Protein–RNA interactions for Protein: Q6DIC0

Smarca2, Probable global transcription activator SNF2L2, mousemouse

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Length 1,577 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca2Q6DIC0 Vmn1r44-212ENSMUST00000228183 1838 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Smarca2Q6DIC0 Gm28667-201ENSMUST00000189873 2171 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Smarca2Q6DIC0 Perm1-201ENSMUST00000105572 3901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smarca2Q6DIC0 Erc1-203ENSMUST00000183703 8760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smarca2Q6DIC0 Igkv4-78-201ENSMUST00000103343 358 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smarca2Q6DIC0 Trav6-6-201ENSMUST00000103584 344 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smarca2Q6DIC0 Trav6n-5-201ENSMUST00000103611 338 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smarca2Q6DIC0 Gm13013-201ENSMUST00000119087 523 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Smarca2Q6DIC0 Olfr1069-ps1-201ENSMUST00000120755 965 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Smarca2Q6DIC0 Gm4789-201ENSMUST00000121708 1216 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Smarca2Q6DIC0 1700006E09Rik-203ENSMUST00000176722 608 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smarca2Q6DIC0 Trav6d-7-201ENSMUST00000178650 358 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smarca2Q6DIC0 Trav6n-7-201ENSMUST00000179607 358 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smarca2Q6DIC0 Gm6119-201ENSMUST00000193443 1206 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Smarca2Q6DIC0 Trav6d-6-201ENSMUST00000197754 344 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smarca2Q6DIC0 4930480K02Rik-201ENSMUST00000203679 1054 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Smarca2Q6DIC0 AC156832.1-201ENSMUST00000217609 811 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smarca2Q6DIC0 Gm9321-201ENSMUST00000221179 778 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Smarca2Q6DIC0 Mylf-ps-201ENSMUST00000222174 421 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Smarca2Q6DIC0 Olfr771-201ENSMUST00000078914 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smarca2Q6DIC0 Gprasp2-201ENSMUST00000113136 3736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smarca2Q6DIC0 Tmem207-201ENSMUST00000165687 1538 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smarca2Q6DIC0 C530043A13Rik-202ENSMUST00000188155 1512 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smarca2Q6DIC0 Gm29198-201ENSMUST00000190102 1512 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smarca2Q6DIC0 Trmt13-201ENSMUST00000041524 3402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smarca2Q6DIC0 Gm44626-201ENSMUST00000207035 2715 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smarca2Q6DIC0 Fmn1-209ENSMUST00000161731 4262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smarca2Q6DIC0 Qsox2-202ENSMUST00000091263 4011 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smarca2Q6DIC0 Gm18310-201ENSMUST00000206494 3912 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Smarca2Q6DIC0 Gm14935-201ENSMUST00000121528 1708 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Smarca2Q6DIC0 Olfr1380-202ENSMUST00000215360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smarca2Q6DIC0 Uba1y-201ENSMUST00000115894 3981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smarca2Q6DIC0 Gm28112-201ENSMUST00000190898 1875 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Smarca2Q6DIC0 Gm32305-201ENSMUST00000221742 1899 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smarca2Q6DIC0 Bahcc1-203ENSMUST00000122148 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smarca2Q6DIC0 Gm3424-201ENSMUST00000164585 1758 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smarca2Q6DIC0 Igkv6-23-201ENSMUST00000103386 369 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smarca2Q6DIC0 Gm15073-201ENSMUST00000117432 634 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Smarca2Q6DIC0 Gmfg-ps-201ENSMUST00000121071 427 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Smarca2Q6DIC0 Gm6061-201ENSMUST00000175860 492 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Smarca2Q6DIC0 Oaz3-204ENSMUST00000199678 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smarca2Q6DIC0 Gm18290-201ENSMUST00000202900 844 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Smarca2Q6DIC0 Gm45750-201ENSMUST00000211966 354 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Smarca2Q6DIC0 Uqcrh-ps1-201ENSMUST00000038391 270 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Smarca2Q6DIC0 Olfr195-201ENSMUST00000075381 995 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smarca2Q6DIC0 Gm18878-201ENSMUST00000223071 1443 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Smarca2Q6DIC0 Kcnc2-202ENSMUST00000218445 4033 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Smarca2Q6DIC0 Gm15638-203ENSMUST00000154775 2945 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smarca2Q6DIC0 BC064078-202ENSMUST00000131176 2299 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smarca2Q6DIC0 Gm37783-201ENSMUST00000192025 1856 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Smarca2Q6DIC0 AC141476.1-201ENSMUST00000224988 3387 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Smarca2Q6DIC0 Adcy10-202ENSMUST00000111439 5193 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smarca2Q6DIC0 Olfr224-204ENSMUST00000217009 2098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smarca2Q6DIC0 Abca9-201ENSMUST00000044850 6384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smarca2Q6DIC0 Gm5431-203ENSMUST00000109212 3063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smarca2Q6DIC0 Ear1-201ENSMUST00000100691 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smarca2Q6DIC0 Stau2-208ENSMUST00000144138 585 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Smarca2Q6DIC0 Gm6525-201ENSMUST00000193882 1029 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Smarca2Q6DIC0 AC133207.2-201ENSMUST00000218430 237 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smarca2Q6DIC0 AC154481.1-201ENSMUST00000223532 331 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Smarca2Q6DIC0 AC154250.1-201ENSMUST00000224775 489 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
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Smarca2Q6DIC0 Acox1-202ENSMUST00000072948 3743 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Smarca2Q6DIC0 Blm-202ENSMUST00000170315 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smarca2Q6DIC0 Slc26a2-201ENSMUST00000037603 2802 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smarca2Q6DIC0 Smchd1-201ENSMUST00000127430 7052 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Smarca2Q6DIC0 Ifi206-201ENSMUST00000160565 3047 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Smarca2Q6DIC0 Slc7a2-204ENSMUST00000118432 3681 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smarca2Q6DIC0 Gm21846-201ENSMUST00000179257 3073 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Smarca2Q6DIC0 Myh8-202ENSMUST00000108685 2306 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smarca2Q6DIC0 Cep85-202ENSMUST00000121566 3748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smarca2Q6DIC0 Nmur2-201ENSMUST00000037682 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smarca2Q6DIC0 Gpr165-201ENSMUST00000033554 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smarca2Q6DIC0 Errfi1-202ENSMUST00000073600 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smarca2Q6DIC0 Gm7146-201ENSMUST00000116079 739 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Smarca2Q6DIC0 Gm16208-201ENSMUST00000128476 471 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smarca2Q6DIC0 Scarna6-201ENSMUST00000158656 265 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Smarca2Q6DIC0 1700010L04Rik-203ENSMUST00000179662 1015 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smarca2Q6DIC0 Gm4665-201ENSMUST00000183244 561 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smarca2Q6DIC0 Gm19708-201ENSMUST00000199386 543 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smarca2Q6DIC0 AC112956.1-201ENSMUST00000213563 492 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Smarca2Q6DIC0 AC116591.1-201ENSMUST00000227919 351 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Smarca2Q6DIC0 4930550C14Rik-201ENSMUST00000005262 1237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smarca2Q6DIC0 Gm4792-201ENSMUST00000065826 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smarca2Q6DIC0 Vmn1r40-201ENSMUST00000075158 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smarca2Q6DIC0 Lmbrd2-201ENSMUST00000090380 3210 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smarca2Q6DIC0 Vmn1r33-202ENSMUST00000227418 2414 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smarca2Q6DIC0 4833423E24Rik-201ENSMUST00000099923 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smarca2Q6DIC0 Tns1-208ENSMUST00000187584 9916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smarca2Q6DIC0 Olfr1346-202ENSMUST00000207658 4429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smarca2Q6DIC0 Inpp5f-208ENSMUST00000151237 2609 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smarca2Q6DIC0 Gm12051-201ENSMUST00000147771 1341 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
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