Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 AC154563.1-201ENSMUST00000228317 442 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
PtprmP28828 Ctnnd1-207ENSMUST00000111676 5852 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
PtprmP28828 Ctnnd1-209ENSMUST00000111678 5870 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
PtprmP28828 Kif1b-203ENSMUST00000060537 10233 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
PtprmP28828 Tas1r3-201ENSMUST00000030949 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
PtprmP28828 Ap5m1-201ENSMUST00000037473 6321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
PtprmP28828 Olfr1026-203ENSMUST00000219615 1465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
PtprmP28828 Ttc28-206ENSMUST00000156290 10688 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
PtprmP28828 Kcnab1-201ENSMUST00000049230 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
PtprmP28828 Cbll1-203ENSMUST00000101499 3900 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
PtprmP28828 Scn4a-201ENSMUST00000021056 6598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
PtprmP28828 Gm33326-201ENSMUST00000209741 3815 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
PtprmP28828 Gm30382-203ENSMUST00000199503 1858 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
PtprmP28828 Gm44021-201ENSMUST00000203055 3516 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
PtprmP28828 Usp45-201ENSMUST00000040429 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
PtprmP28828 Mapk10-202ENSMUST00000112846 2617 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
PtprmP28828 Bdp1-204ENSMUST00000109379 7567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
PtprmP28828 Pdgfra-201ENSMUST00000000476 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
PtprmP28828 Flnb-201ENSMUST00000052678 9100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
PtprmP28828 Cacna1c-209ENSMUST00000187386 6906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
PtprmP28828 Rad21-201ENSMUST00000022927 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
PtprmP28828 March1-201ENSMUST00000039540 2733 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
PtprmP28828 Igf2bp1-201ENSMUST00000013559 8378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
PtprmP28828 A330015K06Rik-201ENSMUST00000195489 4286 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
PtprmP28828 Gm10826-201ENSMUST00000215366 3304 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
PtprmP28828 Cfap58-201ENSMUST00000066308 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
PtprmP28828 Spag9-205ENSMUST00000103168 6840 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
PtprmP28828 Itgae-202ENSMUST00000102537 3825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
PtprmP28828 Gm15766-201ENSMUST00000118025 813 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
PtprmP28828 Olfr1063-ps1-201ENSMUST00000118807 942 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
PtprmP28828 Gm5970-201ENSMUST00000131638 1216 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
PtprmP28828 Gm11820-201ENSMUST00000139614 664 ntTSL 3 BASIC9.53□□□□□ -0.88
PtprmP28828 Gm4997-201ENSMUST00000154056 360 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
PtprmP28828 Gm20506-201ENSMUST00000172952 589 ntTSL 3 BASIC9.53□□□□□ -0.88
PtprmP28828 Gm26738-201ENSMUST00000181312 601 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
PtprmP28828 Gm8192-201ENSMUST00000182196 958 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
PtprmP28828 Klk1b7-ps-202ENSMUST00000183762 619 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
PtprmP28828 Ighv5-3-201ENSMUST00000195336 322 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
PtprmP28828 Olfr519-202ENSMUST00000202706 945 ntAPPRIS P1 BASIC9.53□□□□□ -0.88
PtprmP28828 Gm18914-201ENSMUST00000214625 616 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
PtprmP28828 AC170913.1-201ENSMUST00000221418 758 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
PtprmP28828 AC123705.4-203ENSMUST00000221566 380 ntTSL 3 BASIC9.53□□□□□ -0.88
PtprmP28828 AC161884.2-201ENSMUST00000224513 227 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
PtprmP28828 Vmn1r11-201ENSMUST00000071304 900 ntAPPRIS P2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
PtprmP28828 Mapk1ip1l-202ENSMUST00000166743 4542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
PtprmP28828 Musk-201ENSMUST00000081919 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
PtprmP28828 C87436-201ENSMUST00000050497 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
PtprmP28828 Zfp142-202ENSMUST00000066986 5756 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
PtprmP28828 Zzef1-201ENSMUST00000069395 11150 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
PtprmP28828 5330413P13Rik-203ENSMUST00000150466 2173 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
PtprmP28828 Sec24c-201ENSMUST00000048657 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
PtprmP28828 Amy1-202ENSMUST00000106540 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
PtprmP28828 Ank3-210ENSMUST00000182155 6375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
PtprmP28828 AC123629.1-201ENSMUST00000225669 1364 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
PtprmP28828 Sytl4-203ENSMUST00000113297 3306 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
PtprmP28828 Akap7-201ENSMUST00000041984 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
PtprmP28828 Pcdh15-226ENSMUST00000151116 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
PtprmP28828 Gm37321-201ENSMUST00000195742 1872 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
PtprmP28828 Cyp4a10-201ENSMUST00000058785 2109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
PtprmP28828 Phf6-201ENSMUST00000078944 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
PtprmP28828 Zdhhc9-202ENSMUST00000088935 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
PtprmP28828 Calcr-205ENSMUST00000171613 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
PtprmP28828 Irgm2-203ENSMUST00000209079 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
PtprmP28828 Naip1-204ENSMUST00000222155 5361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
PtprmP28828 Gm20486-201ENSMUST00000101544 128 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
PtprmP28828 Gm14295-201ENSMUST00000118012 1213 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
PtprmP28828 Gm14520-201ENSMUST00000119258 387 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
PtprmP28828 Gimap4-205ENSMUST00000121957 775 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
PtprmP28828 Gm15473-201ENSMUST00000140746 1179 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
PtprmP28828 1700047F07Rik-202ENSMUST00000143064 463 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
PtprmP28828 Gm22820-201ENSMUST00000157205 329 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
PtprmP28828 Gm3715-201ENSMUST00000172308 617 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
PtprmP28828 Gm3605-201ENSMUST00000185858 440 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
PtprmP28828 1700028M03Rik-201ENSMUST00000185938 476 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
PtprmP28828 Mrgpra14-201ENSMUST00000189782 913 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
PtprmP28828 Gm4332-201ENSMUST00000196114 346 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
PtprmP28828 Gm43105-201ENSMUST00000202987 459 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
PtprmP28828 Gm45335-201ENSMUST00000210618 401 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
PtprmP28828 Gm18850-201ENSMUST00000211578 388 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
PtprmP28828 AC156037.1-201ENSMUST00000221133 127 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
PtprmP28828 AC125543.3-201ENSMUST00000221991 126 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
PtprmP28828 Gm46379-201ENSMUST00000222551 265 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
PtprmP28828 Gm7768-201ENSMUST00000222988 597 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
PtprmP28828 AC152394.1-201ENSMUST00000227360 1086 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
PtprmP28828 C330024D21Rik-202ENSMUST00000202634 2020 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.88
PtprmP28828 Gucy1b3-201ENSMUST00000029635 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
PtprmP28828 Disp2-201ENSMUST00000037547 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
PtprmP28828 Gm15907-201ENSMUST00000134284 2309 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
PtprmP28828 Gm37255-201ENSMUST00000193302 3060 ntBASIC9.52□□□□□ -0.88
PtprmP28828 Tbc1d24-203ENSMUST00000097376 7265 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
PtprmP28828 Dst-209ENSMUST00000182697 2704 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
PtprmP28828 Jcad-201ENSMUST00000037029 6730 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
PtprmP28828 Zc3h11a-201ENSMUST00000027736 4395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
PtprmP28828 Cdh3-201ENSMUST00000080797 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
PtprmP28828 Adgrl2-214ENSMUST00000199238 4670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
PtprmP28828 Gm10735-201ENSMUST00000099162 2943 ntAPPRIS P1 BASIC9.52□□□□□ -0.89
PtprmP28828 Gm15531-201ENSMUST00000118062 252 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
PtprmP28828 Gm23884-201ENSMUST00000122687 294 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
PtprmP28828 4933406K04Rik-202ENSMUST00000124363 1064 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
PtprmP28828 Noxred1-201ENSMUST00000021423 1101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
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