Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 Trbv23-201ENSMUST00000103279 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
PtprbB2RU80 Tpk1-203ENSMUST00000114644 2148 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
PtprbB2RU80 Gm21719-201ENSMUST00000115940 693 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
PtprbB2RU80 Gm4853-201ENSMUST00000119359 394 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
PtprbB2RU80 Rps29-ps-201ENSMUST00000122083 172 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
PtprbB2RU80 Gm22518-201ENSMUST00000158267 68 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
PtprbB2RU80 Ulbp1-201ENSMUST00000169796 1093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
PtprbB2RU80 Gm7008-203ENSMUST00000171356 476 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
PtprbB2RU80 Gm27854-201ENSMUST00000175578 244 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
PtprbB2RU80 Raet1e-202ENSMUST00000178026 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
PtprbB2RU80 Gm8883-204ENSMUST00000189680 699 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
PtprbB2RU80 Gm2040-201ENSMUST00000202979 289 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
PtprbB2RU80 Gm5154-201ENSMUST00000203971 399 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
PtprbB2RU80 Rpl19-ps9-201ENSMUST00000205423 588 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
PtprbB2RU80 AC147782.1-201ENSMUST00000219169 475 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
PtprbB2RU80 AC153821.2-201ENSMUST00000220253 468 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
PtprbB2RU80 Rslcan18-201ENSMUST00000091526 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
PtprbB2RU80 Raet1d-201ENSMUST00000095795 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
PtprbB2RU80 Gm16344-201ENSMUST00000150084 1567 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
PtprbB2RU80 Nr2c1-203ENSMUST00000105290 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
PtprbB2RU80 Lnpep-201ENSMUST00000041047 5181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
PtprbB2RU80 Spin4-201ENSMUST00000096367 4173 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
PtprbB2RU80 Gm17751-201ENSMUST00000189132 2004 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
PtprbB2RU80 Sox6-202ENSMUST00000106612 8193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
PtprbB2RU80 Gm26691-201ENSMUST00000180471 4401 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
PtprbB2RU80 Stab2-201ENSMUST00000035288 8228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
PtprbB2RU80 Gm17167-201ENSMUST00000169242 5054 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
PtprbB2RU80 Acsl6-204ENSMUST00000093106 5804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
PtprbB2RU80 AC158115.1-201ENSMUST00000222830 3182 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
PtprbB2RU80 Zfp239-201ENSMUST00000079405 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
PtprbB2RU80 Gm18716-201ENSMUST00000204507 1603 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
PtprbB2RU80 Mef2c-227ENSMUST00000199432 3498 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
PtprbB2RU80 Nsrp1-201ENSMUST00000102494 3114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
PtprbB2RU80 Ctage5-223ENSMUST00000219140 4194 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
PtprbB2RU80 Gm24709-201ENSMUST00000104123 132 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
PtprbB2RU80 Plscr2-202ENSMUST00000113044 1239 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
PtprbB2RU80 Spin2-ps2-201ENSMUST00000116186 778 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
PtprbB2RU80 Gm6181-201ENSMUST00000117187 264 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
PtprbB2RU80 Gm14158-201ENSMUST00000118409 308 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
PtprbB2RU80 Gm13598-201ENSMUST00000147939 625 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
PtprbB2RU80 Gm25550-201ENSMUST00000158079 128 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
PtprbB2RU80 Gm6133-201ENSMUST00000164064 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
PtprbB2RU80 Gm17137-202ENSMUST00000165729 957 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
PtprbB2RU80 Gm17096-201ENSMUST00000172037 733 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
PtprbB2RU80 Gm23450-201ENSMUST00000178285 91 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
PtprbB2RU80 Gm38155-201ENSMUST00000192285 2763 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
PtprbB2RU80 Gm44360-201ENSMUST00000200081 82 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
PtprbB2RU80 Olfr1240-201ENSMUST00000215362 1074 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
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PtprbB2RU80 Gm6436-201ENSMUST00000077163 451 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
PtprbB2RU80 Gm25133-201ENSMUST00000082647 130 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
PtprbB2RU80 Olfr519-201ENSMUST00000084752 960 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
PtprbB2RU80 Psd3-203ENSMUST00000093468 1739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
PtprbB2RU80 Akr1c19-202ENSMUST00000118663 5832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
PtprbB2RU80 Ccdc141-207ENSMUST00000164114 6222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
PtprbB2RU80 Olfr1564-204ENSMUST00000213751 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
PtprbB2RU80 Gm16758-201ENSMUST00000149552 3848 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
PtprbB2RU80 Mapk10-205ENSMUST00000128869 2518 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
PtprbB2RU80 Cul4b-202ENSMUST00000050083 3090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
PtprbB2RU80 Hrasls-201ENSMUST00000089824 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
PtprbB2RU80 Rapgef4os3-201ENSMUST00000132792 3485 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
PtprbB2RU80 Zfp60-202ENSMUST00000108336 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
PtprbB2RU80 Gm3510-201ENSMUST00000180447 1455 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
PtprbB2RU80 Gm42397-201ENSMUST00000207472 2002 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
PtprbB2RU80 Actl11-201ENSMUST00000085073 3993 ntAPPRIS P1 BASIC6.03□□□□□ -1.44
PtprbB2RU80 Gm9268-202ENSMUST00000173815 2565 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
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PtprbB2RU80 Skiv2l2-201ENSMUST00000022281 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
PtprbB2RU80 Tiam1-213ENSMUST00000163370 7255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
PtprbB2RU80 Gucy1a3-201ENSMUST00000048976 4554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
PtprbB2RU80 Olfr716-205ENSMUST00000214819 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
PtprbB2RU80 Map2-204ENSMUST00000114013 6258 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
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PtprbB2RU80 Platr5-202ENSMUST00000181016 479 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
PtprbB2RU80 Gm6693-201ENSMUST00000189583 813 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
PtprbB2RU80 Gm19185-201ENSMUST00000196365 643 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
PtprbB2RU80 Gm45899-201ENSMUST00000212196 1276 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
PtprbB2RU80 Prss58-201ENSMUST00000063523 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
PtprbB2RU80 Olfr195-201ENSMUST00000075381 995 ntAPPRIS P1 BASIC6.03□□□□□ -1.44
PtprbB2RU80 Gm21731-201ENSMUST00000079524 489 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
PtprbB2RU80 Gadl1-201ENSMUST00000069651 3652 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
PtprbB2RU80 Lix1-201ENSMUST00000115576 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
PtprbB2RU80 Cts7-201ENSMUST00000021892 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
PtprbB2RU80 Gm20043-201ENSMUST00000222267 2565 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
PtprbB2RU80 E330034G19Rik-204ENSMUST00000162224 1350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
PtprbB2RU80 B230354K17Rik-201ENSMUST00000181149 4897 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
PtprbB2RU80 Gdpd4-202ENSMUST00000170049 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
PtprbB2RU80 Tbc1d23-203ENSMUST00000226586 3112 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
PtprbB2RU80 Mbnl2-202ENSMUST00000167459 4534 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
PtprbB2RU80 Trdc-201ENSMUST00000196323 3865 ntAPPRIS P1 BASIC6.03□□□□□ -1.44
PtprbB2RU80 Dpy19l3-201ENSMUST00000051377 8006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
PtprbB2RU80 Tpp1-201ENSMUST00000033184 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
PtprbB2RU80 Zfp592-201ENSMUST00000107353 7297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
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