Protein–RNA interactions for Protein: Q99PQ1

Trim12a, Tripartite motif-containing protein 12A, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim12aQ99PQ1 Gm43400-201ENSMUST00000197294 1254 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Trim12aQ99PQ1 Gm44374-201ENSMUST00000199821 140 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Trim12aQ99PQ1 Gm31305-202ENSMUST00000200435 761 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Trim12aQ99PQ1 Gm30708-201ENSMUST00000202183 312 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Trim12aQ99PQ1 AC102312.1-203ENSMUST00000219530 763 ntTSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Trim12aQ99PQ1 AC127242.3-201ENSMUST00000222009 580 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Trim12aQ99PQ1 AC165157.1-201ENSMUST00000222981 580 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Trim12aQ99PQ1 AC159267.1-201ENSMUST00000226702 678 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Trim12aQ99PQ1 CT009556.4-201ENSMUST00000227092 200 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Trim12aQ99PQ1 Tipin-201ENSMUST00000034964 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Trim12aQ99PQ1 1700102P08Rik-201ENSMUST00000035234 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Trim12aQ99PQ1 Gm9800-201ENSMUST00000052615 336 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Trim12aQ99PQ1 4930515G13Rik-201ENSMUST00000057521 492 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Trim12aQ99PQ1 Olfr23-201ENSMUST00000092917 978 ntAPPRIS P1 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Trim12aQ99PQ1 Nxt2-204ENSMUST00000112916 2532 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Trim12aQ99PQ1 Clcn5-201ENSMUST00000004428 8390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Trim12aQ99PQ1 Vmn1r22-206ENSMUST00000228905 2394 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Trim12aQ99PQ1 1810064F22Rik-203ENSMUST00000188595 2307 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Trim12aQ99PQ1 Gm29017-201ENSMUST00000190598 2092 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Trim12aQ99PQ1 Ankrd17-205ENSMUST00000197021 8067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Trim12aQ99PQ1 Sbf2-208ENSMUST00000166020 5481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Trim12aQ99PQ1 Gm42568-201ENSMUST00000195639 1841 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Trim12aQ99PQ1 Olfr1215-202ENSMUST00000214809 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Trim12aQ99PQ1 Atm-201ENSMUST00000118282 10006 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Trim12aQ99PQ1 Gm36041-201ENSMUST00000218971 2245 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Trim12aQ99PQ1 Ralyl-203ENSMUST00000171075 1459 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Trim12aQ99PQ1 Gm29398-201ENSMUST00000186355 1491 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Trim12aQ99PQ1 Gm37896-201ENSMUST00000195611 2791 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Trim12aQ99PQ1 Snrpb2-201ENSMUST00000008477 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Trim12aQ99PQ1 E330011O21Rik-204ENSMUST00000210839 1361 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Trim12aQ99PQ1 Mapk10-206ENSMUST00000133069 2732 ntTSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Trim12aQ99PQ1 AC164623.1-201ENSMUST00000217947 2709 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Trim12aQ99PQ1 Gm9519-201ENSMUST00000206108 1337 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Trim12aQ99PQ1 AC160966.1-202ENSMUST00000216860 1318 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Trim12aQ99PQ1 Vmn2r57-201ENSMUST00000165029 2592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Trim12aQ99PQ1 Gm22256-201ENSMUST00000102291 107 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Trim12aQ99PQ1 Gm16073-201ENSMUST00000116032 517 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Trim12aQ99PQ1 Rpl22-ps1-201ENSMUST00000118652 386 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Trim12aQ99PQ1 Olfr1017-ps1-201ENSMUST00000121263 664 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Trim12aQ99PQ1 Rps19-ps14-201ENSMUST00000121832 269 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Trim12aQ99PQ1 Gm14847-201ENSMUST00000121978 519 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Trim12aQ99PQ1 Gm11916-201ENSMUST00000132759 650 ntTSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Trim12aQ99PQ1 Gm15564-201ENSMUST00000144134 545 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Trim12aQ99PQ1 Obox3-204ENSMUST00000173912 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Trim12aQ99PQ1 Gm20530-201ENSMUST00000174261 254 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Trim12aQ99PQ1 Gm23945-201ENSMUST00000179609 92 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Trim12aQ99PQ1 Gm8245-201ENSMUST00000182434 987 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Trim12aQ99PQ1 Gm40330-201ENSMUST00000196498 669 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Trim12aQ99PQ1 Gm43033-201ENSMUST00000199682 425 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Trim12aQ99PQ1 Gm4751-201ENSMUST00000200620 1105 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Trim12aQ99PQ1 4833404L02Rik-201ENSMUST00000206290 908 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Trim12aQ99PQ1 Gm45431-201ENSMUST00000210143 588 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Trim12aQ99PQ1 Raet1e-201ENSMUST00000065527 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Trim12aQ99PQ1 Gm5528-201ENSMUST00000076314 480 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Trim12aQ99PQ1 Olfr376-201ENSMUST00000078952 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Trim12aQ99PQ1 Olfr1265-201ENSMUST00000080311 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Trim12aQ99PQ1 Gm24451-201ENSMUST00000083353 133 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Trim12aQ99PQ1 Olfr1269-201ENSMUST00000099756 1018 ntAPPRIS P1 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Trim12aQ99PQ1 Gm3512-202ENSMUST00000172431 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Trim12aQ99PQ1 Gm6679-201ENSMUST00000191467 1869 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Trim12aQ99PQ1 Zfp930-204ENSMUST00000212681 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Trim12aQ99PQ1 Vmn1r35-203ENSMUST00000227354 2319 ntAPPRIS P1 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Trim12aQ99PQ1 Sin3a-204ENSMUST00000167715 4961 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Trim12aQ99PQ1 Gm1527-201ENSMUST00000099170 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Trim12aQ99PQ1 Elmo1-202ENSMUST00000180626 2020 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Trim12aQ99PQ1 Gm29670-201ENSMUST00000190228 2491 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Trim12aQ99PQ1 AC187103.1-201ENSMUST00000224641 1475 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Trim12aQ99PQ1 Vmn1r52-204ENSMUST00000227578 2370 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Trim12aQ99PQ1 Smarca2-246ENSMUST00000209085 1841 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Trim12aQ99PQ1 Psg18-202ENSMUST00000098783 1783 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Trim12aQ99PQ1 Olfr702-201ENSMUST00000080899 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Trim12aQ99PQ1 Smc5-201ENSMUST00000087556 5683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Trim12aQ99PQ1 Olfr585-201ENSMUST00000104881 1030 ntAPPRIS P1 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Trim12aQ99PQ1 Gm12886-201ENSMUST00000106266 1149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Trim12aQ99PQ1 Gm5601-201ENSMUST00000118909 972 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Trim12aQ99PQ1 Gm6654-201ENSMUST00000118950 348 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Trim12aQ99PQ1 Gm13754-201ENSMUST00000120486 998 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Trim12aQ99PQ1 Gm7494-201ENSMUST00000121248 441 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Trim12aQ99PQ1 Gm15743-201ENSMUST00000129645 242 ntTSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Trim12aQ99PQ1 Gm7613-201ENSMUST00000139070 487 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Trim12aQ99PQ1 Gm12629-201ENSMUST00000145751 711 ntTSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Trim12aQ99PQ1 Casp12-204ENSMUST00000151332 1065 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Trim12aQ99PQ1 Gm25969-201ENSMUST00000157166 132 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Trim12aQ99PQ1 Gm24545-201ENSMUST00000158651 85 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Trim12aQ99PQ1 Gm6047-201ENSMUST00000167221 574 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Trim12aQ99PQ1 Gm26238-201ENSMUST00000175538 117 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Trim12aQ99PQ1 Mir7046-201ENSMUST00000183435 66 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Trim12aQ99PQ1 Gm28801-201ENSMUST00000188761 449 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Trim12aQ99PQ1 4930533L02Rik-201ENSMUST00000194425 1160 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Trim12aQ99PQ1 Gm1969-201ENSMUST00000198125 1220 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Trim12aQ99PQ1 Gm5717-201ENSMUST00000198243 1062 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Trim12aQ99PQ1 Mark1-ps1-201ENSMUST00000198516 717 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Trim12aQ99PQ1 Ighv1-83-201ENSMUST00000199643 351 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Trim12aQ99PQ1 Fxyd4-207ENSMUST00000204214 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Trim12aQ99PQ1 Gm9357-201ENSMUST00000207138 805 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Trim12aQ99PQ1 Gm44833-201ENSMUST00000208368 331 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Trim12aQ99PQ1 Olfr1284-202ENSMUST00000209096 1064 ntAPPRIS P1 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Trim12aQ99PQ1 AC153847.1-201ENSMUST00000214524 353 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Trim12aQ99PQ1 Gm9231-201ENSMUST00000220817 1009 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Trim12aQ99PQ1 AC152394.1-201ENSMUST00000227360 1086 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
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