Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

Predictions only

Length 2,009 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Gm44788-201ENSMUST00000207605 385 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Ccdc88cQ6VGS5 Gm45693-201ENSMUST00000211391 1157 ntBASIC7.4□□□□□ -1.23
Ccdc88cQ6VGS5 AC154795.1-201ENSMUST00000225611 364 ntBASIC7.4□□□□□ -1.23
Ccdc88cQ6VGS5 Cep70-201ENSMUST00000093795 2606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Ccdc88cQ6VGS5 Ikbkg-217ENSMUST00000164101 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Ccdc88cQ6VGS5 Ikbkg-218ENSMUST00000180230 6785 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Ccdc88cQ6VGS5 Mageb18-202ENSMUST00000113955 2163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Ccdc88cQ6VGS5 Tgif1-211ENSMUST00000186358 1455 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Ccdc88cQ6VGS5 Cnot1-203ENSMUST00000211887 8364 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Ccdc88cQ6VGS5 Gm18879-201ENSMUST00000221187 1537 ntBASIC7.4□□□□□ -1.23
Ccdc88cQ6VGS5 Eif3e-201ENSMUST00000022960 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr559-202ENSMUST00000215657 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Ccdc88cQ6VGS5 Itch-201ENSMUST00000029126 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr1299-202ENSMUST00000213511 1783 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ccdc88cQ6VGS5 Vmn1r218-204ENSMUST00000227160 9558 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ccdc88cQ6VGS5 Gm10184-201ENSMUST00000086423 1939 ntAPPRIS P1 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ccdc88cQ6VGS5 A630001G21Rik-202ENSMUST00000159122 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr1384-202ENSMUST00000213776 4437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ccdc88cQ6VGS5 Myot-201ENSMUST00000025349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ccdc88cQ6VGS5 Gm23979-201ENSMUST00000104071 128 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Ccdc88cQ6VGS5 Gm13137-201ENSMUST00000118035 345 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Ccdc88cQ6VGS5 Zbtb8os-202ENSMUST00000119480 527 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ccdc88cQ6VGS5 Gm2986-201ENSMUST00000121603 382 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Ccdc88cQ6VGS5 Cfap61-212ENSMUST00000152515 640 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ccdc88cQ6VGS5 Mir5107-201ENSMUST00000175586 88 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Ccdc88cQ6VGS5 Gm27853-201ENSMUST00000184176 250 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Ccdc88cQ6VGS5 Gm43241-201ENSMUST00000198375 364 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ccdc88cQ6VGS5 Spcs2-203ENSMUST00000207137 881 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ccdc88cQ6VGS5 Gm8168-201ENSMUST00000209631 948 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Ccdc88cQ6VGS5 4930455C13Rik-201ENSMUST00000218108 1018 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
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Ccdc88cQ6VGS5 AC132260.1-201ENSMUST00000225499 734 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Ccdc88cQ6VGS5 AC137902.1-201ENSMUST00000228184 102 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr350-201ENSMUST00000055130 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ccdc88cQ6VGS5 Sprr2b-201ENSMUST00000061038 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ccdc88cQ6VGS5 Gm37745-201ENSMUST00000193304 8163 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Ccdc88cQ6VGS5 4921511C10Rik-201ENSMUST00000200412 1463 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ccdc88cQ6VGS5 Ptpra-202ENSMUST00000077303 3066 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ccdc88cQ6VGS5 Cyp2c66-201ENSMUST00000087234 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ccdc88cQ6VGS5 4930432O09Rik-201ENSMUST00000219710 1986 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ccdc88cQ6VGS5 Taf1-206ENSMUST00000149274 5954 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ccdc88cQ6VGS5 Lgi1-209ENSMUST00000199812 2262 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ccdc88cQ6VGS5 Gm1965-202ENSMUST00000161362 2405 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ccdc88cQ6VGS5 Clec2g-201ENSMUST00000000254 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ccdc88cQ6VGS5 Cyb5r2-201ENSMUST00000052438 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ccdc88cQ6VGS5 Sla-202ENSMUST00000164163 2952 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ccdc88cQ6VGS5 Itih2-201ENSMUST00000042290 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ccdc88cQ6VGS5 Tln2-202ENSMUST00000040025 12132 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ccdc88cQ6VGS5 Dnm3os-201ENSMUST00000139662 7928 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
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Ccdc88cQ6VGS5 Mup9-202ENSMUST00000118759 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ccdc88cQ6VGS5 Gm12140-201ENSMUST00000121214 544 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Ccdc88cQ6VGS5 Gm14802-201ENSMUST00000121944 1885 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Ccdc88cQ6VGS5 Mup9-204ENSMUST00000122381 864 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ccdc88cQ6VGS5 Mir6367-201ENSMUST00000183385 102 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Ccdc88cQ6VGS5 Nanog-ps2-201ENSMUST00000190988 529 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm18290-201ENSMUST00000202900 844 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
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Ccdc88cQ6VGS5 Olfr1289-202ENSMUST00000207494 1014 ntAPPRIS P2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ccdc88cQ6VGS5 Gm45267-201ENSMUST00000211028 522 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
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Ccdc88cQ6VGS5 Olfr3-202ENSMUST00000213988 2018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ccdc88cQ6VGS5 Tespa1-202ENSMUST00000217702 1102 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
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Ccdc88cQ6VGS5 Nup43-201ENSMUST00000040135 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ccdc88cQ6VGS5 Mup20-201ENSMUST00000074018 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ccdc88cQ6VGS5 Nckap5-203ENSMUST00000094610 739 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ccdc88cQ6VGS5 Mup18-201ENSMUST00000098040 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ccdc88cQ6VGS5 Mup11-202ENSMUST00000098046 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ccdc88cQ6VGS5 Mup10-201ENSMUST00000098047 927 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ccdc88cQ6VGS5 Gm17167-201ENSMUST00000169242 5054 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Ccdc88cQ6VGS5 Vezt-201ENSMUST00000047711 4479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Ccdc88cQ6VGS5 Fam107a-203ENSMUST00000121887 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Ccdc88cQ6VGS5 Etv1-201ENSMUST00000095767 6576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp663-201ENSMUST00000073062 3157 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr66-202ENSMUST00000216303 3080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Ccdc88cQ6VGS5 5830416I19Rik-201ENSMUST00000198687 2627 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Ccdc88cQ6VGS5 Naip2-202ENSMUST00000117913 4823 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr669-203ENSMUST00000214260 2336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Ccdc88cQ6VGS5 A830010M20Rik-203ENSMUST00000100951 4545 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp712-201ENSMUST00000167565 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Ccdc88cQ6VGS5 C79798-201ENSMUST00000131588 1793 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Ccdc88cQ6VGS5 Celf2-204ENSMUST00000114924 8738 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Ccdc88cQ6VGS5 Gm4927-201ENSMUST00000219548 1318 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Ccdc88cQ6VGS5 Lnpep-201ENSMUST00000041047 5181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Ccdc88cQ6VGS5 Gm11271-201ENSMUST00000116054 440 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Ccdc88cQ6VGS5 Gm23884-201ENSMUST00000122687 294 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Ccdc88cQ6VGS5 Gm10658-201ENSMUST00000128125 1241 ntTSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Ccdc88cQ6VGS5 Gm14272-201ENSMUST00000133525 484 ntTSL 3 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Ccdc88cQ6VGS5 4933401B06Rik-202ENSMUST00000142024 1219 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Ccdc88cQ6VGS5 Gm22548-201ENSMUST00000174899 78 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Ccdc88cQ6VGS5 Raet1e-202ENSMUST00000178026 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Ccdc88cQ6VGS5 Gm7891-201ENSMUST00000190284 843 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Ccdc88cQ6VGS5 Igkv4-83-201ENSMUST00000196933 334 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Ccdc88cQ6VGS5 Fxyd4-204ENSMUST00000203433 670 ntTSL 3 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.9 ms