Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF7

Tlr5, Toll-like receptor 5, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr5Q9JLF7 Tpp1-201ENSMUST00000033184 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Tlr5Q9JLF7 Gm29379-201ENSMUST00000186305 2166 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Tlr5Q9JLF7 Gm28276-201ENSMUST00000188508 2166 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Tlr5Q9JLF7 Gm28201-201ENSMUST00000189989 2166 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Tlr5Q9JLF7 Gm38366-201ENSMUST00000193127 1934 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Tlr5Q9JLF7 Cltc-201ENSMUST00000060766 6163 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Tlr5Q9JLF7 Dlg1-206ENSMUST00000115205 4364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Tlr5Q9JLF7 Gm20768-201ENSMUST00000199527 2338 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Tlr5Q9JLF7 Cyb5r2-201ENSMUST00000052438 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Tlr5Q9JLF7 Fastkd1-202ENSMUST00000102706 2511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Tlr5Q9JLF7 Nat8f2-201ENSMUST00000045008 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Tlr5Q9JLF7 Matr3-205ENSMUST00000186796 1854 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Tlr5Q9JLF7 Cdk5rap2-206ENSMUST00000144099 11847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Tlr5Q9JLF7 Pik3r3-201ENSMUST00000030464 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Tlr5Q9JLF7 Cpsf6-201ENSMUST00000069168 6526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Tlr5Q9JLF7 Gm28379-202ENSMUST00000187676 2896 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Tlr5Q9JLF7 Gm21663-201ENSMUST00000196214 2864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Tlr5Q9JLF7 Gm37090-201ENSMUST00000195694 4105 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Tlr5Q9JLF7 Amot-202ENSMUST00000112836 6957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Tlr5Q9JLF7 Vmn1r22-206ENSMUST00000228905 2394 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Tlr5Q9JLF7 Gm10840-201ENSMUST00000100326 309 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Tlr5Q9JLF7 Iglc2-201ENSMUST00000103749 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Tlr5Q9JLF7 Tpm3-rs2-201ENSMUST00000116350 323 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Tlr5Q9JLF7 Mgst1-204ENSMUST00000120302 559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Tlr5Q9JLF7 Gm12778-201ENSMUST00000122341 333 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Tlr5Q9JLF7 4930405H06Rik-201ENSMUST00000159244 791 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Tlr5Q9JLF7 Mpped2-201ENSMUST00000016530 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Tlr5Q9JLF7 Gm7289-201ENSMUST00000168993 734 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Tlr5Q9JLF7 Gm20429-202ENSMUST00000174168 820 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Tlr5Q9JLF7 Gm4860-201ENSMUST00000200368 454 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Tlr5Q9JLF7 Gm18012-201ENSMUST00000204558 773 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Tlr5Q9JLF7 Gm31659-201ENSMUST00000211989 481 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Tlr5Q9JLF7 Mobp-206ENSMUST00000214943 435 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Tlr5Q9JLF7 Gm36756-201ENSMUST00000222011 1214 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Tlr5Q9JLF7 BC064078-202ENSMUST00000131176 2299 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Tlr5Q9JLF7 Krcc1-202ENSMUST00000168700 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Tlr5Q9JLF7 Olfr285-202ENSMUST00000216901 5330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Tlr5Q9JLF7 Olfr645-201ENSMUST00000057104 3677 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Tlr5Q9JLF7 Btk-201ENSMUST00000033617 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Tlr5Q9JLF7 Tnfrsf22-201ENSMUST00000075588 4170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Tlr5Q9JLF7 Ptprz1-206ENSMUST00000202579 6871 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Tlr5Q9JLF7 Pcdh15-215ENSMUST00000131321 6926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Tlr5Q9JLF7 Gm43982-201ENSMUST00000204995 1829 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Tlr5Q9JLF7 Iqch-201ENSMUST00000042322 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Tlr5Q9JLF7 Ptpra-202ENSMUST00000077303 3066 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Tlr5Q9JLF7 4933400F21Rik-203ENSMUST00000187295 2633 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Tlr5Q9JLF7 Gm38178-201ENSMUST00000194502 2471 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Tlr5Q9JLF7 Gm37755-201ENSMUST00000195880 2179 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Tlr5Q9JLF7 Nlrp1c-ps-202ENSMUST00000174668 3422 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Tlr5Q9JLF7 Tial1-211ENSMUST00000165023 2003 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Tlr5Q9JLF7 Asb4-201ENSMUST00000043294 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Tlr5Q9JLF7 Gm28112-201ENSMUST00000190898 1875 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Tlr5Q9JLF7 Gm43211-201ENSMUST00000196901 1899 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Tlr5Q9JLF7 Serpina7-202ENSMUST00000060824 1895 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Tlr5Q9JLF7 A330023F24Rik-202ENSMUST00000181273 4217 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Tlr5Q9JLF7 Crtam-204ENSMUST00000188848 5001 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Tlr5Q9JLF7 Cfap74-203ENSMUST00000105619 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Tlr5Q9JLF7 Gm13872-202ENSMUST00000143995 1408 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Tlr5Q9JLF7 Gm25344-201ENSMUST00000104503 132 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Tlr5Q9JLF7 Gm4985-201ENSMUST00000118300 1233 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Tlr5Q9JLF7 Gm14038-201ENSMUST00000121500 807 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Tlr5Q9JLF7 Gm16052-201ENSMUST00000129681 505 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Tlr5Q9JLF7 Gm15527-201ENSMUST00000138259 858 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Tlr5Q9JLF7 Gm13982-201ENSMUST00000138372 755 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Tlr5Q9JLF7 Gm22990-201ENSMUST00000175427 89 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Tlr5Q9JLF7 4930568A12Rik-202ENSMUST00000188292 926 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Tlr5Q9JLF7 Gm28289-201ENSMUST00000189331 315 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Tlr5Q9JLF7 Gm8883-204ENSMUST00000189680 699 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Tlr5Q9JLF7 Gm37637-201ENSMUST00000195540 1256 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Tlr5Q9JLF7 Gm21054-201ENSMUST00000203981 380 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Tlr5Q9JLF7 Gm44386-201ENSMUST00000204288 429 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Tlr5Q9JLF7 Gm44911-201ENSMUST00000208436 1062 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Tlr5Q9JLF7 Gm39317-201ENSMUST00000213360 1138 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Tlr5Q9JLF7 Gm18040-201ENSMUST00000217922 827 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Tlr5Q9JLF7 AC122937.2-201ENSMUST00000228258 1051 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Tlr5Q9JLF7 BC147527-201ENSMUST00000081558 504 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Tlr5Q9JLF7 Gm13043-201ENSMUST00000178489 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Tlr5Q9JLF7 Kpna2-201ENSMUST00000018506 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Tlr5Q9JLF7 Srrm4os-201ENSMUST00000126959 3360 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Tlr5Q9JLF7 Prkaa1-201ENSMUST00000051186 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Tlr5Q9JLF7 C430042M11Rik-201ENSMUST00000180515 1617 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Tlr5Q9JLF7 Apobec3-209ENSMUST00000176325 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Tlr5Q9JLF7 Gm33167-201ENSMUST00000201933 2643 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Tlr5Q9JLF7 Olfr615-203ENSMUST00000215673 3469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Tlr5Q9JLF7 Etnppl-201ENSMUST00000072271 4468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Tlr5Q9JLF7 Trim43b-202ENSMUST00000189557 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Tlr5Q9JLF7 Gm37423-201ENSMUST00000194246 3342 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Tlr5Q9JLF7 Olfr600-202ENSMUST00000215042 3527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Tlr5Q9JLF7 Gm10280-201ENSMUST00000212238 2006 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Tlr5Q9JLF7 Chil3-201ENSMUST00000063062 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Tlr5Q9JLF7 Zfp874a-202ENSMUST00000075255 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Tlr5Q9JLF7 Vmn2r4-202ENSMUST00000175724 2742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
Tlr5Q9JLF7 Vmn2r6-202ENSMUST00000176481 2742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
Tlr5Q9JLF7 Gm3512-202ENSMUST00000172431 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
Tlr5Q9JLF7 Gm38394-201ENSMUST00000179598 10156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Tlr5Q9JLF7 Gm9603-201ENSMUST00000165814 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
Tlr5Q9JLF7 Gm3542-201ENSMUST00000169362 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
Tlr5Q9JLF7 C3ar1-201ENSMUST00000042081 4305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Tlr5Q9JLF7 Smc1a-201ENSMUST00000045312 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Tlr5Q9JLF7 Gm9226-201ENSMUST00000188352 3489 ntBASIC7.21□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 188.2 ms