Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 AC166574.7-201ENSMUST00000228502 704 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Hoxd10P28359 Lalba-201ENSMUST00000023726 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Hoxd10P28359 Gm21731-201ENSMUST00000079524 489 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Hoxd10P28359 Gm22126-201ENSMUST00000083244 142 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Hoxd10P28359 Crb1-204ENSMUST00000198445 6135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Hoxd10P28359 Svil-201ENSMUST00000025079 7433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Hoxd10P28359 Gm17477-201ENSMUST00000165458 2581 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Hoxd10P28359 Myot-202ENSMUST00000115498 2087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Hoxd10P28359 Gm45805-201ENSMUST00000212695 2066 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Hoxd10P28359 Sspn-203ENSMUST00000111702 4415 ntTSL 2 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Hoxd10P28359 AC164437.5-201ENSMUST00000227235 4414 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Hoxd10P28359 Prrg1-201ENSMUST00000114024 3900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Hoxd10P28359 Zscan18-203ENSMUST00000210650 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Hoxd10P28359 Abcg8-201ENSMUST00000045714 3667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Hoxd10P28359 Mrps25-203ENSMUST00000140438 6073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Hoxd10P28359 Gm31049-201ENSMUST00000201516 1302 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Hoxd10P28359 AC124183.1-201ENSMUST00000222367 2135 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
Hoxd10P28359 Dglucy-208ENSMUST00000167322 2941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Hoxd10P28359 Gcc2-207ENSMUST00000162041 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Hoxd10P28359 Olfr1500-205ENSMUST00000216287 2178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Hoxd10P28359 AC123954.1-201ENSMUST00000222404 3272 ntAPPRIS P1 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Hoxd10P28359 Lifr-207ENSMUST00000227727 2489 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.7□□□□□ -1.18
Hoxd10P28359 Srl-202ENSMUST00000090500 3698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Hoxd10P28359 Pcdh9-201ENSMUST00000068992 3714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Hoxd10P28359 AC154612.1-202ENSMUST00000224806 1725 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Hoxd10P28359 Fbxw11-201ENSMUST00000076383 4019 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Hoxd10P28359 Ppp2r5c-202ENSMUST00000109832 4108 ntTSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Hoxd10P28359 Gm3510-201ENSMUST00000180447 1455 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Hoxd10P28359 Igsf1-201ENSMUST00000033442 4421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Hoxd10P28359 Plch1-203ENSMUST00000084105 6245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Hoxd10P28359 Grm8-203ENSMUST00000115324 3299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Hoxd10P28359 Tubgcp5-201ENSMUST00000032627 3905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Hoxd10P28359 Ptpn22-201ENSMUST00000029433 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Hoxd10P28359 Gm43679-201ENSMUST00000197051 3677 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Hoxd10P28359 Gm30655-202ENSMUST00000222732 2808 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Hoxd10P28359 Gm16344-201ENSMUST00000150084 1567 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Hoxd10P28359 Trps1-201ENSMUST00000077935 4436 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Hoxd10P28359 Zfp874a-201ENSMUST00000057241 2210 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Hoxd10P28359 Gm22426-201ENSMUST00000103811 96 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Hoxd10P28359 Insl5-202ENSMUST00000106869 438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Hoxd10P28359 Mup-ps16-201ENSMUST00000120085 596 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Hoxd10P28359 Gm14712-201ENSMUST00000120195 772 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
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Hoxd10P28359 Dnah2os-201ENSMUST00000124108 859 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
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Hoxd10P28359 Gm39463-201ENSMUST00000214575 735 ntTSL 3 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Hoxd10P28359 Tas2r116-201ENSMUST00000032315 918 ntAPPRIS P1 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Hoxd10P28359 Olfr1122-201ENSMUST00000056435 1080 ntAPPRIS P1 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Hoxd10P28359 Rpl37a-201ENSMUST00000059980 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
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Hoxd10P28359 Ctnna2-202ENSMUST00000159626 3908 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
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Hoxd10P28359 Sulf1-201ENSMUST00000088585 4630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Hoxd10P28359 Olfr959-203ENSMUST00000216298 5616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Hoxd10P28359 Gm15318-202ENSMUST00000146320 1661 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
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Hoxd10P28359 Adgre1-202ENSMUST00000086763 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Hoxd10P28359 Cd38-201ENSMUST00000030964 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Hoxd10P28359 Trim43c-202ENSMUST00000186363 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Hoxd10P28359 Nup93-207ENSMUST00000212824 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
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Hoxd10P28359 Zfp663-202ENSMUST00000103085 3451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Hoxd10P28359 Gm42711-201ENSMUST00000197060 2302 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
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Hoxd10P28359 Dock10-209ENSMUST00000190983 6672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Hoxd10P28359 Csta1-201ENSMUST00000096090 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Hoxd10P28359 Spag9-203ENSMUST00000075695 6910 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Hoxd10P28359 Fbxw10-205ENSMUST00000176577 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Hoxd10P28359 AC164567.3-201ENSMUST00000217743 2869 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Hoxd10P28359 Cnga1-202ENSMUST00000126799 2061 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Hoxd10P28359 Psg29-201ENSMUST00000075934 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Hoxd10P28359 Cyfip1-202ENSMUST00000085255 4195 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Hoxd10P28359 Cast-202ENSMUST00000220738 1653 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Hoxd10P28359 Mapk10-205ENSMUST00000128869 2518 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Hoxd10P28359 Trbv23-201ENSMUST00000103279 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Hoxd10P28359 Gm15209-201ENSMUST00000117703 400 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Hoxd10P28359 Gm12923-201ENSMUST00000127060 667 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Hoxd10P28359 Gm11820-201ENSMUST00000139614 664 ntTSL 3 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Hoxd10P28359 Dcaf1-203ENSMUST00000161758 5539 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Hoxd10P28359 Gm25574-201ENSMUST00000175245 249 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Hoxd10P28359 Gm26557-201ENSMUST00000180756 493 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Hoxd10P28359 Gm9167-201ENSMUST00000182469 962 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Hoxd10P28359 Mir7674-201ENSMUST00000184964 63 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Hoxd10P28359 1700124L16Rik-202ENSMUST00000189308 546 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Hoxd10P28359 Gm3351-201ENSMUST00000193454 505 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Hoxd10P28359 Gm45185-201ENSMUST00000207556 404 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Hoxd10P28359 Gm2774-201ENSMUST00000213650 1165 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Hoxd10P28359 Gm9869-202ENSMUST00000214999 679 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Hoxd10P28359 Gm19154-201ENSMUST00000223330 940 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Hoxd10P28359 AC120375.2-202ENSMUST00000228722 397 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Hoxd10P28359 Gm25587-201ENSMUST00000082498 166 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.4 ms