9L4 Gm37755-201ENSMUST00000195880 2179 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Usp49Q6P9L4 Ppfia2-203ENSMUST00000217854 8885 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Usp49Q6P9L4 Zfp934-208ENSMUST00000222429 1653 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Usp49Q6P9L4 Gm28173-201ENSMUST00000191190 1496 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Usp49Q6P9L4 Gm22256-201ENSMUST00000102291 107 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Usp49Q6P9L4 Gm26079-201ENSMUST00000104066 133 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Usp49Q6P9L4 Gm8534-201ENSMUST00000118553 766 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Usp49Q6P9L4 Gm16420-201ENSMUST00000120258 856 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Usp49Q6P9L4 Gm15349-201ENSMUST00000121154 204 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Usp49Q6P9L4 4930517O19Rik-201ENSMUST00000140320 603 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Usp49Q6P9L4 Gm15935-202ENSMUST00000141656 298 ntTSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Usp49Q6P9L4 Gm26321-201ENSMUST00000157740 242 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Usp49Q6P9L4 Gm25660-201ENSMUST00000158470 104 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Usp49Q6P9L4 Gm5861-201ENSMUST00000168407 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Usp49Q6P9L4 Cyp2c53-ps-201ENSMUST00000175649 897 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Usp49Q6P9L4 1700120O09Rik-201ENSMUST00000177127 977 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Usp49Q6P9L4 Gm21392-201ENSMUST00000182950 972 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Usp49Q6P9L4 Fcer1a-202ENSMUST00000193017 826 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Usp49Q6P9L4 Gm37526-201ENSMUST00000194640 619 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Usp49Q6P9L4 Gm19080-201ENSMUST00000196082 550 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Usp49Q6P9L4 Gm19185-201ENSMUST00000196365 643 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Usp49Q6P9L4 Gm43371-201ENSMUST00000202838 1031 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Usp49Q6P9L4 Spcs2-203ENSMUST00000207137 881 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Usp49Q6P9L4 AC153847.1-201ENSMUST00000214524 353 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Usp49Q6P9L4 Olfr1378-201ENSMUST00000052285 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Usp49Q6P9L4 Olfr1132-201ENSMUST00000090711 927 ntAPPRIS P1 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Usp49Q6P9L4 Rps19-ps4-201ENSMUST00000091925 438 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Usp49Q6P9L4 Gm28856-201ENSMUST00000189150 2828 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Usp49Q6P9L4 Zim1-201ENSMUST00000002336 7693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Usp49Q6P9L4 Tial1-211ENSMUST00000165023 2003 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Usp49Q6P9L4 AC151984.1-201ENSMUST00000218261 2976 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Usp49Q6P9L4 Olfr62-202ENSMUST00000213189 2570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Usp49Q6P9L4 Olfr119-201ENSMUST00000080483 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Usp49Q6P9L4 Zfp719-201ENSMUST00000058104 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Usp49Q6P9L4 Gm6614-203ENSMUST00000181791 2450 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Usp49Q6P9L4 Clec2g-201ENSMUST00000000254 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Usp49Q6P9L4 Lgi1-209ENSMUST00000199812 2262 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Usp49Q6P9L4 Zfp113-204ENSMUST00000165640 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Usp49Q6P9L4 Noc3l-201ENSMUST00000025963 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Usp49Q6P9L4 Olfr195-202ENSMUST00000216957 2077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Usp49Q6P9L4 Bbx-203ENSMUST00000089404 4024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Usp49Q6P9L4 Nceh1-201ENSMUST00000046515 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Usp49Q6P9L4 Chil6-201ENSMUST00000029510 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Usp49Q6P9L4 Gm11541-201ENSMUST00000069852 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Usp49Q6P9L4 Cacna1e-203ENSMUST00000187541 14921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Usp49Q6P9L4 Synb-201ENSMUST00000059362 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Usp49Q6P9L4 Ctage5-217ENSMUST00000176892 2784 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Usp49Q6P9L4 Dennd6a-203ENSMUST00000224111 2692 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Usp49Q6P9L4 Gm28874-201ENSMUST00000190917 3134 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Usp49Q6P9L4 Gm13141-201ENSMUST00000117417 456 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Usp49Q6P9L4 Gm12242-201ENSMUST00000118824 738 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Usp49Q6P9L4 Gm12229-201ENSMUST00000120487 468 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Usp49Q6P9L4 Gm8089-201ENSMUST00000122463 968 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Usp49Q6P9L4 Gm25556-201ENSMUST00000158077 144 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Usp49Q6P9L4 Gm22523-201ENSMUST00000158696 100 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Usp49Q6P9L4 Ulbp1-201ENSMUST00000169796 1093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Usp49Q6P9L4 Gm6726-201ENSMUST00000172786 681 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Usp49Q6P9L4 Gm26381-201ENSMUST00000174895 92 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Usp49Q6P9L4 Gm21761-201ENSMUST00000179502 516 ntAPPRIS P1 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Usp49Q6P9L4 Gm29099-201ENSMUST00000187370 760 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Usp49Q6P9L4 Ly6a-204ENSMUST00000187994 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Usp49Q6P9L4 Gm43546-201ENSMUST00000196721 943 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Usp49Q6P9L4 Gm43396-201ENSMUST00000197506 706 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Usp49Q6P9L4 1700094M23Rik-202ENSMUST00000198047 675 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Usp49Q6P9L4 Gm43055-201ENSMUST00000198859 879 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Usp49Q6P9L4 Gm42713-201ENSMUST00000202709 945 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Usp49Q6P9L4 Gm3549-201ENSMUST00000203873 794 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Usp49Q6P9L4 Gm32884-201ENSMUST00000205528 732 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Usp49Q6P9L4 Gm45136-201ENSMUST00000205793 943 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Usp49Q6P9L4 4930513N20Rik-201ENSMUST00000207466 1265 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Usp49Q6P9L4 Gm45899-201ENSMUST00000212196 1276 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Usp49Q6P9L4 Dpm2-201ENSMUST00000028151 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Usp49Q6P9L4 Olfr922-201ENSMUST00000051004 1132 ntAPPRIS P1 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.1 ms