Protein–RNA interactions for Protein: A2ASI5

Scn3a, Sodium channel protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,947 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn3aA2ASI5 Vcam1-203ENSMUST00000196449 2532 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Scn3aA2ASI5 Trim2-206ENSMUST00000107695 7200 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Scn3aA2ASI5 Ifi207-202ENSMUST00000127730 3145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Scn3aA2ASI5 Daw1-203ENSMUST00000113436 1351 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Scn3aA2ASI5 Adgrl3-206ENSMUST00000118034 4947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Scn3aA2ASI5 Slc15a2-208ENSMUST00000165531 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Scn3aA2ASI5 Wdr44-201ENSMUST00000035766 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Scn3aA2ASI5 C8a-202ENSMUST00000064873 3617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Scn3aA2ASI5 Olfr1362-201ENSMUST00000051874 3045 ntAPPRIS P1 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Scn3aA2ASI5 Cyp1a1-201ENSMUST00000034865 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Scn3aA2ASI5 Zfp51-201ENSMUST00000039577 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Scn3aA2ASI5 Tial1-211ENSMUST00000165023 2003 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Scn3aA2ASI5 Olfr122-202ENSMUST00000172582 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Scn3aA2ASI5 Tdrd7-202ENSMUST00000107777 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Scn3aA2ASI5 Poln-201ENSMUST00000042954 2897 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Scn3aA2ASI5 Gm9603-201ENSMUST00000165814 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Scn3aA2ASI5 Gm3542-201ENSMUST00000169362 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Scn3aA2ASI5 Nsrp1-201ENSMUST00000102494 3114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Scn3aA2ASI5 Fto-204ENSMUST00000136802 3751 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Scn3aA2ASI5 AL450321.1-201ENSMUST00000220600 3550 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Scn3aA2ASI5 Gm14513-201ENSMUST00000117403 123 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Scn3aA2ASI5 Gm23884-201ENSMUST00000122687 294 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Scn3aA2ASI5 Selenok-ps1-201ENSMUST00000125204 785 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Scn3aA2ASI5 4933405E24Rik-201ENSMUST00000131019 1078 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Scn3aA2ASI5 Gm12144-201ENSMUST00000136288 1292 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Scn3aA2ASI5 Gm26410-201ENSMUST00000157670 261 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Scn3aA2ASI5 Gm20490-201ENSMUST00000173622 198 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Scn3aA2ASI5 Gm17048-201ENSMUST00000179266 847 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Scn3aA2ASI5 Gm37502-201ENSMUST00000192981 356 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Scn3aA2ASI5 Gm37493-201ENSMUST00000193167 433 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Scn3aA2ASI5 Gm43160-201ENSMUST00000196453 421 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Scn3aA2ASI5 Gm43176-201ENSMUST00000199653 2989 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Scn3aA2ASI5 Gm20052-204ENSMUST00000202443 648 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Scn3aA2ASI5 AC154481.1-201ENSMUST00000223532 331 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Scn3aA2ASI5 AC154861.1-201ENSMUST00000223767 800 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Scn3aA2ASI5 AC139197.1-201ENSMUST00000228332 813 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Scn3aA2ASI5 Cypt4-201ENSMUST00000053956 629 ntAPPRIS P1 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Scn3aA2ASI5 Gm9961-201ENSMUST00000068397 547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Scn3aA2ASI5 Olfr532-201ENSMUST00000073226 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Scn3aA2ASI5 4833413G10Rik-201ENSMUST00000199632 1946 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Scn3aA2ASI5 Atp13a4-202ENSMUST00000057018 4054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Scn3aA2ASI5 Trdc-201ENSMUST00000196323 3865 ntAPPRIS P1 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Scn3aA2ASI5 Smad5-202ENSMUST00000109874 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Scn3aA2ASI5 Mre11a-202ENSMUST00000115632 5660 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Scn3aA2ASI5 Olfr66-202ENSMUST00000216303 3080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Scn3aA2ASI5 Gm16142-201ENSMUST00000130584 2850 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Scn3aA2ASI5 Gm21663-201ENSMUST00000196214 2864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Scn3aA2ASI5 Gm10610-202ENSMUST00000207184 2693 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Scn3aA2ASI5 Gm10825-201ENSMUST00000180537 4478 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Scn3aA2ASI5 Gm26581-201ENSMUST00000181953 4479 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Scn3aA2ASI5 Mcm7-208ENSMUST00000148879 1351 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Scn3aA2ASI5 Gm37772-201ENSMUST00000191635 1394 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Scn3aA2ASI5 Gm38661-201ENSMUST00000216555 5814 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Scn3aA2ASI5 Gcc2-201ENSMUST00000057659 6547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Scn3aA2ASI5 Gm13872-202ENSMUST00000143995 1408 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Scn3aA2ASI5 Satb1-213ENSMUST00000169480 6194 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Scn3aA2ASI5 Sipa1l1-208ENSMUST00000222298 6179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Scn3aA2ASI5 Olfr994-204ENSMUST00000217218 1460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Scn3aA2ASI5 Gm40649-201ENSMUST00000219795 1457 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Scn3aA2ASI5 Vmn2r-ps159-201ENSMUST00000074107 2716 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Scn3aA2ASI5 Rapgef4os3-201ENSMUST00000132792 3485 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Scn3aA2ASI5 Plekhm3-201ENSMUST00000097713 8562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Scn3aA2ASI5 Ighv1-53-201ENSMUST00000103523 351 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Scn3aA2ASI5 Ighv1-69-201ENSMUST00000103539 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Scn3aA2ASI5 Gm6181-201ENSMUST00000117187 264 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
Scn3aA2ASI5 Gm21560-202ENSMUST00000177670 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Scn3aA2ASI5 Gm3269-202ENSMUST00000178137 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Scn3aA2ASI5 Vmn1r-ps78-201ENSMUST00000178185 924 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
Scn3aA2ASI5 Gm3099-202ENSMUST00000178274 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Scn3aA2ASI5 Gm3642-202ENSMUST00000179296 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Scn3aA2ASI5 Vmn1r-ps76-201ENSMUST00000179492 924 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
Scn3aA2ASI5 Gm3594-203ENSMUST00000179747 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Scn3aA2ASI5 Rpl31-ps23-201ENSMUST00000180440 388 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
Scn3aA2ASI5 Gm27348-201ENSMUST00000184511 170 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
Scn3aA2ASI5 Gm5260-201ENSMUST00000186157 949 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
Scn3aA2ASI5 1700110C19Rik-202ENSMUST00000188715 717 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Scn3aA2ASI5 Gm44265-201ENSMUST00000203631 465 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
Scn3aA2ASI5 Fkbp1a-ps2-201ENSMUST00000219474 311 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
Scn3aA2ASI5 A1cf-203ENSMUST00000224400 1204 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
Scn3aA2ASI5 Gm6436-201ENSMUST00000077163 451 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
Scn3aA2ASI5 Gm22684-201ENSMUST00000082849 132 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
Scn3aA2ASI5 Nckap5-203ENSMUST00000094610 739 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Scn3aA2ASI5 Gm42490-201ENSMUST00000198595 2064 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
Scn3aA2ASI5 A830082K12Rik-207ENSMUST00000183171 4176 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Scn3aA2ASI5 Slmap-204ENSMUST00000112330 3962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Scn3aA2ASI5 1810046K07Rik-201ENSMUST00000039959 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Scn3aA2ASI5 Klhl23-201ENSMUST00000053087 4617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Scn3aA2ASI5 Gm14540-201ENSMUST00000138298 3261 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Scn3aA2ASI5 Lpin1-204ENSMUST00000221230 4114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Scn3aA2ASI5 Adgrl4-201ENSMUST00000046977 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Scn3aA2ASI5 Gm36380-201ENSMUST00000210339 4379 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Scn3aA2ASI5 Gm43421-201ENSMUST00000200044 2905 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Scn3aA2ASI5 Ect2l-201ENSMUST00000095817 2900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Scn3aA2ASI5 Elavl2-209ENSMUST00000107124 4127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Scn3aA2ASI5 Gm10555-201ENSMUST00000193178 1791 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Scn3aA2ASI5 Zfp473-204ENSMUST00000120798 3559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Scn3aA2ASI5 AC159635.1-201ENSMUST00000220905 2102 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Scn3aA2ASI5 Gm15509-201ENSMUST00000162615 2162 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Scn3aA2ASI5 Ank3-207ENSMUST00000181974 3751 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Scn3aA2ASI5 Maats1-202ENSMUST00000114740 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
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