Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXG2

Chm, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 1, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmQ9QXG2 Mir8099-2-201ENSMUST00000183568 127 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
ChmQ9QXG2 Mir6337-201ENSMUST00000184194 105 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
ChmQ9QXG2 Mir8099-1-201ENSMUST00000184238 127 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
ChmQ9QXG2 Gm21868-201ENSMUST00000185623 1230 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
ChmQ9QXG2 Gm29049-201ENSMUST00000185705 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
ChmQ9QXG2 Gm20924-202ENSMUST00000186910 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
ChmQ9QXG2 Gm20816-202ENSMUST00000187846 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
ChmQ9QXG2 Gm20809-202ENSMUST00000187943 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
ChmQ9QXG2 Gm21728-201ENSMUST00000188442 695 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
ChmQ9QXG2 Gm21889-201ENSMUST00000188487 695 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
ChmQ9QXG2 Gm20932-201ENSMUST00000189115 694 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
ChmQ9QXG2 Gm21721-202ENSMUST00000189253 1225 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
ChmQ9QXG2 Gm21920-201ENSMUST00000190042 695 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
ChmQ9QXG2 Gm28171-201ENSMUST00000190100 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
ChmQ9QXG2 Gm20803-202ENSMUST00000190968 1230 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
ChmQ9QXG2 Gm20867-202ENSMUST00000190987 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
ChmQ9QXG2 Gm37560-201ENSMUST00000194289 1000 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
ChmQ9QXG2 Gm43464-201ENSMUST00000198003 317 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
ChmQ9QXG2 4933417G07Rik-202ENSMUST00000199732 964 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
ChmQ9QXG2 Gm6290-201ENSMUST00000207666 1158 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
ChmQ9QXG2 Gm32052-201ENSMUST00000212073 799 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
ChmQ9QXG2 Gm4780-201ENSMUST00000213206 1242 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
ChmQ9QXG2 Olfr958-203ENSMUST00000217227 3831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
ChmQ9QXG2 Gm33467-201ENSMUST00000221885 652 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
ChmQ9QXG2 AC154515.3-201ENSMUST00000225081 1159 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
ChmQ9QXG2 Mucl2-202ENSMUST00000226584 823 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
ChmQ9QXG2 Rbp7-201ENSMUST00000030848 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
ChmQ9QXG2 Commd3-201ENSMUST00000061158 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
ChmQ9QXG2 Cldn10-202ENSMUST00000071546 1031 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
ChmQ9QXG2 Olfr1113-201ENSMUST00000079966 981 ntAPPRIS P1 BASIC7.39□□□□□ -1.23
ChmQ9QXG2 Tcl1b2-201ENSMUST00000081379 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
ChmQ9QXG2 Pik3r3-201ENSMUST00000030464 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
ChmQ9QXG2 Gm13544-201ENSMUST00000131189 2940 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
ChmQ9QXG2 CT009765.1-201ENSMUST00000219088 2705 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
ChmQ9QXG2 Satb1-214ENSMUST00000176669 4407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
ChmQ9QXG2 Gm45516-201ENSMUST00000211588 4182 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
ChmQ9QXG2 Otogl-201ENSMUST00000165341 8763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
ChmQ9QXG2 Krit1-202ENSMUST00000171023 5582 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
ChmQ9QXG2 Gm2108-201ENSMUST00000165058 2177 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
ChmQ9QXG2 Olfr596-202ENSMUST00000214577 3392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
ChmQ9QXG2 Ap4e1-201ENSMUST00000002063 4600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
ChmQ9QXG2 Mbnl2-202ENSMUST00000167459 4534 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
ChmQ9QXG2 Zkscan7-204ENSMUST00000214957 5650 ntTSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
ChmQ9QXG2 Gm30382-203ENSMUST00000199503 1858 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
ChmQ9QXG2 Meis1-208ENSMUST00000177417 5308 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
ChmQ9QXG2 Ctage5-202ENSMUST00000069430 2869 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
ChmQ9QXG2 Slamf1-201ENSMUST00000015460 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
ChmQ9QXG2 Emcn-202ENSMUST00000122064 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
ChmQ9QXG2 AC152946.1-201ENSMUST00000218446 3474 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
ChmQ9QXG2 Kat6a-202ENSMUST00000110696 9041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
ChmQ9QXG2 AC116476.1-201ENSMUST00000226274 2318 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
ChmQ9QXG2 Gm37772-201ENSMUST00000191635 1394 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
ChmQ9QXG2 Them5-202ENSMUST00000198083 1378 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
ChmQ9QXG2 Sin3a-204ENSMUST00000167715 4961 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
ChmQ9QXG2 Scn8a-205ENSMUST00000108910 11232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
ChmQ9QXG2 Ptprz1-204ENSMUST00000202102 4947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
ChmQ9QXG2 Abi1-205ENSMUST00000123948 3067 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
ChmQ9QXG2 Cbx3-ps3-201ENSMUST00000118595 550 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
ChmQ9QXG2 Tnfsf10-202ENSMUST00000174840 989 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
ChmQ9QXG2 Gm6176-201ENSMUST00000178209 906 ntAPPRIS P1 BASIC7.38□□□□□ -1.23
ChmQ9QXG2 Gm4567-201ENSMUST00000178591 906 ntAPPRIS P1 BASIC7.38□□□□□ -1.23
ChmQ9QXG2 Gm10668-201ENSMUST00000179491 906 ntAPPRIS P1 BASIC7.38□□□□□ -1.23
ChmQ9QXG2 Gm21430-201ENSMUST00000182998 998 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
ChmQ9QXG2 Gm5181-201ENSMUST00000183140 971 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
ChmQ9QXG2 Gm28869-201ENSMUST00000187199 811 ntTSL 3 BASIC7.38□□□□□ -1.23
ChmQ9QXG2 Gm4545-201ENSMUST00000190797 603 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
ChmQ9QXG2 9230114K14Rik-204ENSMUST00000199805 695 ntTSL 3 BASIC7.38□□□□□ -1.23
ChmQ9QXG2 Gm38430-201ENSMUST00000209888 1240 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
ChmQ9QXG2 Olfr1345-ps1-201ENSMUST00000210627 244 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
ChmQ9QXG2 Gm19885-201ENSMUST00000212853 343 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
ChmQ9QXG2 Gm34424-201ENSMUST00000213400 782 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
ChmQ9QXG2 AC159462.2-201ENSMUST00000217559 463 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
ChmQ9QXG2 Gm33782-201ENSMUST00000218518 517 ntTSL 3 BASIC7.38□□□□□ -1.23
ChmQ9QXG2 AC132384.6-201ENSMUST00000218976 1206 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
ChmQ9QXG2 Gm19428-202ENSMUST00000220573 1038 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
ChmQ9QXG2 7420701I03Rik-201ENSMUST00000222157 737 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
ChmQ9QXG2 AC138765.3-201ENSMUST00000227981 423 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
ChmQ9QXG2 Mphosph6-201ENSMUST00000034303 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
ChmQ9QXG2 H2-M11-201ENSMUST00000041964 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
ChmQ9QXG2 Olfr1093-201ENSMUST00000055273 969 ntAPPRIS P1 BASIC7.38□□□□□ -1.23
ChmQ9QXG2 Xlr4a-201ENSMUST00000078775 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
ChmQ9QXG2 Olfr1338-201ENSMUST00000084315 942 ntAPPRIS P2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
ChmQ9QXG2 Dnah10-203ENSMUST00000141137 13862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
ChmQ9QXG2 BC080695-202ENSMUST00000105774 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
ChmQ9QXG2 Abca14-201ENSMUST00000084640 5384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
ChmQ9QXG2 Ndst3-201ENSMUST00000029602 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
ChmQ9QXG2 Gnb1-208ENSMUST00000176637 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
ChmQ9QXG2 Atp13a4-202ENSMUST00000057018 4054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
ChmQ9QXG2 Kel-201ENSMUST00000031899 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
ChmQ9QXG2 Gm38178-201ENSMUST00000194502 2471 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
ChmQ9QXG2 Tcf7-201ENSMUST00000086844 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
ChmQ9QXG2 AC129308.2-203ENSMUST00000224109 2385 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
ChmQ9QXG2 Acp2-201ENSMUST00000002172 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
ChmQ9QXG2 A630072L19Rik-202ENSMUST00000221309 1519 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
ChmQ9QXG2 Gm10773-201ENSMUST00000218071 3935 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
ChmQ9QXG2 4930449A18Rik-201ENSMUST00000094228 2071 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
ChmQ9QXG2 BC053393-201ENSMUST00000050937 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
ChmQ9QXG2 Thap6-201ENSMUST00000191860 3151 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
ChmQ9QXG2 Gm14827-201ENSMUST00000146644 3089 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
ChmQ9QXG2 4921534H16Rik-201ENSMUST00000162370 1392 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82 ms