Protein–RNA interactions for Protein: P55066

Ncan, Neurocan core protein, mousemouse

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Length 1,268 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcanP55066 Fkbp1a-ps2-201ENSMUST00000219474 311 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
NcanP55066 AL591207.2-201ENSMUST00000222991 337 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
NcanP55066 Tpbpa-202ENSMUST00000225275 642 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
NcanP55066 AC122290.1-201ENSMUST00000225631 1078 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
NcanP55066 AC138765.3-201ENSMUST00000227981 423 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
NcanP55066 1810024B03Rik-201ENSMUST00000056146 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
NcanP55066 Olfr114-201ENSMUST00000076914 1000 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
NcanP55066 Gm36388-201ENSMUST00000191663 1675 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
NcanP55066 Gsdmc4-202ENSMUST00000188108 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
NcanP55066 Mtrr-201ENSMUST00000045827 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
NcanP55066 Slc25a53-203ENSMUST00000113070 3140 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
NcanP55066 Ctnnd1-203ENSMUST00000067232 6119 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
NcanP55066 Uvssa-204ENSMUST00000202816 7165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
NcanP55066 Akap13-201ENSMUST00000166315 12543 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
NcanP55066 Rasef-202ENSMUST00000102837 5158 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
NcanP55066 Lnpep-201ENSMUST00000041047 5181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
NcanP55066 Hmgn3-203ENSMUST00000185315 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
NcanP55066 Mpv17l-203ENSMUST00000128757 3089 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
NcanP55066 Gbp11-201ENSMUST00000100960 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
NcanP55066 C130071C03Rik-201ENSMUST00000131907 3590 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
NcanP55066 Itgae-201ENSMUST00000006101 3845 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
NcanP55066 Olfr1394-202ENSMUST00000216273 3024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
NcanP55066 Ano3-201ENSMUST00000099623 6705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
NcanP55066 Tmcc1-203ENSMUST00000172510 2612 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
NcanP55066 Lrrtm3-201ENSMUST00000105439 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
NcanP55066 Olfr1199-202ENSMUST00000124021 2967 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
NcanP55066 Bnip3l-201ENSMUST00000022634 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
NcanP55066 Calcr-202ENSMUST00000115622 3721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
NcanP55066 Gm31049-201ENSMUST00000201516 1302 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
NcanP55066 Gm15638-201ENSMUST00000128159 2062 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
NcanP55066 Exoc4-201ENSMUST00000052266 4824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
NcanP55066 Hmgn5-201ENSMUST00000033597 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
NcanP55066 Dnajc6-201ENSMUST00000038207 5258 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
NcanP55066 Avpr1b-201ENSMUST00000027690 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
NcanP55066 A130010J15Rik-203ENSMUST00000160822 3793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
NcanP55066 Cmtr2-201ENSMUST00000056972 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
NcanP55066 Plec-218ENSMUST00000169714 15001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
NcanP55066 Plec-201ENSMUST00000023226 15001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
NcanP55066 Eif4g2-213ENSMUST00000162415 7995 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
NcanP55066 Plch1-201ENSMUST00000048134 6259 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
NcanP55066 Adgre1-202ENSMUST00000086763 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
NcanP55066 Spin2d-201ENSMUST00000114517 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
NcanP55066 Gm11504-201ENSMUST00000120211 173 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
NcanP55066 Olfr408-ps1-201ENSMUST00000121710 941 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
NcanP55066 Gm13029-201ENSMUST00000137283 594 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
NcanP55066 Cbx3-ps6-201ENSMUST00000181108 552 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
NcanP55066 Gm26970-201ENSMUST00000182990 964 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
NcanP55066 Gm28941-201ENSMUST00000185536 1017 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
NcanP55066 Gm37974-201ENSMUST00000193668 220 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
NcanP55066 Gm43383-201ENSMUST00000195981 469 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
NcanP55066 Gm44312-201ENSMUST00000203536 469 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
NcanP55066 Gm39078-201ENSMUST00000207973 704 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
NcanP55066 Mobp-206ENSMUST00000214943 435 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
NcanP55066 Glipr1l3-201ENSMUST00000220085 892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
NcanP55066 AC158521.1-202ENSMUST00000224352 645 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
NcanP55066 AC122858.1-202ENSMUST00000228290 986 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
NcanP55066 Lalba-201ENSMUST00000023726 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
NcanP55066 Fabp2-201ENSMUST00000023820 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
NcanP55066 Olfr726-201ENSMUST00000072370 966 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
NcanP55066 Cbx3-ps7-201ENSMUST00000081455 552 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
NcanP55066 Vmn1r50-201ENSMUST00000081706 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
NcanP55066 Olfr1085-201ENSMUST00000099879 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
NcanP55066 Msantd4-201ENSMUST00000047173 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
NcanP55066 Abcc12-201ENSMUST00000080115 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
NcanP55066 Ccdc80-202ENSMUST00000099498 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
NcanP55066 Rubcnl-201ENSMUST00000036072 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
NcanP55066 Gm44130-201ENSMUST00000205157 3004 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
NcanP55066 4930565N06Rik-201ENSMUST00000153572 2416 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
NcanP55066 A4gnt-201ENSMUST00000042553 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
NcanP55066 Gm28440-201ENSMUST00000186328 1499 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
NcanP55066 Gm28472-202ENSMUST00000190133 1499 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
NcanP55066 Gm28789-202ENSMUST00000190429 1499 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
NcanP55066 Gm8995-202ENSMUST00000208417 3490 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
NcanP55066 9330102E08Rik-201ENSMUST00000204642 3843 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
NcanP55066 Tcp10c-201ENSMUST00000097403 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
NcanP55066 Ptprr-202ENSMUST00000105271 2856 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
NcanP55066 Rdh1-201ENSMUST00000073639 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
NcanP55066 E430024I08Rik-208ENSMUST00000223312 1573 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
NcanP55066 Grik1-202ENSMUST00000072256 3655 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
NcanP55066 Tmem245-201ENSMUST00000068792 15981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
NcanP55066 Gm42940-201ENSMUST00000200361 2362 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
NcanP55066 Gm42685-201ENSMUST00000200378 2390 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
NcanP55066 Ptk2b-208ENSMUST00000178730 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
NcanP55066 Gm43331-201ENSMUST00000197991 1689 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
NcanP55066 Gm10466-201ENSMUST00000101450 2466 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
NcanP55066 Dcn-202ENSMUST00000163448 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
NcanP55066 Ctsr-201ENSMUST00000021889 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
NcanP55066 Rgs22-203ENSMUST00000172831 4006 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
NcanP55066 Pecam1-203ENSMUST00000103069 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
NcanP55066 Rtel1-201ENSMUST00000048608 4135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
NcanP55066 Gm7982-202ENSMUST00000136313 1536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
NcanP55066 C1qtnf7-201ENSMUST00000076939 3879 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
NcanP55066 Gm37138-201ENSMUST00000194564 2089 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
NcanP55066 Mageb18-202ENSMUST00000113955 2163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
NcanP55066 Gm28704-201ENSMUST00000186589 2169 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
NcanP55066 Gm29636-201ENSMUST00000188149 2169 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
NcanP55066 Gm28839-201ENSMUST00000189579 2171 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
NcanP55066 Olfr1247-203ENSMUST00000216424 2164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
NcanP55066 Ddb1-201ENSMUST00000025649 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
NcanP55066 3110035E14Rik-201ENSMUST00000088666 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
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