Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 AC124581.3-201ENSMUST00000224270 1624 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Ccl20O89093 Kmt2c-201ENSMUST00000045291 14967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Ccl20O89093 Gm44289-201ENSMUST00000204144 1390 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Ccl20O89093 Dock7-214ENSMUST00000205650 6297 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Ccl20O89093 Lncenc1-202ENSMUST00000179324 2764 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Ccl20O89093 Sugt1-201ENSMUST00000054908 7392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Ccl20O89093 AC124516.2-201ENSMUST00000221455 1829 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Ccl20O89093 Gm18409-201ENSMUST00000218988 2506 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Ccl20O89093 Rnd3-203ENSMUST00000154545 2967 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Ccl20O89093 Gm29761-201ENSMUST00000215964 1939 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Ccl20O89093 B020004C17Rik-201ENSMUST00000178161 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Ccl20O89093 Gabrg1-201ENSMUST00000031119 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Ccl20O89093 Vmn2r-ps54-205ENSMUST00000182110 2587 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Ccl20O89093 Vmn1r22-203ENSMUST00000228076 3011 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Ccl20O89093 Gm44046-201ENSMUST00000203145 2678 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Ccl20O89093 Nsun4-206ENSMUST00000165493 3920 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Ccl20O89093 2610044O15Rik8-202ENSMUST00000186619 2337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Ccl20O89093 AA792892-202ENSMUST00000202253 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Ccl20O89093 Olfr92-202ENSMUST00000214994 2073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Ccl20O89093 Fanci-201ENSMUST00000036865 4645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Ccl20O89093 Cyp2c68-201ENSMUST00000099472 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
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Ccl20O89093 Lrrc51-204ENSMUST00000106964 872 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Ccl20O89093 Gm15149-201ENSMUST00000119370 360 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Ccl20O89093 Gm5387-201ENSMUST00000119776 857 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Ccl20O89093 Gm22035-201ENSMUST00000157284 228 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Ccl20O89093 Gm24176-201ENSMUST00000158928 121 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Ccl20O89093 Gm15872-201ENSMUST00000162454 1108 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Ccl20O89093 4930471M09Rik-201ENSMUST00000181849 1112 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Ccl20O89093 Gm9274-201ENSMUST00000182505 984 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Ccl20O89093 Gm27014-201ENSMUST00000182658 937 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Ccl20O89093 Gm20690-202ENSMUST00000195126 355 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Ccl20O89093 Gm31831-201ENSMUST00000196240 684 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Ccl20O89093 Gm26413-201ENSMUST00000196783 126 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Ccl20O89093 2900076G11Rik-201ENSMUST00000202297 631 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Ccl20O89093 Klrb1-ps1-202ENSMUST00000203057 414 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Ccl20O89093 5930435M05Rik-202ENSMUST00000207936 414 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Ccl20O89093 Gm9604-201ENSMUST00000211175 433 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Ccl20O89093 Gm7780-201ENSMUST00000214787 406 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Ccl20O89093 RMST_1.1-203ENSMUST00000217866 775 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Ccl20O89093 Gm17849-201ENSMUST00000219788 853 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Ccl20O89093 Hspe1-ps1-201ENSMUST00000222955 330 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Ccl20O89093 AC124450.1-201ENSMUST00000225569 495 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Ccl20O89093 AC157212.1-201ENSMUST00000228398 1075 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Ccl20O89093 Olfr124-201ENSMUST00000053599 1122 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Ccl20O89093 Olfr159-201ENSMUST00000053931 960 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Ccl20O89093 Olfr350-201ENSMUST00000055130 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Ccl20O89093 Mir196a-1-201ENSMUST00000083612 102 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Ccl20O89093 Gcnt2-203ENSMUST00000110191 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Ccl20O89093 Add3-201ENSMUST00000025999 4334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Ccl20O89093 Cnot1-203ENSMUST00000211887 8364 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Ccl20O89093 Ankfy1-206ENSMUST00000155998 8030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Ccl20O89093 Magea5-202ENSMUST00000169540 1563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Ccl20O89093 Gm5157-201ENSMUST00000185914 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Ccl20O89093 Fam227b-202ENSMUST00000110448 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Ccl20O89093 C87977-204ENSMUST00000105757 1885 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Ccl20O89093 Olfr150-202ENSMUST00000217257 1867 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Ccl20O89093 Osbpl9-219ENSMUST00000194478 2903 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Ccl20O89093 Psd3-201ENSMUST00000038959 11319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Ccl20O89093 Olfr720-204ENSMUST00000217642 4832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Ccl20O89093 1700080N15Rik-202ENSMUST00000154360 1316 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Ccl20O89093 Lrrc3b-202ENSMUST00000163937 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Ccl20O89093 Vmn1r181-203ENSMUST00000226978 4371 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Ccl20O89093 Mgam2-ps-201ENSMUST00000195870 3745 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Ccl20O89093 Elavl2-209ENSMUST00000107124 4127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
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Ccl20O89093 Olfr971-202ENSMUST00000214242 2027 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
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Ccl20O89093 Ighv14-1-201ENSMUST00000103463 351 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Ccl20O89093 Cep112-202ENSMUST00000106715 1161 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Ccl20O89093 Stk36-203ENSMUST00000113694 629 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
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Ccl20O89093 Gm11263-201ENSMUST00000121853 749 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Ccl20O89093 1700054M17Rik-201ENSMUST00000125654 445 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Ccl20O89093 Gm15743-201ENSMUST00000129645 242 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Ccl20O89093 Gm15407-201ENSMUST00000136919 634 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Ccl20O89093 Gm11545-201ENSMUST00000146507 375 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Ccl20O89093 Gm11816-202ENSMUST00000149848 714 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Ccl20O89093 Gm25057-201ENSMUST00000157366 88 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Ccl20O89093 Gm23392-201ENSMUST00000157580 113 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Ccl20O89093 Gm26182-201ENSMUST00000157688 116 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Ccl20O89093 Fcor-201ENSMUST00000159364 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Ccl20O89093 Skint8-205ENSMUST00000165046 1280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Ccl20O89093 Gm17205-201ENSMUST00000168370 1207 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Ccl20O89093 Svs6-201ENSMUST00000017144 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Ccl20O89093 Pantr1-203ENSMUST00000176154 514 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Ccl20O89093 Gm23018-201ENSMUST00000177928 109 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Ccl20O89093 Gm5930-202ENSMUST00000178002 489 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Ccl20O89093 Gm8237-202ENSMUST00000178594 447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Ccl20O89093 Gm26654-201ENSMUST00000180455 256 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Ccl20O89093 Snhg5-201ENSMUST00000180563 1004 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Ccl20O89093 Gm27209-201ENSMUST00000183834 898 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Ccl20O89093 Gm27207-201ENSMUST00000184995 878 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Ccl20O89093 1700108F19Rik-208ENSMUST00000191447 660 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Ccl20O89093 Ccl2-201ENSMUST00000000193 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Ccl20O89093 Gm42707-202ENSMUST00000196668 618 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
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