Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Gm10610-202ENSMUST00000207184 2693 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Col5a3Q9JLI2 Wnk1-224ENSMUST00000203030 8163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Col5a3Q9JLI2 Gm37772-201ENSMUST00000191635 1394 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Col5a3Q9JLI2 Gm37100-201ENSMUST00000193344 1353 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Col5a3Q9JLI2 Lmbrd2-201ENSMUST00000090380 3210 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Col5a3Q9JLI2 Gm28667-201ENSMUST00000189873 2171 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Col5a3Q9JLI2 Mrpl19-201ENSMUST00000032124 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Col5a3Q9JLI2 Gm13114-201ENSMUST00000117605 106 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Col5a3Q9JLI2 A730017C20Rik-203ENSMUST00000118510 785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Col5a3Q9JLI2 Lrrc72-202ENSMUST00000122115 934 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Col5a3Q9JLI2 Gm5401-201ENSMUST00000122444 365 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Col5a3Q9JLI2 Gm11820-201ENSMUST00000139614 664 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Col5a3Q9JLI2 Vmn2r-ps12-201ENSMUST00000175833 623 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Col5a3Q9JLI2 Gm42753-201ENSMUST00000196718 1268 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Col5a3Q9JLI2 Asb17os-202ENSMUST00000200329 497 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Col5a3Q9JLI2 Gm43263-201ENSMUST00000201619 560 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Col5a3Q9JLI2 Gm5418-201ENSMUST00000206932 528 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Col5a3Q9JLI2 Dysf-211ENSMUST00000168387 6501 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Col5a3Q9JLI2 Slc4a4-203ENSMUST00000130041 3335 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Col5a3Q9JLI2 Gm26876-201ENSMUST00000180875 2387 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Col5a3Q9JLI2 AW554918-208ENSMUST00000165400 5351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Col5a3Q9JLI2 AW554918-202ENSMUST00000097643 5351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Col5a3Q9JLI2 Tgfbr1-203ENSMUST00000107725 1713 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Col5a3Q9JLI2 Serpina7-202ENSMUST00000060824 1895 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Col5a3Q9JLI2 Pik3c2g-215ENSMUST00000218528 2712 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Col5a3Q9JLI2 Bmx-202ENSMUST00000112265 3005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Col5a3Q9JLI2 Gpr165-201ENSMUST00000033554 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Col5a3Q9JLI2 Gm13416-201ENSMUST00000117264 1612 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Col5a3Q9JLI2 4930471D02Rik-201ENSMUST00000180815 2075 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Col5a3Q9JLI2 Olfr1500-207ENSMUST00000219674 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Col5a3Q9JLI2 CT030185.1-201ENSMUST00000222940 2289 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Col5a3Q9JLI2 Phc1-208ENSMUST00000160696 4213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Col5a3Q9JLI2 Gm42679-201ENSMUST00000197086 2906 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Col5a3Q9JLI2 Spaca7-201ENSMUST00000010579 762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Col5a3Q9JLI2 Pax6-208ENSMUST00000111088 4427 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Col5a3Q9JLI2 Eif4a2-203ENSMUST00000115341 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Col5a3Q9JLI2 Gm16204-201ENSMUST00000117864 1897 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Col5a3Q9JLI2 Gm7058-201ENSMUST00000119209 902 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Col5a3Q9JLI2 Olfr408-ps1-201ENSMUST00000121710 941 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Col5a3Q9JLI2 Gm12107-201ENSMUST00000132857 889 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Col5a3Q9JLI2 Rpl29-ps5-201ENSMUST00000164794 477 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Col5a3Q9JLI2 Gm29357-201ENSMUST00000186877 698 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Col5a3Q9JLI2 Gm29519-201ENSMUST00000186994 398 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Col5a3Q9JLI2 Gm44361-201ENSMUST00000197960 94 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Col5a3Q9JLI2 Gm36548-202ENSMUST00000200222 494 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Col5a3Q9JLI2 Gm44312-201ENSMUST00000203536 469 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Col5a3Q9JLI2 Spaca7-202ENSMUST00000209428 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Col5a3Q9JLI2 Gm4510-201ENSMUST00000218265 427 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Col5a3Q9JLI2 Olfr923-204ENSMUST00000219798 1068 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
Col5a3Q9JLI2 Olfr923-201ENSMUST00000051238 1068 ntAPPRIS P1 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Col5a3Q9JLI2 Olfr448-201ENSMUST00000058668 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Col5a3Q9JLI2 Tecpr2-201ENSMUST00000165978 7778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Col5a3Q9JLI2 Flnb-201ENSMUST00000052678 9100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Col5a3Q9JLI2 Gm9603-201ENSMUST00000165814 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Col5a3Q9JLI2 Gm3542-201ENSMUST00000169362 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Col5a3Q9JLI2 Alg6-201ENSMUST00000097961 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Col5a3Q9JLI2 Pcdh12-201ENSMUST00000025311 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Col5a3Q9JLI2 Sorbs2-214ENSMUST00000134675 1692 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Col5a3Q9JLI2 Gtf2h1-202ENSMUST00000107644 2187 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Col5a3Q9JLI2 C8a-202ENSMUST00000064873 3617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Col5a3Q9JLI2 AC158986.1-201ENSMUST00000228391 3455 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Col5a3Q9JLI2 Lig3-201ENSMUST00000021039 5957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Col5a3Q9JLI2 Bmpr1b-201ENSMUST00000029948 5349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Col5a3Q9JLI2 Sorbs2-207ENSMUST00000130011 3871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Col5a3Q9JLI2 Otud7b-203ENSMUST00000098849 8046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Col5a3Q9JLI2 Vmn2r121-201ENSMUST00000094491 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Col5a3Q9JLI2 Olfr410-202ENSMUST00000213831 5070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Col5a3Q9JLI2 Olfr1532-ps1-202ENSMUST00000207492 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r33-202ENSMUST00000227418 2414 ntAPPRIS P1 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Col5a3Q9JLI2 Tenm1-201ENSMUST00000016294 8365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Col5a3Q9JLI2 D6Ertd474e-201ENSMUST00000100817 2149 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Col5a3Q9JLI2 Klrb1-201ENSMUST00000112110 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Col5a3Q9JLI2 Amelx-202ENSMUST00000112118 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Col5a3Q9JLI2 Gm15016-201ENSMUST00000117300 720 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Col5a3Q9JLI2 Gm14173-201ENSMUST00000117690 278 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Col5a3Q9JLI2 Gm12618-201ENSMUST00000121754 483 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Col5a3Q9JLI2 4933406K04Rik-202ENSMUST00000124363 1064 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Col5a3Q9JLI2 Gm15322-201ENSMUST00000142621 739 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Col5a3Q9JLI2 Gm28783-201ENSMUST00000188872 359 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Col5a3Q9JLI2 Gm31887-201ENSMUST00000197661 501 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Col5a3Q9JLI2 Mir6906-201ENSMUST00000198998 58 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Col5a3Q9JLI2 Gm44795-201ENSMUST00000205496 319 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Col5a3Q9JLI2 Cx3cl1-205ENSMUST00000211947 377 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Col5a3Q9JLI2 Olfr517-202ENSMUST00000216500 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Col5a3Q9JLI2 AC115793.1-201ENSMUST00000216605 215 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Col5a3Q9JLI2 AC079680.1-202ENSMUST00000219835 654 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Col5a3Q9JLI2 A1cf-203ENSMUST00000224400 1204 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r38-203ENSMUST00000227694 909 ntAPPRIS P1 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Col5a3Q9JLI2 Cmtr1-201ENSMUST00000024816 6380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Col5a3Q9JLI2 Ccdc150-201ENSMUST00000027128 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Col5a3Q9JLI2 Snora44-201ENSMUST00000082670 129 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Col5a3Q9JLI2 Stxbp3-ps-201ENSMUST00000090527 758 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Col5a3Q9JLI2 Tsc1-202ENSMUST00000113867 7682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Col5a3Q9JLI2 Tsc1-201ENSMUST00000028155 7674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Col5a3Q9JLI2 Gm43557-201ENSMUST00000197100 2370 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Col5a3Q9JLI2 Nyap2-202ENSMUST00000113494 4540 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Col5a3Q9JLI2 Osbpl3-202ENSMUST00000090019 4039 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Col5a3Q9JLI2 Gm14935-201ENSMUST00000121528 1708 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
Col5a3Q9JLI2 Pramel4-203ENSMUST00000094520 2297 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
Col5a3Q9JLI2 Il18r1-201ENSMUST00000087983 2826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
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