Protein–RNA interactions for Protein: Q925F3

Rnf144a, E3 ubiquitin-protein ligase RNF144A, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf144aQ925F3 Slc5a9-202ENSMUST00000102720 3393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rnf144aQ925F3 Gm28109-201ENSMUST00000189979 2167 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rnf144aQ925F3 Cldn2-201ENSMUST00000054889 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rnf144aQ925F3 Trrap-215ENSMUST00000213013 12398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rnf144aQ925F3 Hsf3-204ENSMUST00000164693 2076 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rnf144aQ925F3 Gm10778-201ENSMUST00000105315 1497 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rnf144aQ925F3 Gm4767-201ENSMUST00000099439 1497 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rnf144aQ925F3 Vmn2r-ps100-201ENSMUST00000221238 1702 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Rnf144aQ925F3 Fam126b-202ENSMUST00000097724 4581 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rnf144aQ925F3 Mecp2-202ENSMUST00000100750 10538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rnf144aQ925F3 Trpc4-201ENSMUST00000029311 3473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rnf144aQ925F3 Odf2-202ENSMUST00000046571 3959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rnf144aQ925F3 Cntn1-202ENSMUST00000068378 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rnf144aQ925F3 Ms4a13-201ENSMUST00000073380 1375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rnf144aQ925F3 Muc5ac-202ENSMUST00000155534 10752 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rnf144aQ925F3 Tdrkh-202ENSMUST00000166032 5692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rnf144aQ925F3 Smim8-203ENSMUST00000108132 864 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rnf144aQ925F3 Gm12874-201ENSMUST00000117190 913 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Rnf144aQ925F3 Gm13607-201ENSMUST00000117875 539 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Rnf144aQ925F3 Gm13858-201ENSMUST00000118862 671 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Rnf144aQ925F3 Gm11416-201ENSMUST00000119111 863 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Rnf144aQ925F3 Gm14607-201ENSMUST00000119119 491 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Rnf144aQ925F3 Rps25-ps1-201ENSMUST00000119876 378 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Rnf144aQ925F3 Gm11420-201ENSMUST00000120047 402 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Rnf144aQ925F3 Gm11809-201ENSMUST00000120923 950 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Rnf144aQ925F3 Gm13459-201ENSMUST00000121558 646 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Rnf144aQ925F3 Gm15178-201ENSMUST00000132100 472 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rnf144aQ925F3 Pramef12os-201ENSMUST00000133334 767 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rnf144aQ925F3 1810062O18Rik-204ENSMUST00000141265 751 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rnf144aQ925F3 Gm22186-201ENSMUST00000157822 122 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Rnf144aQ925F3 Gm24773-201ENSMUST00000158513 99 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Rnf144aQ925F3 Snrpe-201ENSMUST00000164096 669 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rnf144aQ925F3 Slc29a1-208ENSMUST00000164769 1226 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rnf144aQ925F3 Gm6650-201ENSMUST00000166710 614 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Rnf144aQ925F3 Cabcoco1-202ENSMUST00000166919 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rnf144aQ925F3 Gm21293-201ENSMUST00000170919 864 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rnf144aQ925F3 Gm28006-201ENSMUST00000183841 122 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Rnf144aQ925F3 Gm28703-201ENSMUST00000185312 1159 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rnf144aQ925F3 Gm29600-201ENSMUST00000188687 377 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Rnf144aQ925F3 1700122H20Rik-201ENSMUST00000188950 421 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rnf144aQ925F3 Igkv13-73-1-201ENSMUST00000196767 200 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Rnf144aQ925F3 Gm43287-201ENSMUST00000197747 600 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Rnf144aQ925F3 Gm43560-201ENSMUST00000198100 773 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Rnf144aQ925F3 Gm43487-201ENSMUST00000200331 1031 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Rnf144aQ925F3 Olfr320-201ENSMUST00000204718 928 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rnf144aQ925F3 Gm30954-201ENSMUST00000208715 1210 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rnf144aQ925F3 4930465I24Rik-201ENSMUST00000209697 426 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rnf144aQ925F3 CT025685.1-201ENSMUST00000213716 150 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Rnf144aQ925F3 AC115047.1-201ENSMUST00000213795 322 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Rnf144aQ925F3 Gm9973-202ENSMUST00000220926 166 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Rnf144aQ925F3 AC154417.1-201ENSMUST00000223876 476 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Rnf144aQ925F3 Zfp874a-208ENSMUST00000225479 1092 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Rnf144aQ925F3 CT030645.3-201ENSMUST00000225483 1022 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Rnf144aQ925F3 CT025603.4-201ENSMUST00000225777 413 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Rnf144aQ925F3 AC156790.3-201ENSMUST00000226200 254 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Rnf144aQ925F3 AC102603.1-201ENSMUST00000227481 584 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Rnf144aQ925F3 AC144628.1-201ENSMUST00000227943 466 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Rnf144aQ925F3 Tsx-201ENSMUST00000033691 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rnf144aQ925F3 Olfr1188-201ENSMUST00000090701 968 ntAPPRIS P2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rnf144aQ925F3 Olfr441-201ENSMUST00000095954 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rnf144aQ925F3 St18-201ENSMUST00000043578 5862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rnf144aQ925F3 Gm28157-201ENSMUST00000187675 2165 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rnf144aQ925F3 Gm29146-201ENSMUST00000188904 2165 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rnf144aQ925F3 Gm28772-201ENSMUST00000189554 2165 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rnf144aQ925F3 Gm37547-201ENSMUST00000193277 2165 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rnf144aQ925F3 Olfr449-204ENSMUST00000214687 1921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rnf144aQ925F3 Senp8-207ENSMUST00000217093 1663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rnf144aQ925F3 Tmc2-201ENSMUST00000077988 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rnf144aQ925F3 Sgo1-201ENSMUST00000024736 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rnf144aQ925F3 Gimd1-203ENSMUST00000212594 1432 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rnf144aQ925F3 AC166341.5-201ENSMUST00000222206 1400 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Rnf144aQ925F3 AC122828.2-201ENSMUST00000222511 2880 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Rnf144aQ925F3 Aldh1l2-206ENSMUST00000146640 3938 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rnf144aQ925F3 Olfr743-202ENSMUST00000215793 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rnf144aQ925F3 Gm6982-201ENSMUST00000118752 1560 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Rnf144aQ925F3 Gm37382-201ENSMUST00000193032 1596 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Rnf144aQ925F3 Gykl1-201ENSMUST00000066193 1990 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rnf144aQ925F3 AL450321.1-201ENSMUST00000220600 3550 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Rnf144aQ925F3 Gfpt1-204ENSMUST00000113658 6238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rnf144aQ925F3 R3hdm2-204ENSMUST00000105250 3975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rnf144aQ925F3 Clcn7-204ENSMUST00000160961 3983 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rnf144aQ925F3 Gm38276-201ENSMUST00000192446 1343 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Rnf144aQ925F3 AC158799.1-204ENSMUST00000217441 1321 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rnf144aQ925F3 Gm8204-201ENSMUST00000185696 2144 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Rnf144aQ925F3 Gm16204-201ENSMUST00000117864 1897 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Rnf144aQ925F3 Gm12800-201ENSMUST00000075999 1455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rnf144aQ925F3 Zfp438-201ENSMUST00000063989 3209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rnf144aQ925F3 Tcf4-202ENSMUST00000078486 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rnf144aQ925F3 Morc2a-202ENSMUST00000096441 4594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rnf144aQ925F3 AI182371-207ENSMUST00000226972 1642 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rnf144aQ925F3 Serbp1-201ENSMUST00000042990 15474 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rnf144aQ925F3 Mphosph9-211ENSMUST00000184951 5008 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rnf144aQ925F3 Pax5-201ENSMUST00000014174 8004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rnf144aQ925F3 Slc12a6-201ENSMUST00000028549 6105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rnf144aQ925F3 Gm38147-201ENSMUST00000192397 1798 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Rnf144aQ925F3 Cks1brt-201ENSMUST00000076896 2301 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rnf144aQ925F3 Ppp3r2-201ENSMUST00000029991 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rnf144aQ925F3 Ifit1bl2-201ENSMUST00000087357 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rnf144aQ925F3 Plb1-205ENSMUST00000202201 3539 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Rnf144aQ925F3 AC163040.2-201ENSMUST00000223462 3534 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99.6 ms