Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB90

Smg9, Protein SMG9, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg9Q9DB90 Pgbd1-205ENSMUST00000151743 2642 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Smg9Q9DB90 Lyrm9-203ENSMUST00000147875 8035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Smg9Q9DB90 Igkv9-123-201ENSMUST00000103313 377 ntAPPRIS P1 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Smg9Q9DB90 Gm25614-201ENSMUST00000104013 133 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Smg9Q9DB90 Gm25276-201ENSMUST00000104300 124 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Smg9Q9DB90 Eif3m-202ENSMUST00000111110 817 ntTSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Smg9Q9DB90 Gm15578-201ENSMUST00000117320 475 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Smg9Q9DB90 Gm5943-201ENSMUST00000119458 459 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
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Smg9Q9DB90 Gm15632-201ENSMUST00000135936 246 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
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Smg9Q9DB90 Gm8895-201ENSMUST00000172300 1223 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Smg9Q9DB90 Gm22702-201ENSMUST00000175372 69 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Smg9Q9DB90 Gm21909-201ENSMUST00000178260 439 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Smg9Q9DB90 Prl8a8-201ENSMUST00000018389 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
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Smg9Q9DB90 2010005H15Rik-202ENSMUST00000187183 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
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Smg9Q9DB90 Gm28121-201ENSMUST00000191420 339 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Smg9Q9DB90 4933403L11Rik-201ENSMUST00000193857 1121 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Smg9Q9DB90 Gm43542-201ENSMUST00000199505 379 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Smg9Q9DB90 Ube2n-ps1-201ENSMUST00000201768 459 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Smg9Q9DB90 Zfp799-203ENSMUST00000201876 632 ntTSL 3 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Smg9Q9DB90 Gm43698-202ENSMUST00000202864 555 ntTSL 3 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Smg9Q9DB90 Gm43580-201ENSMUST00000202892 284 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Smg9Q9DB90 B930018H19Rik-201ENSMUST00000211381 2121 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Smg9Q9DB90 4930503L19Rik-202ENSMUST00000211817 913 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Smg9Q9DB90 4930469K13Rik-203ENSMUST00000224226 243 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Smg9Q9DB90 AC140451.1-201ENSMUST00000227984 737 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Smg9Q9DB90 Ino80c-201ENSMUST00000055012 909 ntTSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Smg9Q9DB90 Olfr1408-201ENSMUST00000073663 1037 ntAPPRIS P1 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Smg9Q9DB90 Olfr1133-201ENSMUST00000099855 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Smg9Q9DB90 A230085B16Rik-201ENSMUST00000209781 1856 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Smg9Q9DB90 Pik3cg-205ENSMUST00000217915 3340 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Smg9Q9DB90 Inpp5d-211ENSMUST00000170300 3942 ntTSL 2 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Smg9Q9DB90 Gm13415-201ENSMUST00000131886 3089 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Smg9Q9DB90 Gm10513-201ENSMUST00000194203 6468 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Smg9Q9DB90 Olfr731-203ENSMUST00000214152 5572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Smg9Q9DB90 Sox2ot-215ENSMUST00000199171 3486 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Smg9Q9DB90 Hmg20a-203ENSMUST00000214771 3191 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Smg9Q9DB90 Cd44-208ENSMUST00000111198 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Smg9Q9DB90 Psma8-201ENSMUST00000040860 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Smg9Q9DB90 Gm30849-201ENSMUST00000214503 1379 ntTSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Smg9Q9DB90 1700031F05Rik-201ENSMUST00000048061 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Smg9Q9DB90 Fkbp14-201ENSMUST00000046520 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Smg9Q9DB90 Rab30-203ENSMUST00000107180 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Smg9Q9DB90 Olfr224-204ENSMUST00000217009 2098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Smg9Q9DB90 Gm4673-201ENSMUST00000181395 3660 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
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Smg9Q9DB90 Tlk2-203ENSMUST00000106939 5494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Smg9Q9DB90 Zkscan8-201ENSMUST00000045228 8805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Smg9Q9DB90 BC048644-201ENSMUST00000140928 3522 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Smg9Q9DB90 Lars2-201ENSMUST00000038863 3894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Smg9Q9DB90 Pdgfd-203ENSMUST00000214892 2862 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
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Smg9Q9DB90 Trim2-202ENSMUST00000065380 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
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Smg9Q9DB90 Gm14009-201ENSMUST00000152439 656 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
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Smg9Q9DB90 Slc25a5-ps-201ENSMUST00000162199 826 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
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Smg9Q9DB90 7630403G23Rik-201ENSMUST00000184229 1084 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Smg9Q9DB90 Gm7436-201ENSMUST00000187229 391 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
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Smg9Q9DB90 Gm28548-201ENSMUST00000191599 409 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Smg9Q9DB90 Gm37425-201ENSMUST00000193184 432 ntTSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Smg9Q9DB90 Gm36932-201ENSMUST00000195226 929 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
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Smg9Q9DB90 Spin2g-202ENSMUST00000203586 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Smg9Q9DB90 Gm43950-201ENSMUST00000204767 996 ntTSL 3 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Smg9Q9DB90 Gm44135-201ENSMUST00000205221 368 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Smg9Q9DB90 Gm45198-201ENSMUST00000206796 591 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Smg9Q9DB90 4930503L19Rik-203ENSMUST00000212074 1210 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Smg9Q9DB90 Tbc1d7-204ENSMUST00000220787 892 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Smg9Q9DB90 CT954323.2-201ENSMUST00000222056 213 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Smg9Q9DB90 CT010472.1-201ENSMUST00000224000 704 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Smg9Q9DB90 AC122290.1-201ENSMUST00000225631 1078 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Smg9Q9DB90 AC131068.1-201ENSMUST00000226891 482 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Smg9Q9DB90 Anxa13-202ENSMUST00000227274 1201 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Smg9Q9DB90 AC124103.1-201ENSMUST00000227564 1027 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Smg9Q9DB90 AC122035.2-201ENSMUST00000228698 462 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Smg9Q9DB90 Emc2-201ENSMUST00000022962 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
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