Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

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Length 936 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Gm9999-202ENSMUST00000185832 335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Spocd1B1ASB6 Gm19035-202ENSMUST00000194575 959 ntBASIC8.13□□□□□ -1.11
Spocd1B1ASB6 Gm37273-201ENSMUST00000195132 539 ntTSL 2 BASIC8.13□□□□□ -1.11
Spocd1B1ASB6 Gm33370-201ENSMUST00000195935 489 ntTSL 2 BASIC8.13□□□□□ -1.11
Spocd1B1ASB6 Gm42804-201ENSMUST00000199701 178 ntBASIC8.13□□□□□ -1.11
Spocd1B1ASB6 Gm43367-201ENSMUST00000199986 625 ntBASIC8.13□□□□□ -1.11
Spocd1B1ASB6 Gm2505-201ENSMUST00000200413 825 ntBASIC8.13□□□□□ -1.11
Spocd1B1ASB6 Gm43748-201ENSMUST00000202329 1233 ntBASIC8.13□□□□□ -1.11
Spocd1B1ASB6 Gm19764-201ENSMUST00000203630 649 ntBASIC8.13□□□□□ -1.11
Spocd1B1ASB6 Smarcad1-215ENSMUST00000205118 600 ntTSL 2 BASIC8.13□□□□□ -1.11
Spocd1B1ASB6 Gm44690-201ENSMUST00000207984 382 ntBASIC8.13□□□□□ -1.11
Spocd1B1ASB6 Gm44693-201ENSMUST00000208141 460 ntTSL 3 BASIC8.13□□□□□ -1.11
Spocd1B1ASB6 BC024386-202ENSMUST00000209496 851 ntTSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Spocd1B1ASB6 AC122539.1-201ENSMUST00000219925 329 ntBASIC8.13□□□□□ -1.11
Spocd1B1ASB6 AC055772.1-201ENSMUST00000222646 395 ntTSL 3 BASIC8.13□□□□□ -1.11
Spocd1B1ASB6 AC126275.1-201ENSMUST00000224881 446 ntBASIC8.13□□□□□ -1.11
Spocd1B1ASB6 AC099612.2-201ENSMUST00000226824 721 ntBASIC8.13□□□□□ -1.11
Spocd1B1ASB6 AC156574.2-201ENSMUST00000228023 282 ntBASIC8.13□□□□□ -1.11
Spocd1B1ASB6 3300002A11Rik-201ENSMUST00000046994 654 ntTSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Spocd1B1ASB6 Sprr1b-201ENSMUST00000062160 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Spocd1B1ASB6 Olfr1360-201ENSMUST00000079135 980 ntAPPRIS P1 BASIC8.13□□□□□ -1.11
Spocd1B1ASB6 Olfr1505-201ENSMUST00000081520 1103 ntAPPRIS P1 BASIC8.13□□□□□ -1.11
Spocd1B1ASB6 Spata22-202ENSMUST00000092926 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Spocd1B1ASB6 Hba-a2-201ENSMUST00000093207 554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Spocd1B1ASB6 Vmn1r55-201ENSMUST00000098844 1284 ntAPPRIS P1 BASIC8.13□□□□□ -1.11
Spocd1B1ASB6 Rpe65-201ENSMUST00000029824 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Spocd1B1ASB6 Gm18726-201ENSMUST00000218175 2010 ntBASIC8.13□□□□□ -1.11
Spocd1B1ASB6 Zc3h12c-202ENSMUST00000213645 6764 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.13□□□□□ -1.11
Spocd1B1ASB6 Tmem167-203ENSMUST00000161568 8689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Spocd1B1ASB6 Gm45112-201ENSMUST00000208576 5125 ntBASIC8.13□□□□□ -1.11
Spocd1B1ASB6 Bdnf-203ENSMUST00000111043 3839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Spocd1B1ASB6 Ccser1-201ENSMUST00000045522 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Spocd1B1ASB6 St3gal6-202ENSMUST00000114358 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Spocd1B1ASB6 Gm43429-201ENSMUST00000197889 2251 ntBASIC8.13□□□□□ -1.11
Spocd1B1ASB6 Trp63-202ENSMUST00000065523 5257 ntTSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Spocd1B1ASB6 AC159809.2-202ENSMUST00000214073 3333 ntTSL 5 BASIC8.13□□□□□ -1.11
Spocd1B1ASB6 Gm14797-201ENSMUST00000119378 1480 ntBASIC8.13□□□□□ -1.11
Spocd1B1ASB6 Gm29450-201ENSMUST00000189657 1497 ntTSL 5 BASIC8.13□□□□□ -1.11
Spocd1B1ASB6 Gm29278-202ENSMUST00000189701 1497 ntTSL 5 BASIC8.13□□□□□ -1.11
Spocd1B1ASB6 Olfr1320-203ENSMUST00000214375 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.13□□□□□ -1.11
Spocd1B1ASB6 Rp1-201ENSMUST00000027032 6869 ntTSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
Spocd1B1ASB6 Slc6a18-202ENSMUST00000109679 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
Spocd1B1ASB6 5430427O19Rik-201ENSMUST00000113976 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
Spocd1B1ASB6 Zfp143-204ENSMUST00000209505 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
Spocd1B1ASB6 Gm37790-201ENSMUST00000193136 3346 ntBASIC8.12□□□□□ -1.11
Spocd1B1ASB6 Exoc2-201ENSMUST00000021785 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
Spocd1B1ASB6 Pgbd1-204ENSMUST00000148071 2600 ntTSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
Spocd1B1ASB6 Gm12346-201ENSMUST00000121455 2255 ntBASIC8.12□□□□□ -1.11
Spocd1B1ASB6 Iglv1-201ENSMUST00000103746 391 ntAPPRIS P1 BASIC8.12□□□□□ -1.11
Spocd1B1ASB6 Gm15739-201ENSMUST00000118049 872 ntBASIC8.12□□□□□ -1.11
Spocd1B1ASB6 Gm12710-201ENSMUST00000119011 216 ntBASIC8.12□□□□□ -1.11
Spocd1B1ASB6 Gm14664-201ENSMUST00000142919 437 ntTSL 3 BASIC8.12□□□□□ -1.11
Spocd1B1ASB6 Gm2976-201ENSMUST00000160362 513 ntBASIC8.12□□□□□ -1.11
Spocd1B1ASB6 Olfr819-201ENSMUST00000167974 963 ntAPPRIS P2 BASIC8.12□□□□□ -1.11
Spocd1B1ASB6 Olfr247-201ENSMUST00000170920 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.12□□□□□ -1.11
Spocd1B1ASB6 Vmn1r-ps85-201ENSMUST00000173029 890 ntBASIC8.12□□□□□ -1.11
Spocd1B1ASB6 6330403N20Rik-201ENSMUST00000180467 1189 ntTSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
Spocd1B1ASB6 Gm26895-201ENSMUST00000181295 619 ntTSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
Spocd1B1ASB6 Gm26715-201ENSMUST00000181676 1095 ntTSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
Spocd1B1ASB6 Gm18848-201ENSMUST00000182069 792 ntBASIC8.12□□□□□ -1.11
Spocd1B1ASB6 1700040F17Rik-201ENSMUST00000187158 817 ntTSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
Spocd1B1ASB6 1700054A03Rik-201ENSMUST00000187368 780 ntTSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
Spocd1B1ASB6 Gm28294-201ENSMUST00000191154 386 ntTSL 2 BASIC8.12□□□□□ -1.11
Spocd1B1ASB6 Gm43243-201ENSMUST00000199964 278 ntBASIC8.12□□□□□ -1.11
Spocd1B1ASB6 Gm9419-201ENSMUST00000200672 567 ntBASIC8.12□□□□□ -1.11
Spocd1B1ASB6 Gm44282-201ENSMUST00000203199 190 ntBASIC8.12□□□□□ -1.11
Spocd1B1ASB6 Gm18562-201ENSMUST00000209949 915 ntBASIC8.12□□□□□ -1.11
Spocd1B1ASB6 Gm8667-201ENSMUST00000211112 449 ntBASIC8.12□□□□□ -1.11
Spocd1B1ASB6 AC118476.2-201ENSMUST00000215206 757 ntTSL 3 BASIC8.12□□□□□ -1.11
Spocd1B1ASB6 Gm19987-201ENSMUST00000216339 499 ntBASIC8.12□□□□□ -1.11
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Spocd1B1ASB6 Gm2089-201ENSMUST00000218294 479 ntBASIC8.12□□□□□ -1.11
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Spocd1B1ASB6 Gm19233-201ENSMUST00000219772 936 ntBASIC8.12□□□□□ -1.11
Spocd1B1ASB6 AC131117.2-202ENSMUST00000224539 547 ntBASIC8.12□□□□□ -1.11
Spocd1B1ASB6 AV026068-229ENSMUST00000225516 595 ntBASIC8.12□□□□□ -1.11
Spocd1B1ASB6 AC154724.1-201ENSMUST00000225782 821 ntBASIC8.12□□□□□ -1.11
Spocd1B1ASB6 Fam47e-201ENSMUST00000082382 750 ntTSL 5 BASIC8.12□□□□□ -1.11
Spocd1B1ASB6 Gm10310-201ENSMUST00000095239 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.12□□□□□ -1.11
Spocd1B1ASB6 Pecam1-204ENSMUST00000106796 3441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
Spocd1B1ASB6 Olfr799-204ENSMUST00000216446 1513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.12□□□□□ -1.11
Spocd1B1ASB6 Shprh-202ENSMUST00000054814 7225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
Spocd1B1ASB6 Plch1-203ENSMUST00000084105 6245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
Spocd1B1ASB6 Gm3476-202ENSMUST00000167913 1759 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.12□□□□□ -1.11
Spocd1B1ASB6 Pnisr-202ENSMUST00000098238 4407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.12□□□□□ -1.11
Spocd1B1ASB6 Gm26967-201ENSMUST00000182878 2303 ntBASIC8.12□□□□□ -1.11
Spocd1B1ASB6 Gm5177-202ENSMUST00000183337 3785 ntTSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
Spocd1B1ASB6 Atp1a4-201ENSMUST00000111243 3470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.12□□□□□ -1.11
Spocd1B1ASB6 Mmp10-201ENSMUST00000034488 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
Spocd1B1ASB6 Olfr1055-203ENSMUST00000213564 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.12□□□□□ -1.11
Spocd1B1ASB6 Crisp1-201ENSMUST00000026498 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
Spocd1B1ASB6 Kng2-202ENSMUST00000100046 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
Spocd1B1ASB6 Stambpl1-202ENSMUST00000119603 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.11□□□□□ -1.11
Spocd1B1ASB6 Stra6l-201ENSMUST00000030011 3606 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.11□□□□□ -1.11
Spocd1B1ASB6 Baz2b-201ENSMUST00000090925 7576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.11□□□□□ -1.11
Spocd1B1ASB6 Arnt-205ENSMUST00000107161 4260 ntTSL 1 (best) BASIC8.11□□□□□ -1.11
Spocd1B1ASB6 Mbnl1-211ENSMUST00000192807 2906 ntTSL 1 (best) BASIC8.11□□□□□ -1.11
Spocd1B1ASB6 F930017D23Rik-202ENSMUST00000213342 2141 ntTSL 5 BASIC8.11□□□□□ -1.11
Spocd1B1ASB6 Cd200r3-206ENSMUST00000114622 1339 ntTSL 1 (best) BASIC8.11□□□□□ -1.11
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