Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0L5

Lrrc43, Leucine-rich repeat-containing protein 43, mousemouse

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Length 667 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc43Q3V0L5 Clasp1-214ENSMUST00000189570 5502 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Lrrc43Q3V0L5 A430110L20Rik-202ENSMUST00000181680 2513 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Lrrc43Q3V0L5 Dsg1a-201ENSMUST00000077146 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Lrrc43Q3V0L5 Gm4890-201ENSMUST00000181030 3784 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Lrrc43Q3V0L5 Olfr1410-202ENSMUST00000216553 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Lrrc43Q3V0L5 Gm37003-201ENSMUST00000194702 2827 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Lrrc43Q3V0L5 Nme8-201ENSMUST00000039340 1704 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Lrrc43Q3V0L5 Tfb1m-201ENSMUST00000041003 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Lrrc43Q3V0L5 Gm16508-201ENSMUST00000197066 2742 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Lrrc43Q3V0L5 Palb2-203ENSMUST00000106468 3304 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Lrrc43Q3V0L5 Vmn1r36-201ENSMUST00000226142 1770 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Lrrc43Q3V0L5 Hk1-201ENSMUST00000072357 3639 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Lrrc43Q3V0L5 Crb1-201ENSMUST00000059825 5901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Lrrc43Q3V0L5 Gm15834-201ENSMUST00000129740 2097 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Lrrc43Q3V0L5 Zfp451-202ENSMUST00000044455 11876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Lrrc43Q3V0L5 Bcor-201ENSMUST00000043441 6113 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
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Lrrc43Q3V0L5 Cptp-201ENSMUST00000030950 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Lrrc43Q3V0L5 8430437L04Rik-201ENSMUST00000124829 1663 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Lrrc43Q3V0L5 Arl6-201ENSMUST00000023405 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Lrrc43Q3V0L5 Inpp4a-207ENSMUST00000136846 3576 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Lrrc43Q3V0L5 Gm42568-201ENSMUST00000195639 1841 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Lrrc43Q3V0L5 Gm2974-201ENSMUST00000164512 1990 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Lrrc43Q3V0L5 Oog4-201ENSMUST00000061277 1981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Lrrc43Q3V0L5 Plag1-201ENSMUST00000003369 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Lrrc43Q3V0L5 Dync1i2-207ENSMUST00000112142 2585 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Lrrc43Q3V0L5 Uroc1-202ENSMUST00000164761 3462 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
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Lrrc43Q3V0L5 1700092C02Rik-201ENSMUST00000134397 359 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
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Lrrc43Q3V0L5 Gm24059-201ENSMUST00000157493 312 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
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Lrrc43Q3V0L5 Gm3239-202ENSMUST00000169675 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
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Lrrc43Q3V0L5 Cldn34b4-202ENSMUST00000178974 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Lrrc43Q3V0L5 6720483E21Rik-201ENSMUST00000181654 1120 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
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Lrrc43Q3V0L5 Gm21094-202ENSMUST00000189577 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Lrrc43Q3V0L5 Gm36945-201ENSMUST00000192040 864 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Lrrc43Q3V0L5 Cr1l-204ENSMUST00000193094 2776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Lrrc43Q3V0L5 Gm37876-201ENSMUST00000194490 1591 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Lrrc43Q3V0L5 Igkv8-34-201ENSMUST00000196959 365 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
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Lrrc43Q3V0L5 Sf3b2-201ENSMUST00000025774 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
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Lrrc43Q3V0L5 Itgad-201ENSMUST00000033051 3965 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Lrrc43Q3V0L5 Apoh-201ENSMUST00000000049 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
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Lrrc43Q3V0L5 Fancb-203ENSMUST00000167446 2953 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
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Lrrc43Q3V0L5 Khdc1b-201ENSMUST00000147615 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
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Lrrc43Q3V0L5 Pparg-201ENSMUST00000000450 1767 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Lrrc43Q3V0L5 Olfr1037-202ENSMUST00000213333 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Lrrc43Q3V0L5 B930095G15Rik-201ENSMUST00000130256 4715 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Lrrc43Q3V0L5 Gm8836-201ENSMUST00000198196 1348 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
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Lrrc43Q3V0L5 Akap6-202ENSMUST00000219786 4564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Lrrc43Q3V0L5 Tsr2-202ENSMUST00000112683 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Lrrc43Q3V0L5 Aff1-202ENSMUST00000054979 8323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Lrrc43Q3V0L5 Gm37962-201ENSMUST00000195535 2034 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Lrrc43Q3V0L5 Hacl1-214ENSMUST00000167175 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Lrrc43Q3V0L5 Gm26773-201ENSMUST00000180772 2868 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Lrrc43Q3V0L5 Prss35-202ENSMUST00000179574 3211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Lrrc43Q3V0L5 Xpo5-201ENSMUST00000087031 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Lrrc43Q3V0L5 L3mbtl3-201ENSMUST00000040219 4572 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Lrrc43Q3V0L5 Bgn-201ENSMUST00000033741 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Lrrc43Q3V0L5 BC039771-202ENSMUST00000144661 2753 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Lrrc43Q3V0L5 Gm43319-201ENSMUST00000198036 2270 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Lrrc43Q3V0L5 Lmbrd1-206ENSMUST00000191471 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Lrrc43Q3V0L5 P2ry14-202ENSMUST00000091112 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Lrrc43Q3V0L5 Cd68-202ENSMUST00000108654 1008 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Lrrc43Q3V0L5 Gm24275-201ENSMUST00000116780 146 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Lrrc43Q3V0L5 Gm14159-201ENSMUST00000119832 451 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Lrrc43Q3V0L5 Gm14860-201ENSMUST00000120277 429 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Lrrc43Q3V0L5 Gm5383-201ENSMUST00000121177 617 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Lrrc43Q3V0L5 Gm12155-201ENSMUST00000121267 160 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Lrrc43Q3V0L5 Gm22478-201ENSMUST00000122570 154 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Lrrc43Q3V0L5 Gm11962-201ENSMUST00000145746 255 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Lrrc43Q3V0L5 Sox5os3-202ENSMUST00000154167 765 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Lrrc43Q3V0L5 Gm22216-201ENSMUST00000157557 114 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
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