Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Gm42492-201ENSMUST00000195780 2915 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Sh3bp1P55194 Fktn-203ENSMUST00000128667 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Sh3bp1P55194 4932416K20Rik-201ENSMUST00000093229 3554 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Sh3bp1P55194 Soat1-207ENSMUST00000189661 8371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Sh3bp1P55194 Dnah17-204ENSMUST00000132685 13612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Sh3bp1P55194 Igkv12-38-201ENSMUST00000103371 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Sh3bp1P55194 Tceal7-201ENSMUST00000113116 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Sh3bp1P55194 Gm13414-201ENSMUST00000117516 727 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Sh3bp1P55194 Gm6884-201ENSMUST00000119318 615 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Sh3bp1P55194 Gm11726-201ENSMUST00000121028 424 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Sh3bp1P55194 Gm14796-201ENSMUST00000121216 959 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Sh3bp1P55194 Gm10660-201ENSMUST00000148610 1203 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Sh3bp1P55194 Gtsf1-209ENSMUST00000153930 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Sh3bp1P55194 Phf11d-203ENSMUST00000161031 1130 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Sh3bp1P55194 Gm7341-201ENSMUST00000192183 926 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Sh3bp1P55194 Gm18698-201ENSMUST00000192327 668 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Sh3bp1P55194 Gm35108-201ENSMUST00000194321 699 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Sh3bp1P55194 Gm37901-201ENSMUST00000195107 514 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Sh3bp1P55194 Gm33191-201ENSMUST00000195604 699 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Sh3bp1P55194 B230112I24Rik-201ENSMUST00000203953 1229 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Sh3bp1P55194 Gm44590-201ENSMUST00000206161 391 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Sh3bp1P55194 E230029C05Rik-204ENSMUST00000208266 875 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Sh3bp1P55194 Cd209a-204ENSMUST00000208960 844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Sh3bp1P55194 Gm7419-201ENSMUST00000209962 925 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Sh3bp1P55194 Noxred1-201ENSMUST00000021423 1101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Sh3bp1P55194 Olfr643-202ENSMUST00000217217 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Sh3bp1P55194 AC155941.3-201ENSMUST00000218476 308 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Sh3bp1P55194 Gm5080-201ENSMUST00000220341 743 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Sh3bp1P55194 AL591207.2-201ENSMUST00000222991 337 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Sh3bp1P55194 Myl12a-201ENSMUST00000024846 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Sh3bp1P55194 Gm37891-201ENSMUST00000195585 1326 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Sh3bp1P55194 Gm45201-201ENSMUST00000207187 2679 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Sh3bp1P55194 Ect2-202ENSMUST00000108298 4024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Sh3bp1P55194 Smc5-201ENSMUST00000087556 5683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Sh3bp1P55194 Bdnf-201ENSMUST00000053317 4266 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Sh3bp1P55194 Atf7-211ENSMUST00000184906 1457 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Sh3bp1P55194 Tlr11-201ENSMUST00000063570 2993 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Sh3bp1P55194 Cyp2j8-201ENSMUST00000124729 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Sh3bp1P55194 Gm37382-201ENSMUST00000193032 1596 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Sh3bp1P55194 Prdm9-206ENSMUST00000167994 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Sh3bp1P55194 Gm10030-203ENSMUST00000197321 3824 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Sh3bp1P55194 4933424M12Rik-201ENSMUST00000132609 1944 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Sh3bp1P55194 Dnah11-201ENSMUST00000084806 14072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Sh3bp1P55194 Gm31805-201ENSMUST00000211921 4031 ntTSL 3 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Sh3bp1P55194 Gm43880-201ENSMUST00000203635 2162 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Sh3bp1P55194 Aox4-201ENSMUST00000040442 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Sh3bp1P55194 Trp63-202ENSMUST00000065523 5257 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Sh3bp1P55194 Slc30a7-201ENSMUST00000067485 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Sh3bp1P55194 Gm37086-201ENSMUST00000193082 3452 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Sh3bp1P55194 Cd44-201ENSMUST00000005218 5614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Sh3bp1P55194 Meig1-202ENSMUST00000115081 421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Sh3bp1P55194 Gm14279-201ENSMUST00000117142 332 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Sh3bp1P55194 Rpl35a-ps2-201ENSMUST00000117444 333 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Sh3bp1P55194 Gm10243-201ENSMUST00000117571 333 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Sh3bp1P55194 Gm13744-201ENSMUST00000118953 850 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Sh3bp1P55194 Gm15971-201ENSMUST00000119372 211 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Sh3bp1P55194 Gm14065-201ENSMUST00000120848 585 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Sh3bp1P55194 Gm14787-201ENSMUST00000121236 388 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Sh3bp1P55194 Tmc5-204ENSMUST00000121744 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Sh3bp1P55194 Rpl35a-ps4-201ENSMUST00000121779 333 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Sh3bp1P55194 Gm5970-201ENSMUST00000131638 1216 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Sh3bp1P55194 Klra8-201ENSMUST00000014476 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Sh3bp1P55194 Gm14764-201ENSMUST00000147130 313 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Sh3bp1P55194 Rpl35a-ps3-201ENSMUST00000147311 333 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Sh3bp1P55194 Rpl35a-ps6-201ENSMUST00000148282 333 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Sh3bp1P55194 4932435O22Rik-202ENSMUST00000148405 3406 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Sh3bp1P55194 Gm16070-202ENSMUST00000149914 2146 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Sh3bp1P55194 Gm24442-201ENSMUST00000157238 327 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Sh3bp1P55194 4930431P03Rik-202ENSMUST00000166127 4237 ntTSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Sh3bp1P55194 Olfr331-202ENSMUST00000170501 957 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
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Sh3bp1P55194 Gm17202-201ENSMUST00000171723 951 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Sh3bp1P55194 Hspe1-ps3-201ENSMUST00000172726 277 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Sh3bp1P55194 Mir199b-201ENSMUST00000175066 110 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
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Sh3bp1P55194 Mir6769b-201ENSMUST00000184793 60 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Sh3bp1P55194 C730036E19Rik-201ENSMUST00000188305 1102 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Sh3bp1P55194 Gm19739-201ENSMUST00000195941 153 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Sh3bp1P55194 Gm8920-201ENSMUST00000196153 924 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Sh3bp1P55194 Ighv8-15-201ENSMUST00000197770 294 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Sh3bp1P55194 Gm43168-201ENSMUST00000201039 1612 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Sh3bp1P55194 Gm42734-201ENSMUST00000201656 878 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Sh3bp1P55194 Gm20136-201ENSMUST00000207501 891 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Sh3bp1P55194 Gm45181-201ENSMUST00000207878 449 ntTSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Sh3bp1P55194 Olfr348-202ENSMUST00000213498 3540 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Sh3bp1P55194 AC124778.1-201ENSMUST00000216013 162 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Sh3bp1P55194 Olfr1500-206ENSMUST00000217079 1025 ntAPPRIS P1 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Sh3bp1P55194 Olfr1275-203ENSMUST00000217539 1661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Sh3bp1P55194 AC120002.1-201ENSMUST00000218456 331 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Sh3bp1P55194 Glrx-201ENSMUST00000022082 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Sh3bp1P55194 A730091E23Rik-201ENSMUST00000221700 3825 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Sh3bp1P55194 AC133598.4-201ENSMUST00000224577 454 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Sh3bp1P55194 CT010470.1-201ENSMUST00000225364 1876 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Sh3bp1P55194 Vmn1r176-203ENSMUST00000226767 2536 ntAPPRIS P1 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Sh3bp1P55194 AC166574.5-201ENSMUST00000227438 1432 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Sh3bp1P55194 Vmn1r176-205ENSMUST00000227661 2507 ntAPPRIS P1 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Sh3bp1P55194 Vmn1r176-206ENSMUST00000228280 2532 ntAPPRIS P1 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Sh3bp1P55194 Vmn1r52-208ENSMUST00000228665 3226 ntAPPRIS P1 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Sh3bp1P55194 Efcab2-201ENSMUST00000027775 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Sh3bp1P55194 Gbp9-201ENSMUST00000031238 4381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
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