Protein–RNA interactions for Protein: P23336

Ggta1, N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggta1P23336 Lats1-203ENSMUST00000217931 4186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.4
Ggta1P23336 Lats1-201ENSMUST00000040043 4155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.4
Ggta1P23336 Msantd4-202ENSMUST00000212075 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.4
Ggta1P23336 Gm38811-201ENSMUST00000203781 3478 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.4
Ggta1P23336 Satb1-214ENSMUST00000176669 4407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.4
Ggta1P23336 Acox1-202ENSMUST00000072948 3743 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.4
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Ggta1P23336 Smarca2-242ENSMUST00000208751 1846 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
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Ggta1P23336 Slc38a6-208ENSMUST00000153941 3927 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Ggta1P23336 Gm26648-201ENSMUST00000181925 5831 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
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Ggta1P23336 Rab1a-206ENSMUST00000163483 2657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Ggta1P23336 Eif4e1b-203ENSMUST00000126785 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Ggta1P23336 Gm11820-201ENSMUST00000139614 664 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Ggta1P23336 Gm24176-201ENSMUST00000158928 121 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Ggta1P23336 Gm16297-201ENSMUST00000161466 459 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Ggta1P23336 Gm42421-201ENSMUST00000172367 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Ggta1P23336 Gm22642-201ENSMUST00000175352 252 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Ggta1P23336 Crnde-205ENSMUST00000179400 651 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Ggta1P23336 Gm21304-201ENSMUST00000180568 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Ggta1P23336 Gm21293-202ENSMUST00000180664 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Ggta1P23336 Gm21312-203ENSMUST00000181239 1185 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Ggta1P23336 Gm20765-203ENSMUST00000181707 1185 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Ggta1P23336 Scgb1b16-ps-201ENSMUST00000186029 275 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Ggta1P23336 Scgb1b14-ps-201ENSMUST00000188286 275 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.5 ms