Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 5830416I19Rik-201ENSMUST00000198687 2627 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
PtprbB2RU80 Ccdc175-201ENSMUST00000021494 2622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
PtprbB2RU80 Gm44194-201ENSMUST00000204222 3229 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
PtprbB2RU80 Gstm7-202ENSMUST00000106687 743 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
PtprbB2RU80 Myl2-202ENSMUST00000111750 729 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
PtprbB2RU80 Gm14550-201ENSMUST00000117918 407 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
PtprbB2RU80 Gm13983-201ENSMUST00000118018 865 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
PtprbB2RU80 Gm14054-201ENSMUST00000120744 704 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
PtprbB2RU80 Rpl35a-ps5-201ENSMUST00000137013 333 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
PtprbB2RU80 4933401B06Rik-202ENSMUST00000142024 1219 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
PtprbB2RU80 Gm25717-201ENSMUST00000158631 353 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
PtprbB2RU80 Mir7653-201ENSMUST00000184358 61 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
PtprbB2RU80 C030007H22Rik-201ENSMUST00000186258 591 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
PtprbB2RU80 Gm18447-201ENSMUST00000187501 307 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
PtprbB2RU80 Gm38097-201ENSMUST00000192936 439 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
PtprbB2RU80 4921539H07Rik-201ENSMUST00000197200 2985 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
PtprbB2RU80 Gm45693-201ENSMUST00000211391 1157 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
PtprbB2RU80 Gm45448-201ENSMUST00000211739 209 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
PtprbB2RU80 Gm17849-201ENSMUST00000219788 853 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
PtprbB2RU80 Gm2139-201ENSMUST00000222569 1075 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
PtprbB2RU80 CT009556.1-201ENSMUST00000227282 449 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
PtprbB2RU80 AC120375.2-202ENSMUST00000228722 397 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
PtprbB2RU80 Gm26442-201ENSMUST00000082588 153 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
PtprbB2RU80 Wdr44-201ENSMUST00000035766 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
PtprbB2RU80 Bcorl1-201ENSMUST00000037596 7360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
PtprbB2RU80 AC140393.3-201ENSMUST00000228396 1352 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
PtprbB2RU80 Fbxw10-205ENSMUST00000176577 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
PtprbB2RU80 Gm12794-201ENSMUST00000052027 1452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
PtprbB2RU80 Gm38209-201ENSMUST00000192711 2169 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
PtprbB2RU80 Gm37263-201ENSMUST00000195837 2169 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
PtprbB2RU80 Olfr859-203ENSMUST00000217280 9596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
PtprbB2RU80 Pum1-205ENSMUST00000105992 5058 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
PtprbB2RU80 Zfp638-202ENSMUST00000113835 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
PtprbB2RU80 Gm31410-201ENSMUST00000217302 4048 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
PtprbB2RU80 Rftn2-201ENSMUST00000027121 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
PtprbB2RU80 Gria3-202ENSMUST00000115103 3081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
PtprbB2RU80 Oas2-201ENSMUST00000053909 3869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
PtprbB2RU80 Gm28055-202ENSMUST00000189576 1301 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
PtprbB2RU80 Gm13040-202ENSMUST00000169056 2104 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
PtprbB2RU80 Cmah-209ENSMUST00000224953 2221 ntAPPRIS P1 BASIC6.02□□□□□ -1.45
PtprbB2RU80 Gm7980-201ENSMUST00000168107 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
PtprbB2RU80 CAAA01119292.1-201ENSMUST00000226763 2766 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
PtprbB2RU80 Hspg2-201ENSMUST00000030547 14187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
PtprbB2RU80 Zmat4-206ENSMUST00000207301 4207 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
PtprbB2RU80 Lars-201ENSMUST00000097590 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
PtprbB2RU80 Zfp663-201ENSMUST00000073062 3157 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
PtprbB2RU80 Gm24434-201ENSMUST00000104081 132 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
PtprbB2RU80 Gm23485-201ENSMUST00000104181 155 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
PtprbB2RU80 Gm6977-201ENSMUST00000121568 512 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
PtprbB2RU80 4930586N03Rik-201ENSMUST00000122940 881 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
PtprbB2RU80 Gm23891-201ENSMUST00000158114 138 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
PtprbB2RU80 Gm17044-201ENSMUST00000168549 828 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
PtprbB2RU80 Gm7952-201ENSMUST00000180540 984 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
PtprbB2RU80 Gm27010-201ENSMUST00000182727 863 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
PtprbB2RU80 Gm27005-201ENSMUST00000182783 921 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
PtprbB2RU80 Gm27348-201ENSMUST00000184511 170 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
PtprbB2RU80 Gm7343-201ENSMUST00000194510 1061 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
PtprbB2RU80 Gm43383-201ENSMUST00000195981 469 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
PtprbB2RU80 Gm18430-201ENSMUST00000197534 682 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
PtprbB2RU80 Gm44809-201ENSMUST00000208305 993 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
PtprbB2RU80 Gm45732-201ENSMUST00000212460 586 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
PtprbB2RU80 AC124595.1-201ENSMUST00000221799 646 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
PtprbB2RU80 AC132833.4-201ENSMUST00000228313 203 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
PtprbB2RU80 Lcn9-201ENSMUST00000023978 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
PtprbB2RU80 Gm7731-201ENSMUST00000091759 470 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
PtprbB2RU80 Elavl2-209ENSMUST00000107124 4127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
PtprbB2RU80 Gm10184-201ENSMUST00000086423 1939 ntAPPRIS P1 BASIC6.02□□□□□ -1.45
PtprbB2RU80 Tmem229b-202ENSMUST00000070174 3656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
PtprbB2RU80 Naca-202ENSMUST00000092048 6745 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
PtprbB2RU80 Kcnd2-201ENSMUST00000081542 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
PtprbB2RU80 Slc12a1-203ENSMUST00000110495 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
PtprbB2RU80 Zfp934-209ENSMUST00000222746 2206 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
PtprbB2RU80 Ice2-201ENSMUST00000034761 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
PtprbB2RU80 Usp17lc-201ENSMUST00000079348 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
PtprbB2RU80 Smg7-201ENSMUST00000043560 5792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
PtprbB2RU80 Gm21846-201ENSMUST00000179257 3073 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
PtprbB2RU80 Zkscan1-202ENSMUST00000066617 8042 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
PtprbB2RU80 Gm37518-201ENSMUST00000194930 2603 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
PtprbB2RU80 9530036M11Rik-201ENSMUST00000138767 1996 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
PtprbB2RU80 Pcdh15-236ENSMUST00000193174 5936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
PtprbB2RU80 Angptl1-202ENSMUST00000111720 1332 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
PtprbB2RU80 5430421F17Rik-202ENSMUST00000210268 2295 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
PtprbB2RU80 Tnik-202ENSMUST00000159308 3831 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
PtprbB2RU80 Otub2-205ENSMUST00000179684 2890 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
PtprbB2RU80 AC122828.2-201ENSMUST00000222511 2880 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
PtprbB2RU80 Fbxw11-201ENSMUST00000076383 4019 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
PtprbB2RU80 Vmn1r213-204ENSMUST00000228758 5975 ntAPPRIS P2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
PtprbB2RU80 Gm1141-201ENSMUST00000101495 2147 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
PtprbB2RU80 Ttc21b-202ENSMUST00000125446 4061 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
PtprbB2RU80 Gk-202ENSMUST00000113978 4279 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
PtprbB2RU80 Olfr452-203ENSMUST00000215719 2728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
PtprbB2RU80 Ighv12-3-201ENSMUST00000103485 353 ntAPPRIS P1 BASIC6.01□□□□□ -1.45
PtprbB2RU80 Clec4n-203ENSMUST00000117130 1136 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
PtprbB2RU80 Spata3-203ENSMUST00000125083 704 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
PtprbB2RU80 Gm16557-201ENSMUST00000159182 191 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
PtprbB2RU80 Olfr92-201ENSMUST00000168659 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.01□□□□□ -1.45
PtprbB2RU80 Gm19840-201ENSMUST00000169624 882 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
PtprbB2RU80 Crnde-205ENSMUST00000179400 651 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
PtprbB2RU80 Rpl31-ps23-201ENSMUST00000180440 388 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
PtprbB2RU80 1810053B23Rik-201ENSMUST00000185242 634 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.7 ms