Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 1190001M18Rik-201ENSMUST00000215937 1270 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
PtprmP28828 Gm9202-201ENSMUST00000223036 437 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
PtprmP28828 Fbxw10-203ENSMUST00000150989 3267 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
PtprmP28828 Gm37915-201ENSMUST00000195134 3261 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
PtprmP28828 Gm15575-201ENSMUST00000119414 1581 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
PtprmP28828 Gm43970-201ENSMUST00000204346 3605 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
PtprmP28828 AC140409.2-201ENSMUST00000216936 3079 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
PtprmP28828 Cyp2c50-201ENSMUST00000068094 1643 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
PtprmP28828 A330032B11Rik-201ENSMUST00000180609 1919 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
PtprmP28828 Olfr1426-205ENSMUST00000219155 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
PtprmP28828 Snhg17-209ENSMUST00000186993 3144 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
PtprmP28828 Dusp3-202ENSMUST00000107172 4445 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
PtprmP28828 Gm20560-201ENSMUST00000204577 3513 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
PtprmP28828 AC153945.1-201ENSMUST00000217761 1722 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
PtprmP28828 C230057A21Rik-201ENSMUST00000194944 3331 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
PtprmP28828 Gm8113-201ENSMUST00000160298 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
PtprmP28828 Gm37984-201ENSMUST00000191641 3733 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
PtprmP28828 Gm37721-202ENSMUST00000194673 1498 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
PtprmP28828 Gm20045-201ENSMUST00000192658 5577 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
PtprmP28828 Zfp804b-201ENSMUST00000164784 3924 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
PtprmP28828 Ankrd49-206ENSMUST00000216372 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
PtprmP28828 Otud7b-203ENSMUST00000098849 8046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
PtprmP28828 Itgb8-201ENSMUST00000026360 8403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
PtprmP28828 4933406C10Rik-202ENSMUST00000181670 1633 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
PtprmP28828 A830082K12Rik-207ENSMUST00000183171 4176 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
PtprmP28828 Mup3-202ENSMUST00000107472 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
PtprmP28828 Gm11032-201ENSMUST00000109941 102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
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PtprmP28828 Gm29209-201ENSMUST00000188176 457 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
PtprmP28828 Gm29090-201ENSMUST00000188526 457 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
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PtprmP28828 Fndc3b-204ENSMUST00000195008 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
PtprmP28828 Espl1-201ENSMUST00000064924 6630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
PtprmP28828 Olfr957-202ENSMUST00000216177 1726 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
PtprmP28828 Kcnc2-202ENSMUST00000218445 4033 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
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PtprmP28828 Gm28824-201ENSMUST00000187496 2167 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
PtprmP28828 Gm28948-201ENSMUST00000188447 2167 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
PtprmP28828 Gm29472-201ENSMUST00000188599 2167 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
PtprmP28828 Gm28561-201ENSMUST00000189366 2167 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
PtprmP28828 Gm28732-201ENSMUST00000189632 2167 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
PtprmP28828 Gm38136-201ENSMUST00000194775 2167 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
PtprmP28828 Gm38296-201ENSMUST00000195205 2167 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
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PtprmP28828 9430007A20Rik-201ENSMUST00000030328 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
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PtprmP28828 A530076I17Rik-202ENSMUST00000228352 1524 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
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PtprmP28828 Adgrl2-202ENSMUST00000106128 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
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PtprmP28828 Nlrc5-207ENSMUST00000211816 7578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
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PtprmP28828 Gm37233-201ENSMUST00000192173 6263 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
PtprmP28828 Vmn1r197-202ENSMUST00000226225 5326 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
PtprmP28828 Igkv6-23-201ENSMUST00000103386 369 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
PtprmP28828 Nrp2-206ENSMUST00000114157 6357 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
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PtprmP28828 Il2ra-202ENSMUST00000150890 1013 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
PtprmP28828 Gm26489-201ENSMUST00000157880 264 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
PtprmP28828 Mir3095-201ENSMUST00000175552 87 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
PtprmP28828 Gm1972-201ENSMUST00000181606 964 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
PtprmP28828 Mlip-214ENSMUST00000185039 1295 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
PtprmP28828 Ms4a12-201ENSMUST00000186228 792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
PtprmP28828 Gm44330-201ENSMUST00000200106 143 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
PtprmP28828 Gm17988-201ENSMUST00000208796 535 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
PtprmP28828 4933404K13Rik-201ENSMUST00000214651 937 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
PtprmP28828 Gm6477-201ENSMUST00000217098 764 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
PtprmP28828 AC122459.2-201ENSMUST00000227099 638 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
PtprmP28828 Gm839-201ENSMUST00000079186 1843 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
PtprmP28828 Osbpl9-201ENSMUST00000030288 2871 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
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