Protein–RNA interactions for Protein: P33215

Nedd1, Protein NEDD1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd1P33215 Gm22504-201ENSMUST00000082963 139 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
Nedd1P33215 Vmn1r204-201ENSMUST00000091728 909 ntAPPRIS P1 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Nedd1P33215 Olfr1198-201ENSMUST00000099814 927 ntAPPRIS P1 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Nedd1P33215 Gm43422-201ENSMUST00000199780 3571 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
Nedd1P33215 Adcy10-202ENSMUST00000111439 5193 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Nedd1P33215 Siah3-201ENSMUST00000164848 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Nedd1P33215 Slfn4-202ENSMUST00000167596 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Nedd1P33215 Cflar-205ENSMUST00000114313 6572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Nedd1P33215 Epb41-201ENSMUST00000030739 6565 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Nedd1P33215 Gm43211-201ENSMUST00000196901 1899 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
Nedd1P33215 Pik3r4-201ENSMUST00000065778 4711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Nedd1P33215 4930502E18Rik-201ENSMUST00000069209 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Nedd1P33215 Epc1-203ENSMUST00000115870 3817 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Nedd1P33215 Efcab5-201ENSMUST00000108400 4654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Nedd1P33215 Lrrtm4-205ENSMUST00000133918 2255 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Nedd1P33215 Brca1-201ENSMUST00000017290 6572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Nedd1P33215 Slc12a1-203ENSMUST00000110495 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Nedd1P33215 A730082K24Rik-203ENSMUST00000205913 1808 ntTSL 2 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Nedd1P33215 Erc1-210ENSMUST00000184864 5428 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Nedd1P33215 Gm30849-201ENSMUST00000214503 1379 ntTSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Nedd1P33215 Smpd4-204ENSMUST00000163476 4532 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Nedd1P33215 AC161595.1-201ENSMUST00000216389 1993 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Nedd1P33215 Sorbs2-201ENSMUST00000067065 6337 ntTSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Nedd1P33215 Gm2108-201ENSMUST00000165058 2177 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
Nedd1P33215 Jcad-201ENSMUST00000037029 6730 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Nedd1P33215 Ash1l-202ENSMUST00000186583 11644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Nedd1P33215 Gm805-201ENSMUST00000181667 3160 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Nedd1P33215 Arpp21-202ENSMUST00000070218 3181 ntTSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Nedd1P33215 Afap1l2-201ENSMUST00000111584 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Nedd1P33215 Esp31-201ENSMUST00000174742 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Nedd1P33215 Odf2-202ENSMUST00000046571 3959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Nedd1P33215 Olfr1471-205ENSMUST00000217482 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Nedd1P33215 Bpifc-201ENSMUST00000061699 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Nedd1P33215 Mycbp2-201ENSMUST00000159855 15233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Nedd1P33215 Commd8-201ENSMUST00000013693 3895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Nedd1P33215 Frem1-201ENSMUST00000071708 9307 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Nedd1P33215 Gm25757-201ENSMUST00000103986 123 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
Nedd1P33215 Serpina3h-202ENSMUST00000116393 1226 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
Nedd1P33215 Gm6429-201ENSMUST00000117144 475 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
Nedd1P33215 Rhox11-ps2-201ENSMUST00000117962 451 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
Nedd1P33215 Gm13130-201ENSMUST00000119195 1166 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
Nedd1P33215 Gm5255-201ENSMUST00000120125 642 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
Nedd1P33215 Gm15963-201ENSMUST00000131387 876 ntTSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Nedd1P33215 AC122263.2-201ENSMUST00000145909 586 ntTSL 3 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Nedd1P33215 Olfr443-ps1-201ENSMUST00000163240 915 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
Nedd1P33215 Gm3102-201ENSMUST00000164236 489 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
Nedd1P33215 Crip3-206ENSMUST00000165993 735 ntTSL 2 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Nedd1P33215 Gm17064-201ENSMUST00000167690 452 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
Nedd1P33215 Gm9381-201ENSMUST00000182285 1012 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
Nedd1P33215 Gm27218-201ENSMUST00000183745 392 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
Nedd1P33215 Gm8883-202ENSMUST00000188258 545 ntTSL 3 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Nedd1P33215 Scgb2b8-ps-201ENSMUST00000188661 327 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
Nedd1P33215 Scgb2b13-ps-201ENSMUST00000190420 328 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
Nedd1P33215 A330074H02Rik-201ENSMUST00000194667 1039 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
Nedd1P33215 Gm33370-201ENSMUST00000195935 489 ntTSL 2 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Nedd1P33215 Gm43578-201ENSMUST00000201250 459 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
Nedd1P33215 Gm18452-201ENSMUST00000202968 1111 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
Nedd1P33215 Olfr440-ps1-201ENSMUST00000204044 917 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
Nedd1P33215 Gm44590-201ENSMUST00000206161 391 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
Nedd1P33215 Gm45432-201ENSMUST00000210391 416 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
Nedd1P33215 Gm35998-201ENSMUST00000212862 838 ntTSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Nedd1P33215 Spata19-204ENSMUST00000214287 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Nedd1P33215 Gm31698-203ENSMUST00000217115 690 ntTSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Nedd1P33215 AC105167.1-201ENSMUST00000219966 253 ntTSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Nedd1P33215 CT030166.4-201ENSMUST00000220640 404 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
Nedd1P33215 AL591207.2-201ENSMUST00000222991 337 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
Nedd1P33215 FAM237A-201ENSMUST00000226288 1105 ntAPPRIS P1 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Nedd1P33215 Gm6369-201ENSMUST00000069626 412 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
Nedd1P33215 Oxsm-203ENSMUST00000112625 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Nedd1P33215 Gm10687-201ENSMUST00000180670 3233 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Nedd1P33215 Mrpl17-202ENSMUST00000124482 7300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Nedd1P33215 8030451A03Rik-203ENSMUST00000141428 2618 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Nedd1P33215 Cep290-210ENSMUST00000220346 8211 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Nedd1P33215 Gm4319-201ENSMUST00000191139 2048 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Nedd1P33215 Gm42615-201ENSMUST00000197704 1820 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
Nedd1P33215 Gm3892-202ENSMUST00000178043 3539 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Nedd1P33215 Gm10593-201ENSMUST00000178906 3539 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Nedd1P33215 Hnrnpa3-203ENSMUST00000111962 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Nedd1P33215 Grik1-210ENSMUST00000228034 2708 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
Nedd1P33215 Dsg4-201ENSMUST00000019426 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Nedd1P33215 Gm37496-201ENSMUST00000191930 2509 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
Nedd1P33215 Cysltr2-201ENSMUST00000044664 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Nedd1P33215 Zfp128-202ENSMUST00000144578 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Nedd1P33215 Sbf2-201ENSMUST00000033058 7154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Nedd1P33215 Omd-201ENSMUST00000065494 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Nedd1P33215 AC159301.1-202ENSMUST00000225860 2133 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
Nedd1P33215 Gm6999-201ENSMUST00000180427 2658 ntTSL 2 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Nedd1P33215 Zfp939-202ENSMUST00000186855 2480 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Nedd1P33215 Olfr998-202ENSMUST00000215083 1399 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Nedd1P33215 Ctnna2-202ENSMUST00000159626 3908 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Nedd1P33215 Lef1-203ENSMUST00000098611 2298 ntTSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Nedd1P33215 Zfp663-201ENSMUST00000073062 3157 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.07
Nedd1P33215 Mapk10-202ENSMUST00000112846 2617 ntTSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Nedd1P33215 Ikbkg-217ENSMUST00000164101 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.07
Nedd1P33215 Ikbkg-218ENSMUST00000180230 6785 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.07
Nedd1P33215 Gm29220-201ENSMUST00000185862 1501 ntTSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.07
Nedd1P33215 Gm28966-201ENSMUST00000188951 1501 ntTSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.07
Nedd1P33215 Zfp488-201ENSMUST00000166737 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Nedd1P33215 Crnkl1-201ENSMUST00000001818 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Nedd1P33215 Gm28867-201ENSMUST00000190194 2166 ntTSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.8 ms