Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 Gm2035-201ENSMUST00000180053 435 ntAPPRIS P1 BASIC6.9□□□□□ -1.3
SbdsP70122 Gm27014-201ENSMUST00000182658 937 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
SbdsP70122 Gm27207-201ENSMUST00000184995 878 ntTSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
SbdsP70122 Gm29160-201ENSMUST00000190094 699 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
SbdsP70122 Gm31663-202ENSMUST00000208481 1190 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
SbdsP70122 Gm31409-201ENSMUST00000209894 710 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
SbdsP70122 Gm7780-201ENSMUST00000214787 406 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
SbdsP70122 Gm21936-201ENSMUST00000221442 435 ntAPPRIS P1 BASIC6.9□□□□□ -1.3
SbdsP70122 Gm5374-202ENSMUST00000222910 314 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
SbdsP70122 Tex30-201ENSMUST00000027215 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
SbdsP70122 Gkn1-201ENSMUST00000032129 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
SbdsP70122 Klrd1-201ENSMUST00000032268 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
SbdsP70122 Gm17529-201ENSMUST00000180738 3093 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
SbdsP70122 Gm26645-201ENSMUST00000181076 1316 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
SbdsP70122 Csn2-206ENSMUST00000197422 1329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
SbdsP70122 Gm44723-201ENSMUST00000207369 4000 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
SbdsP70122 Gm44289-201ENSMUST00000204144 1390 ntBASIC6.9□□□□□ -1.31
SbdsP70122 Vangl1-202ENSMUST00000159388 3207 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.31
SbdsP70122 Asxl3-201ENSMUST00000097655 11697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.31
SbdsP70122 Gm43335-201ENSMUST00000198299 3276 ntBASIC6.9□□□□□ -1.31
SbdsP70122 Gm14635-202ENSMUST00000146535 1409 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
SbdsP70122 Olfr1426-202ENSMUST00000208703 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.31
SbdsP70122 AC114585.1-201ENSMUST00000228080 3680 ntBASIC6.9□□□□□ -1.31
SbdsP70122 Dnm3os-201ENSMUST00000139662 7928 ntBASIC6.9□□□□□ -1.31
SbdsP70122 Krcc1-202ENSMUST00000168700 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
SbdsP70122 Sulf1-202ENSMUST00000177608 5598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
SbdsP70122 Gm42613-201ENSMUST00000199975 1931 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
SbdsP70122 Rfx4-205ENSMUST00000166696 3332 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
SbdsP70122 Etv1-203ENSMUST00000160244 2032 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
SbdsP70122 Olfr596-202ENSMUST00000214577 3392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
SbdsP70122 1700015I17Rik-201ENSMUST00000209585 2099 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
SbdsP70122 Csde1-206ENSMUST00000197488 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
SbdsP70122 Oxr1-207ENSMUST00000179393 4498 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
SbdsP70122 Gm26843-201ENSMUST00000212304 2859 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
SbdsP70122 Pcdh15-201ENSMUST00000064562 8830 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
SbdsP70122 CT009480.2-201ENSMUST00000225152 3369 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
SbdsP70122 Mrpl1-201ENSMUST00000036437 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
SbdsP70122 Gm25631-201ENSMUST00000104390 130 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
SbdsP70122 Gstm6-203ENSMUST00000106683 745 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
SbdsP70122 Fam107b-204ENSMUST00000115054 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
SbdsP70122 Rps12-ps19-201ENSMUST00000119773 400 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
SbdsP70122 Vmn1r207-ps-201ENSMUST00000119931 1073 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
SbdsP70122 Gm12104-201ENSMUST00000120359 979 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
SbdsP70122 Gm11263-201ENSMUST00000121853 749 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
SbdsP70122 Gm26023-201ENSMUST00000122722 313 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
SbdsP70122 Dnah2os-201ENSMUST00000124108 859 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
SbdsP70122 Gm15407-201ENSMUST00000136919 634 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
SbdsP70122 Gm15872-201ENSMUST00000162454 1108 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
SbdsP70122 Gml-202ENSMUST00000164026 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
SbdsP70122 Svs6-201ENSMUST00000017144 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
SbdsP70122 Gm8895-201ENSMUST00000172300 1223 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
SbdsP70122 Gm21761-201ENSMUST00000179502 516 ntAPPRIS P1 BASIC6.89□□□□□ -1.31
SbdsP70122 Snhg5-201ENSMUST00000180563 1004 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
SbdsP70122 Gm18849-201ENSMUST00000189861 560 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
SbdsP70122 1700123O21Rik-201ENSMUST00000190515 677 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
SbdsP70122 Gm35323-201ENSMUST00000191836 499 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
SbdsP70122 Sox2ot-214ENSMUST00000198758 1286 ntTSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
SbdsP70122 2010309G21Rik-201ENSMUST00000198927 458 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
SbdsP70122 Klrb1-ps1-202ENSMUST00000203057 414 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
SbdsP70122 Olfr1509-203ENSMUST00000206100 1161 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
SbdsP70122 Gm9357-201ENSMUST00000207138 805 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
SbdsP70122 Gm9604-201ENSMUST00000211175 433 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
SbdsP70122 Gm7943-201ENSMUST00000212078 1034 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
SbdsP70122 AC122428.4-201ENSMUST00000213494 589 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
SbdsP70122 Aldoa-ps4-201ENSMUST00000216332 753 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
SbdsP70122 AC116502.1-201ENSMUST00000220989 291 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
SbdsP70122 AC117769.2-201ENSMUST00000224612 469 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
SbdsP70122 AC154515.3-201ENSMUST00000225081 1159 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
SbdsP70122 Olfr1501-201ENSMUST00000073966 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.89□□□□□ -1.31
SbdsP70122 Mrpl42-201ENSMUST00000075829 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
SbdsP70122 Gm45793-201ENSMUST00000207900 1342 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
SbdsP70122 Prkag2os2-201ENSMUST00000123610 1432 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
SbdsP70122 BC053393-201ENSMUST00000050937 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
SbdsP70122 Olfr92-202ENSMUST00000214994 2073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
SbdsP70122 Gm38200-201ENSMUST00000192083 2111 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
SbdsP70122 AC116476.1-201ENSMUST00000226274 2318 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
SbdsP70122 Gm38178-201ENSMUST00000194502 2471 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
SbdsP70122 D630023O14Rik-201ENSMUST00000191913 3099 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
SbdsP70122 Zfhx4-203ENSMUST00000175866 11287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
SbdsP70122 Mef2c-223ENSMUST00000199105 4361 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
SbdsP70122 AC156636.2-201ENSMUST00000218845 4557 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
SbdsP70122 Olfr488-202ENSMUST00000211508 4624 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
SbdsP70122 Olfr488-203ENSMUST00000215173 4605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
SbdsP70122 Kcnj16-205ENSMUST00000178798 3678 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
SbdsP70122 Cwf19l1-201ENSMUST00000026218 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
SbdsP70122 Slc24a2-203ENSMUST00000107157 10531 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
SbdsP70122 Pecam1-204ENSMUST00000106796 3441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
SbdsP70122 AC165080.4-201ENSMUST00000213591 9507 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
SbdsP70122 AC122828.2-201ENSMUST00000222511 2880 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
SbdsP70122 Gm30570-201ENSMUST00000213553 2651 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
SbdsP70122 Gm9877-201ENSMUST00000064271 2627 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
SbdsP70122 Zfp184-201ENSMUST00000006903 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
SbdsP70122 5330413P13Rik-203ENSMUST00000150466 2173 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
SbdsP70122 Vmn2r-ps139-201ENSMUST00000190764 2057 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
SbdsP70122 Ctps2-202ENSMUST00000101095 1665 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
SbdsP70122 Olfr1381-202ENSMUST00000213256 4954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
SbdsP70122 Nsun4-206ENSMUST00000165493 3920 ntTSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
SbdsP70122 Gm36660-201ENSMUST00000218323 3871 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
SbdsP70122 Trav8d-1-201ENSMUST00000103580 400 ntAPPRIS P1 BASIC6.88□□□□□ -1.31
SbdsP70122 Gm14201-201ENSMUST00000117627 289 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
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