Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHD6

Snx27, Sorting nexin-27, mousemouse

Predictions only

Length 539 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx27Q3UHD6 AC132465.1-201ENSMUST00000219938 1307 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Snx27Q3UHD6 AC161884.1-201ENSMUST00000225436 2174 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Snx27Q3UHD6 T2-201ENSMUST00000163578 1755 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Snx27Q3UHD6 5830416I19Rik-201ENSMUST00000198687 2627 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Snx27Q3UHD6 Olfr727-202ENSMUST00000215317 2616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Snx27Q3UHD6 Sncaip-206ENSMUST00000178678 3724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Snx27Q3UHD6 Cyp2c66-201ENSMUST00000087234 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Snx27Q3UHD6 Esrrg-202ENSMUST00000110938 5373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Snx27Q3UHD6 Shprh-202ENSMUST00000054814 7225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Snx27Q3UHD6 Gm1527-201ENSMUST00000099170 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Snx27Q3UHD6 Zmat3-201ENSMUST00000029199 7797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Snx27Q3UHD6 Mei1-204ENSMUST00000189540 3718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Snx27Q3UHD6 Golph3l-207ENSMUST00000177390 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Snx27Q3UHD6 Etv1-210ENSMUST00000161980 1939 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Snx27Q3UHD6 Bmx-201ENSMUST00000112263 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Snx27Q3UHD6 Enpp6-201ENSMUST00000039840 4970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Snx27Q3UHD6 Cbx3-ps3-201ENSMUST00000118595 550 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Snx27Q3UHD6 Gm7494-201ENSMUST00000121248 441 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Snx27Q3UHD6 3100003L05Rik-201ENSMUST00000130240 664 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Snx27Q3UHD6 Gm12827-201ENSMUST00000132690 660 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Snx27Q3UHD6 Gm15217-202ENSMUST00000141358 347 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Snx27Q3UHD6 Gm12160-201ENSMUST00000146372 342 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Snx27Q3UHD6 1700057H21Rik-201ENSMUST00000152467 383 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Snx27Q3UHD6 Cfap61-212ENSMUST00000152515 640 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Snx27Q3UHD6 Gm25722-201ENSMUST00000157498 279 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Snx27Q3UHD6 Gm5334-201ENSMUST00000187472 720 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Snx27Q3UHD6 Gm17790-201ENSMUST00000191545 1228 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Snx27Q3UHD6 Gm37191-201ENSMUST00000193346 388 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Snx27Q3UHD6 Gm7804-202ENSMUST00000194187 854 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Snx27Q3UHD6 Gm9504-201ENSMUST00000196322 468 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Snx27Q3UHD6 4930526M16Rik-201ENSMUST00000197305 954 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Snx27Q3UHD6 Gm20223-201ENSMUST00000199932 805 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Snx27Q3UHD6 Gm44296-201ENSMUST00000204689 681 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Snx27Q3UHD6 Gm32816-202ENSMUST00000206497 496 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Snx27Q3UHD6 Gm46203-201ENSMUST00000218130 478 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Snx27Q3UHD6 AC131117.1-201ENSMUST00000225154 1171 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Snx27Q3UHD6 AC132833.4-201ENSMUST00000228313 203 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Snx27Q3UHD6 AC123665.3-201ENSMUST00000228735 1216 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Snx27Q3UHD6 Olfr448-201ENSMUST00000058668 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Snx27Q3UHD6 Gm25587-201ENSMUST00000082498 166 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Snx27Q3UHD6 Gm24621-201ENSMUST00000082679 140 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Snx27Q3UHD6 Ddx19b-201ENSMUST00000040241 6612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Snx27Q3UHD6 Ncoa4-202ENSMUST00000163336 4065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Snx27Q3UHD6 Oscp1-201ENSMUST00000035497 5013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Snx27Q3UHD6 Gm43410-201ENSMUST00000197510 2234 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Snx27Q3UHD6 Gm26806-201ENSMUST00000180403 1519 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Snx27Q3UHD6 Nol8-203ENSMUST00000221142 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Snx27Q3UHD6 Nsd2-203ENSMUST00000075812 7142 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Snx27Q3UHD6 Gm37940-201ENSMUST00000194243 3251 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Snx27Q3UHD6 Hcrtr2-201ENSMUST00000063140 3761 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Snx27Q3UHD6 B930025P03Rik-201ENSMUST00000207718 3085 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Snx27Q3UHD6 Gm38009-201ENSMUST00000194884 3341 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Snx27Q3UHD6 Fam47c-201ENSMUST00000105110 1639 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Snx27Q3UHD6 Adgrl3-207ENSMUST00000118078 4871 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Snx27Q3UHD6 Gm26608-202ENSMUST00000181503 1362 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Snx27Q3UHD6 Tek-201ENSMUST00000071168 4176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Snx27Q3UHD6 Gm39566-201ENSMUST00000210714 3908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Snx27Q3UHD6 Ubxn7-201ENSMUST00000115151 10318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Snx27Q3UHD6 Ate1-208ENSMUST00000216011 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Snx27Q3UHD6 Gm37310-201ENSMUST00000195237 2968 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Snx27Q3UHD6 Cep97-201ENSMUST00000023270 7911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Snx27Q3UHD6 Olfr1351-202ENSMUST00000216030 2489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Snx27Q3UHD6 Kif6-207ENSMUST00000162854 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Snx27Q3UHD6 Olfr1564-204ENSMUST00000213751 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Snx27Q3UHD6 Olfr452-204ENSMUST00000217701 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Snx27Q3UHD6 Specc1-201ENSMUST00000049836 6091 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Snx27Q3UHD6 Slc37a3-201ENSMUST00000090243 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Snx27Q3UHD6 AC124414.1-201ENSMUST00000218033 2946 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Snx27Q3UHD6 Adgrl3-206ENSMUST00000118034 4947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Snx27Q3UHD6 Fam13a-201ENSMUST00000089860 5786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Snx27Q3UHD6 Gm23768-201ENSMUST00000104440 131 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Snx27Q3UHD6 Cst8-202ENSMUST00000109947 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Snx27Q3UHD6 Rpl12-ps1-201ENSMUST00000116168 498 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Snx27Q3UHD6 Gm6654-201ENSMUST00000118950 348 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Snx27Q3UHD6 Gm11370-201ENSMUST00000120583 260 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Snx27Q3UHD6 Gm15859-201ENSMUST00000132069 710 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Snx27Q3UHD6 Gm16098-201ENSMUST00000141926 796 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Snx27Q3UHD6 Gm11963-201ENSMUST00000149826 500 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Snx27Q3UHD6 4933407I08Rik-201ENSMUST00000151215 1294 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Snx27Q3UHD6 4930451E10Rik-202ENSMUST00000152292 557 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Snx27Q3UHD6 Gm25717-201ENSMUST00000158631 353 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Snx27Q3UHD6 Gm16333-201ENSMUST00000161416 318 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Snx27Q3UHD6 Gm8922-201ENSMUST00000170057 1167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Snx27Q3UHD6 Gm5930-202ENSMUST00000178002 489 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Snx27Q3UHD6 D13Ertd608e-201ENSMUST00000179131 417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Snx27Q3UHD6 Gm37285-201ENSMUST00000194465 1139 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Snx27Q3UHD6 Gm44111-201ENSMUST00000204649 399 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Snx27Q3UHD6 Gm34225-203ENSMUST00000206921 572 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Snx27Q3UHD6 4930567H12Rik-201ENSMUST00000212260 955 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Snx27Q3UHD6 Tgm4-206ENSMUST00000215247 951 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Snx27Q3UHD6 AL929555.1-201ENSMUST00000215283 509 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Snx27Q3UHD6 AC167013.4-201ENSMUST00000226712 317 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Snx27Q3UHD6 Dpm2-201ENSMUST00000028151 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Snx27Q3UHD6 Olfr1342-201ENSMUST00000060562 1002 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Snx27Q3UHD6 Mir196a-1-201ENSMUST00000083612 102 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Snx27Q3UHD6 Olfr143-201ENSMUST00000093865 942 ntAPPRIS P2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Snx27Q3UHD6 Pecam1-202ENSMUST00000080853 3283 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Snx27Q3UHD6 AC153501.1-201ENSMUST00000218156 1860 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Snx27Q3UHD6 Vmn1r44-204ENSMUST00000226171 1877 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Snx27Q3UHD6 Sspo-206ENSMUST00000212740 15408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
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