Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Gm19211-201ENSMUST00000200251 1206 ntBASIC5.21□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 Rpl7a-ps14-201ENSMUST00000205097 790 ntBASIC5.21□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 Gm5324-201ENSMUST00000208115 476 ntBASIC5.21□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 AL591207.2-201ENSMUST00000222991 337 ntBASIC5.21□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 Klrc3-201ENSMUST00000071149 715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 Gimap9-201ENSMUST00000054050 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 Apol10a-202ENSMUST00000119997 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 Medag-202ENSMUST00000201083 2669 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 Lifr-204ENSMUST00000226471 3392 ntAPPRIS P3 BASIC5.21□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 Gm7982-202ENSMUST00000136313 1536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.57
NipblQ6KCD5 Olfr381-204ENSMUST00000215358 2658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Gm13881-201ENSMUST00000149025 3716 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Gm28704-201ENSMUST00000186589 2169 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Gm29636-201ENSMUST00000188149 2169 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Gm38009-201ENSMUST00000194884 3341 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Gm28440-201ENSMUST00000186328 1499 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Gm28472-202ENSMUST00000190133 1499 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Gm28789-202ENSMUST00000190429 1499 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Gm43769-201ENSMUST00000201871 4323 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 4930402F06Rik-202ENSMUST00000113010 1372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Thg1l-202ENSMUST00000109254 2202 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Gm13811-201ENSMUST00000117800 256 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Gm11624-201ENSMUST00000118579 1041 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Gm13313-201ENSMUST00000118938 1084 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Gm14070-201ENSMUST00000120773 428 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 4930527B05Rik-201ENSMUST00000141593 602 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Mgst2-203ENSMUST00000159554 486 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Gm11107-201ENSMUST00000165414 505 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Gm17366-201ENSMUST00000167629 187 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Vmn2r-ps37-201ENSMUST00000174682 1044 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Gm25675-201ENSMUST00000174979 118 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Gm5139-201ENSMUST00000175943 249 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Gm22420-201ENSMUST00000178795 126 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Gm2539-203ENSMUST00000181352 746 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Gm28017-201ENSMUST00000183434 126 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Gm18447-201ENSMUST00000187501 307 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Gm37196-201ENSMUST00000194762 906 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Gm42580-201ENSMUST00000197223 753 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Serpina3a-201ENSMUST00000021496 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 AC123832.2-201ENSMUST00000215151 129 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 AC079681.1-201ENSMUST00000219437 639 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Ssmem1-202ENSMUST00000031798 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 1700011L22Rik-201ENSMUST00000034109 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Olfr591-201ENSMUST00000074272 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.21□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 1700026J12Rik-201ENSMUST00000098226 1127 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Gm3460-201ENSMUST00000167882 1809 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Frem1-202ENSMUST00000107230 9690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Tceal8-204ENSMUST00000163584 2358 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Vmn2r4-202ENSMUST00000175724 2742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Vmn2r6-202ENSMUST00000176481 2742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Gm14085-201ENSMUST00000110521 3740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Gm9839-201ENSMUST00000195252 1437 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Zkscan1-201ENSMUST00000019660 8261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Gm8853-201ENSMUST00000198366 1344 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Wars2-201ENSMUST00000004343 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Olfr669-203ENSMUST00000214260 2336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Gucy2g-201ENSMUST00000069183 3690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Xpnpep2-201ENSMUST00000077775 3498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Zfp790-201ENSMUST00000032796 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Zfp449-201ENSMUST00000101560 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Gm30655-202ENSMUST00000222732 2808 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Efcab14-201ENSMUST00000074425 4300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 4933425L06Rik-201ENSMUST00000022232 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 CT025566.1-202ENSMUST00000224800 2511 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Nebl-201ENSMUST00000028080 5780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Gm25346-201ENSMUST00000104509 128 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Gm22372-201ENSMUST00000104589 136 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Lrrc51-208ENSMUST00000106968 766 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Sub1-202ENSMUST00000110504 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Gm15040-201ENSMUST00000118561 1241 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Gm12618-201ENSMUST00000121754 483 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 1700003G18Rik-202ENSMUST00000150518 312 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 1700108F19Rik-208ENSMUST00000191447 660 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Ccl2-201ENSMUST00000000193 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 AC157822.1-201ENSMUST00000196643 80 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 1700019F05Rik-201ENSMUST00000202487 533 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Gm45169-201ENSMUST00000205717 639 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Gm45693-201ENSMUST00000211391 1157 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Snora21-201ENSMUST00000082967 137 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 n-R5s58-201ENSMUST00000093682 119 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 4930579H20Rik-201ENSMUST00000187815 1516 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Gm805-201ENSMUST00000181667 3160 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 9330136K24Rik-201ENSMUST00000180842 2478 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 9630028H03Rik-201ENSMUST00000129868 2364 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Gm13821-201ENSMUST00000202029 3201 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Gm37647-201ENSMUST00000194556 3143 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Naip1-204ENSMUST00000222155 5361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Haus2-202ENSMUST00000110706 3055 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Pan2-206ENSMUST00000219721 4316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Mei1-204ENSMUST00000189540 3718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Enam-201ENSMUST00000031222 5483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Trdc-201ENSMUST00000196323 3865 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Prdm10-201ENSMUST00000074510 3408 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Xrcc4-201ENSMUST00000022115 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 AC162301.1-201ENSMUST00000228785 1542 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Gm2762-207ENSMUST00000202739 2665 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Gm13428-201ENSMUST00000117540 365 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Gm13641-201ENSMUST00000117993 473 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Gm13537-201ENSMUST00000120467 267 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
NipblQ6KCD5 Rps29-ps-201ENSMUST00000122083 172 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82 ms