Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Gm31925-202ENSMUST00000194266 537 ntTSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Ccdc47Q9D024 Gm42782-201ENSMUST00000197286 522 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Ccdc47Q9D024 Gm36448-201ENSMUST00000199916 438 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Ccdc47Q9D024 AC099934.1-201ENSMUST00000200493 79 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Ccdc47Q9D024 Gm31013-201ENSMUST00000213576 715 ntTSL 3 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Ccdc47Q9D024 Spata19-204ENSMUST00000214287 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Ccdc47Q9D024 Gm46203-201ENSMUST00000218130 478 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Ccdc47Q9D024 A730091E23Rik-201ENSMUST00000221700 3825 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Ccdc47Q9D024 AC150661.1-201ENSMUST00000222563 495 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Ccdc47Q9D024 Mir196a-1-201ENSMUST00000083612 102 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Ccdc47Q9D024 AC124680.1-201ENSMUST00000223923 1585 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
Ccdc47Q9D024 Ms4a1-201ENSMUST00000169159 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
Ccdc47Q9D024 Tshr-204ENSMUST00000221216 1638 ntTSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Ccdc47Q9D024 Olfr1426-205ENSMUST00000219155 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Ccdc47Q9D024 Olfr1275-203ENSMUST00000217539 1661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
Ccdc47Q9D024 Sorbs2-209ENSMUST00000132139 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Ccdc47Q9D024 Gm37896-201ENSMUST00000195611 2791 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Ccdc47Q9D024 Helz-203ENSMUST00000106746 13147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Ccdc47Q9D024 Vmn2r11-201ENSMUST00000164875 2586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Ccdc47Q9D024 AC165260.6-206ENSMUST00000223884 3698 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Ccdc47Q9D024 Gm22000-201ENSMUST00000153087 730 ntTSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Ccdc47Q9D024 Gm12526-201ENSMUST00000154462 615 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Ccdc47Q9D024 Gml-202ENSMUST00000164026 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Ccdc47Q9D024 Trav12d-3-201ENSMUST00000177703 347 ntAPPRIS P1 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Ccdc47Q9D024 D13Ertd608e-201ENSMUST00000179131 417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Ccdc47Q9D024 Gm26654-201ENSMUST00000180455 256 ntTSL 3 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Ccdc47Q9D024 Gm29043-201ENSMUST00000186371 623 ntTSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Ccdc47Q9D024 Gm28147-201ENSMUST00000187133 621 ntTSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Ccdc47Q9D024 Gm18352-201ENSMUST00000189113 902 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Ccdc47Q9D024 Gm29363-201ENSMUST00000189365 621 ntTSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Ccdc47Q9D024 Gm38102-202ENSMUST00000196428 174 ntTSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Ccdc47Q9D024 Fabp7-201ENSMUST00000020024 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Ccdc47Q9D024 Gm5723-201ENSMUST00000203096 432 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Ccdc47Q9D024 Gm18112-201ENSMUST00000219862 1195 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Ccdc47Q9D024 Gm19154-201ENSMUST00000223330 940 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Ccdc47Q9D024 AC124395.1-201ENSMUST00000225940 707 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Ccdc47Q9D024 Cypt4-201ENSMUST00000053956 629 ntAPPRIS P1 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Ccdc47Q9D024 Gm14851-201ENSMUST00000077452 351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Ccdc47Q9D024 Itih5l-ps-201ENSMUST00000145639 3964 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Ccdc47Q9D024 Gja10-201ENSMUST00000056517 2117 ntAPPRIS P2 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Ccdc47Q9D024 Vcam1-203ENSMUST00000196449 2532 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Ccdc47Q9D024 Mcm7-208ENSMUST00000148879 1351 ntTSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Ccdc47Q9D024 Cntrl-204ENSMUST00000113033 1817 ntTSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Ccdc47Q9D024 AC122305.1-201ENSMUST00000214803 3921 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Ccdc47Q9D024 Noc3l-201ENSMUST00000025963 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Ccdc47Q9D024 Dsg1b-201ENSMUST00000076737 3965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Ccdc47Q9D024 Gm26544-201ENSMUST00000181404 2763 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Ccdc47Q9D024 Vmn1r52-204ENSMUST00000227578 2370 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Ccdc47Q9D024 Gm44895-201ENSMUST00000206670 1538 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Ccdc47Q9D024 Taf1-201ENSMUST00000101341 8054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.93□□□□□ -1.14
Ccdc47Q9D024 Rdh11-203ENSMUST00000161204 3262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Ccdc47Q9D024 Gm20043-201ENSMUST00000222267 2565 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Ccdc47Q9D024 Gm44661-201ENSMUST00000208830 3503 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Ccdc47Q9D024 Gm12290-201ENSMUST00000145095 2112 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Ccdc47Q9D024 BC003331-201ENSMUST00000006167 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
Ccdc47Q9D024 Olfr305-202ENSMUST00000213255 3749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
Ccdc47Q9D024 Gm38381-201ENSMUST00000193594 2275 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Ccdc47Q9D024 Gm8534-201ENSMUST00000118553 766 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Ccdc47Q9D024 Gm11517-201ENSMUST00000119491 387 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Ccdc47Q9D024 Gm14070-201ENSMUST00000120773 428 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Ccdc47Q9D024 Gm7599-201ENSMUST00000121453 796 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Ccdc47Q9D024 Amy2-ps1-201ENSMUST00000122117 1117 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Ccdc47Q9D024 Gm11657-201ENSMUST00000137175 337 ntTSL 3 BASIC7.93□□□□□ -1.14
Ccdc47Q9D024 1700061H18Rik-201ENSMUST00000139488 634 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Ccdc47Q9D024 Etfbkmt-207ENSMUST00000147934 1092 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Ccdc47Q9D024 Gm44-201ENSMUST00000172155 993 ntAPPRIS P1 BASIC7.93□□□□□ -1.14
Ccdc47Q9D024 Gm27866-201ENSMUST00000184459 171 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Ccdc47Q9D024 Gm28739-201ENSMUST00000185415 696 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Ccdc47Q9D024 Gm28219-201ENSMUST00000185452 696 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Ccdc47Q9D024 Gm28542-201ENSMUST00000185545 696 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Ccdc47Q9D024 Gm28303-201ENSMUST00000185642 747 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Ccdc47Q9D024 Gm29244-201ENSMUST00000185825 696 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Ccdc47Q9D024 Gm29437-201ENSMUST00000185865 696 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Ccdc47Q9D024 Gm29412-201ENSMUST00000185869 696 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Ccdc47Q9D024 Gm28910-201ENSMUST00000185921 696 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Ccdc47Q9D024 Gm28812-201ENSMUST00000185963 696 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Ccdc47Q9D024 Gm29468-201ENSMUST00000185978 696 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Ccdc47Q9D024 Gm28335-201ENSMUST00000186204 696 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Ccdc47Q9D024 Gm28854-201ENSMUST00000186218 696 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Ccdc47Q9D024 Gm28636-201ENSMUST00000186353 696 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Ccdc47Q9D024 Gm28452-201ENSMUST00000186623 696 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Ccdc47Q9D024 Gm29298-201ENSMUST00000186704 696 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Ccdc47Q9D024 Gm28185-201ENSMUST00000186815 694 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Ccdc47Q9D024 Gm28227-201ENSMUST00000186862 696 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Ccdc47Q9D024 Gm28796-201ENSMUST00000186905 696 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Ccdc47Q9D024 1700122D07Rik-201ENSMUST00000186973 421 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Ccdc47Q9D024 Gm29659-201ENSMUST00000187063 696 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Ccdc47Q9D024 Gm28473-201ENSMUST00000187325 696 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Ccdc47Q9D024 Gm28558-201ENSMUST00000187373 696 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Ccdc47Q9D024 Gm28682-201ENSMUST00000187430 696 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Ccdc47Q9D024 Gm28738-201ENSMUST00000187480 696 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Ccdc47Q9D024 Gm28949-201ENSMUST00000187805 696 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Ccdc47Q9D024 Gm28773-201ENSMUST00000187925 696 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Ccdc47Q9D024 Gm29319-201ENSMUST00000188060 696 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Ccdc47Q9D024 Gm29422-201ENSMUST00000188062 694 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Ccdc47Q9D024 Gm28734-201ENSMUST00000188104 696 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Ccdc47Q9D024 Gm28787-201ENSMUST00000188357 696 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Ccdc47Q9D024 Gm29312-201ENSMUST00000188724 696 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Ccdc47Q9D024 Gm29451-201ENSMUST00000188862 696 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Ccdc47Q9D024 Gm29637-201ENSMUST00000188877 696 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.6 ms