Protein–RNA interactions for Protein: P50207

Hoxc13, Homeobox protein Hox-C13, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc13P50207 Mir425-201ENSMUST00000083645 85 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxc13P50207 Ankub1-201ENSMUST00000099091 2696 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxc13P50207 Gm3629-201ENSMUST00000171706 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxc13P50207 Amot-201ENSMUST00000112835 6519 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxc13P50207 Gm33027-201ENSMUST00000206093 4664 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxc13P50207 Lrrc63-201ENSMUST00000022574 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxc13P50207 Atp8b5-204ENSMUST00000107942 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxc13P50207 Adad1-201ENSMUST00000029274 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxc13P50207 Kirrel3os-201ENSMUST00000066604 3799 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxc13P50207 Dcdc5-201ENSMUST00000037284 3093 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxc13P50207 Kif24-202ENSMUST00000108055 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxc13P50207 Gm14802-201ENSMUST00000121944 1885 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxc13P50207 Srrm4os-201ENSMUST00000126959 3360 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxc13P50207 Gm43557-201ENSMUST00000197100 2370 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Hoxc13P50207 Olfr1500-205ENSMUST00000216287 2178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Hoxc13P50207 Greb1-212ENSMUST00000162112 8058 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Hoxc13P50207 Hecw2-203ENSMUST00000120904 11263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Hoxc13P50207 Gm42994-201ENSMUST00000195964 2549 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Hoxc13P50207 Bdnf-204ENSMUST00000111044 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Hoxc13P50207 Stra6l-201ENSMUST00000030011 3606 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Hoxc13P50207 Gm37169-201ENSMUST00000195599 4161 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Hoxc13P50207 Pde10a-207ENSMUST00000115722 3673 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Hoxc13P50207 Sap30bp-203ENSMUST00000140991 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Hoxc13P50207 Smad5-202ENSMUST00000109874 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Hoxc13P50207 Gm29017-201ENSMUST00000190598 2092 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Hoxc13P50207 4930422C21Rik-201ENSMUST00000212419 2362 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Hoxc13P50207 Epg5-201ENSMUST00000044622 9672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Hoxc13P50207 Adgrl3-206ENSMUST00000118034 4947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Hoxc13P50207 Trdv4-201ENSMUST00000103679 444 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Hoxc13P50207 Rnu11-201ENSMUST00000104135 134 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Hoxc13P50207 Olfr26-201ENSMUST00000104874 931 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Hoxc13P50207 Sirpb1c-205ENSMUST00000108354 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Hoxc13P50207 Gm12842-201ENSMUST00000117298 476 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Hoxc13P50207 Gm15216-201ENSMUST00000118058 277 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Hoxc13P50207 Gm8534-201ENSMUST00000118553 766 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Hoxc13P50207 Gm14614-201ENSMUST00000119873 384 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Hoxc13P50207 Gm14531-201ENSMUST00000120845 285 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Hoxc13P50207 Gm14038-201ENSMUST00000121500 807 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Hoxc13P50207 Mpv17l-202ENSMUST00000124947 768 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Hoxc13P50207 Gm8922-201ENSMUST00000170057 1167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Hoxc13P50207 Gm21761-201ENSMUST00000179502 516 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Hoxc13P50207 Mir8097-201ENSMUST00000185150 119 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Hoxc13P50207 Gm38177-201ENSMUST00000192213 1040 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Hoxc13P50207 Gm43383-201ENSMUST00000195981 469 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Hoxc13P50207 Gm43160-201ENSMUST00000196453 421 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Hoxc13P50207 Gm19175-201ENSMUST00000199895 916 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Hoxc13P50207 Gm17834-201ENSMUST00000204322 891 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Hoxc13P50207 Gm17918-201ENSMUST00000205315 574 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Hoxc13P50207 Gm34829-202ENSMUST00000216017 1131 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Hoxc13P50207 AC163032.1-201ENSMUST00000220671 2970 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Hoxc13P50207 AC123656.1-201ENSMUST00000227121 581 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Hoxc13P50207 Il20-201ENSMUST00000027673 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Hoxc13P50207 Pifo-202ENSMUST00000066319 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Hoxc13P50207 Gm29486-201ENSMUST00000088648 372 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Hoxc13P50207 Sprr2a3-201ENSMUST00000090872 682 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Hoxc13P50207 Sult2a3-201ENSMUST00000098809 1018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Hoxc13P50207 Scn11a-201ENSMUST00000070617 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Hoxc13P50207 Olfr11-202ENSMUST00000205631 3265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Hoxc13P50207 Gsdmc-201ENSMUST00000110125 2405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Hoxc13P50207 Zfp106-201ENSMUST00000055241 9085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Hoxc13P50207 Rag2-202ENSMUST00000111227 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Hoxc13P50207 AC132465.1-201ENSMUST00000219938 1307 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Hoxc13P50207 Scn3a-201ENSMUST00000066432 9560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Hoxc13P50207 Mndal-201ENSMUST00000111210 1907 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Hoxc13P50207 Psg-ps1-202ENSMUST00000206181 1943 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Hoxc13P50207 Myot-201ENSMUST00000025349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Hoxc13P50207 Vmn2r9-201ENSMUST00000170419 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Hoxc13P50207 CT025566.1-202ENSMUST00000224800 2511 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Hoxc13P50207 Slc26a2-201ENSMUST00000037603 2802 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Hoxc13P50207 Olfr716-205ENSMUST00000214819 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Hoxc13P50207 Oscp1-201ENSMUST00000035497 5013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Hoxc13P50207 Usp40-201ENSMUST00000040783 5049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Hoxc13P50207 Gm15789-201ENSMUST00000118992 1359 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Hoxc13P50207 Gm43363-201ENSMUST00000201590 2647 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Hoxc13P50207 Gm15097-201ENSMUST00000101180 2029 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Hoxc13P50207 Gm15107-201ENSMUST00000112796 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Hoxc13P50207 Gm15080-201ENSMUST00000112804 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Hoxc13P50207 Ott-201ENSMUST00000177554 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Hoxc13P50207 Ott-202ENSMUST00000177606 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Hoxc13P50207 Gm15085-201ENSMUST00000178169 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Hoxc13P50207 Ott-203ENSMUST00000179348 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Hoxc13P50207 Kat7-201ENSMUST00000072621 3324 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Hoxc13P50207 Gm12292-201ENSMUST00000122911 2433 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxc13P50207 Nr2c1-203ENSMUST00000105290 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxc13P50207 Muc6-203ENSMUST00000190907 8757 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxc13P50207 Lats1-203ENSMUST00000217931 4186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxc13P50207 Lats1-201ENSMUST00000040043 4155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxc13P50207 Gm26981-201ENSMUST00000182453 3169 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxc13P50207 Gm43285-201ENSMUST00000196563 3592 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxc13P50207 Akap13-201ENSMUST00000166315 12543 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxc13P50207 Tmem232-202ENSMUST00000086722 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxc13P50207 Gm43421-201ENSMUST00000200044 2905 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxc13P50207 Scaper-204ENSMUST00000216595 2911 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxc13P50207 BC064078-202ENSMUST00000131176 2299 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxc13P50207 Phlpp2-201ENSMUST00000034175 7839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxc13P50207 Igkv6-20-201ENSMUST00000103388 375 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxc13P50207 Rps12-ps10-201ENSMUST00000117447 399 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxc13P50207 Gm4985-201ENSMUST00000118300 1233 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxc13P50207 Gm13222-201ENSMUST00000119638 138 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Hoxc13P50207 Rps12-ps19-201ENSMUST00000119773 400 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.5 ms