Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIX9

Usp39, U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 2, mousemouse

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Length 564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp39Q3TIX9 Gm29123-201ENSMUST00000185808 3657 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Usp39Q3TIX9 1700054A03Rik-201ENSMUST00000187368 780 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Usp39Q3TIX9 Gm29161-201ENSMUST00000188250 699 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Usp39Q3TIX9 4933400C23Rik-201ENSMUST00000188610 1708 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Usp39Q3TIX9 Gm28413-201ENSMUST00000189369 291 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Usp39Q3TIX9 Gm28667-201ENSMUST00000189873 2171 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Usp39Q3TIX9 Gm29626-202ENSMUST00000191517 425 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Usp39Q3TIX9 Gm7341-201ENSMUST00000192183 926 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Usp39Q3TIX9 Gm2762-203ENSMUST00000201658 1234 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Usp39Q3TIX9 Gpn1-206ENSMUST00000202394 631 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Usp39Q3TIX9 Olfr97-202ENSMUST00000207414 933 ntAPPRIS P1 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Usp39Q3TIX9 Gm6290-201ENSMUST00000207666 1158 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Usp39Q3TIX9 Gm36231-201ENSMUST00000211183 217 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Usp39Q3TIX9 Gm45823-201ENSMUST00000212714 515 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Usp39Q3TIX9 Gm45739-201ENSMUST00000213094 388 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Usp39Q3TIX9 Olfr727-202ENSMUST00000215317 2616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Usp39Q3TIX9 D830013O20Rik-202ENSMUST00000221180 683 ntTSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Usp39Q3TIX9 AC163651.2-202ENSMUST00000222628 1192 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Usp39Q3TIX9 Gm8075-202ENSMUST00000223088 682 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Usp39Q3TIX9 AC154747.4-201ENSMUST00000224802 903 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Usp39Q3TIX9 AC154515.3-201ENSMUST00000225081 1159 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Usp39Q3TIX9 AC161884.1-201ENSMUST00000225436 2174 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Usp39Q3TIX9 CT009556.4-201ENSMUST00000227092 200 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Usp39Q3TIX9 AC125087.1-201ENSMUST00000227552 514 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Usp39Q3TIX9 Ino80c-201ENSMUST00000055012 909 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Usp39Q3TIX9 4930502E18Rik-201ENSMUST00000069209 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Usp39Q3TIX9 Tcl1b2-201ENSMUST00000081379 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Usp39Q3TIX9 n-R5s60-201ENSMUST00000083299 119 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Usp39Q3TIX9 Mir484-201ENSMUST00000093566 67 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Usp39Q3TIX9 Gm6419-201ENSMUST00000097166 429 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Usp39Q3TIX9 Lrp1-201ENSMUST00000049149 14888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Usp39Q3TIX9 Trp53bp1-201ENSMUST00000110647 9405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Usp39Q3TIX9 Dab2-201ENSMUST00000078019 3793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Usp39Q3TIX9 Virma-203ENSMUST00000108307 6571 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Usp39Q3TIX9 Cacnb4-203ENSMUST00000102761 8039 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Usp39Q3TIX9 Mum1l1-201ENSMUST00000113041 4343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Usp39Q3TIX9 Psd4-210ENSMUST00000166388 4181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Usp39Q3TIX9 Olfr1294-202ENSMUST00000208675 1983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Usp39Q3TIX9 Cd59a-203ENSMUST00000168176 1806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Usp39Q3TIX9 Fbxw28-202ENSMUST00000112040 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Usp39Q3TIX9 Clcn5-201ENSMUST00000004428 8390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Usp39Q3TIX9 Gm5431-202ENSMUST00000109210 2971 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Usp39Q3TIX9 Etl4-202ENSMUST00000066509 7197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Usp39Q3TIX9 Atp10d-201ENSMUST00000094710 2365 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Usp39Q3TIX9 Gm37460-201ENSMUST00000191796 2249 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Usp39Q3TIX9 Map7d2-201ENSMUST00000043151 3087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Usp39Q3TIX9 Abcc9-201ENSMUST00000073173 7433 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Usp39Q3TIX9 Cphx1-204ENSMUST00000184016 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Usp39Q3TIX9 Pole2-202ENSMUST00000221411 1641 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Usp39Q3TIX9 Acox1-202ENSMUST00000072948 3743 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Usp39Q3TIX9 Fam49a-202ENSMUST00000069066 9452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
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Usp39Q3TIX9 Cyp4a10-201ENSMUST00000058785 2109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Usp39Q3TIX9 Ttc12-201ENSMUST00000055096 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Usp39Q3TIX9 Vmn2r10-201ENSMUST00000079163 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
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Usp39Q3TIX9 4930509K18Rik-201ENSMUST00000144039 1810 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
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Usp39Q3TIX9 Tceal7-201ENSMUST00000113116 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Usp39Q3TIX9 Rhox4g-201ENSMUST00000115166 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
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Usp39Q3TIX9 Tex35-202ENSMUST00000118207 912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
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Usp39Q3TIX9 Stpg4-203ENSMUST00000187078 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.79□□□□□ -1.32
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Usp39Q3TIX9 Gpr19-210ENSMUST00000203762 498 ntTSL 3 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Usp39Q3TIX9 Olfr440-ps1-201ENSMUST00000204044 917 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
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Usp39Q3TIX9 Gm44176-201ENSMUST00000204336 276 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
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Usp39Q3TIX9 9530050K03Rik-201ENSMUST00000221663 1299 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Usp39Q3TIX9 AC132239.1-201ENSMUST00000223157 773 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Usp39Q3TIX9 AC131117.2-202ENSMUST00000224539 547 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Usp39Q3TIX9 AC154640.3-201ENSMUST00000227492 846 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Usp39Q3TIX9 Aph1c-201ENSMUST00000057261 715 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Usp39Q3TIX9 Gm2531-201ENSMUST00000075609 512 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Usp39Q3TIX9 Gm10145-201ENSMUST00000077776 462 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Usp39Q3TIX9 Rhox4e-201ENSMUST00000089075 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Usp39Q3TIX9 Olfr458-201ENSMUST00000090156 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Usp39Q3TIX9 Car1-201ENSMUST00000094365 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Usp39Q3TIX9 Gm10705-201ENSMUST00000098980 461 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
Usp39Q3TIX9 Asap1-206ENSMUST00000175799 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Usp39Q3TIX9 Fam196b-201ENSMUST00000093192 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
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