Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

Predictions only

Length 1,454 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 Gm22355-201ENSMUST00000175531 96 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
PtprtQ99M80 Epgn-202ENSMUST00000202724 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PtprtQ99M80 Gm18290-201ENSMUST00000202900 844 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
PtprtQ99M80 1300002E11Rik-206ENSMUST00000209728 701 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
PtprtQ99M80 Olfr107-201ENSMUST00000077008 1033 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
PtprtQ99M80 Tex14-201ENSMUST00000060835 4763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
PtprtQ99M80 Kif2a-204ENSMUST00000122233 3533 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PtprtQ99M80 CT571245.1-201ENSMUST00000218642 3465 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
PtprtQ99M80 Avpr1b-201ENSMUST00000027690 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PtprtQ99M80 Rbm27-202ENSMUST00000091920 6266 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PtprtQ99M80 Mynn-201ENSMUST00000047502 3394 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PtprtQ99M80 Csta1-201ENSMUST00000096090 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PtprtQ99M80 Sorbs1-211ENSMUST00000224667 4313 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
PtprtQ99M80 Crispld1-202ENSMUST00000159958 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PtprtQ99M80 Serpinb8-202ENSMUST00000112706 4581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PtprtQ99M80 Tbc1d24-203ENSMUST00000097376 7265 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PtprtQ99M80 Klhl1-201ENSMUST00000022666 6645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PtprtQ99M80 Gm43684-201ENSMUST00000199279 6573 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
PtprtQ99M80 Lmbrd2-201ENSMUST00000090380 3210 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PtprtQ99M80 Olfr452-203ENSMUST00000215719 2728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
PtprtQ99M80 Prg4-203ENSMUST00000111902 3636 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
PtprtQ99M80 Hmgxb4-202ENSMUST00000109940 2656 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PtprtQ99M80 Spata13-201ENSMUST00000022566 7517 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
PtprtQ99M80 Gm11105-201ENSMUST00000112781 478 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
PtprtQ99M80 Rpl23a-ps2-201ENSMUST00000119375 474 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
PtprtQ99M80 Gm15187-201ENSMUST00000122329 264 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
PtprtQ99M80 Gm21772-201ENSMUST00000169213 478 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
PtprtQ99M80 Gm17126-201ENSMUST00000172276 523 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
PtprtQ99M80 Igkv4-83-201ENSMUST00000196933 334 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
PtprtQ99M80 Alox5ap-203ENSMUST00000200928 356 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
PtprtQ99M80 Gm43631-201ENSMUST00000202011 369 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
PtprtQ99M80 Gm45196-201ENSMUST00000206751 825 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
PtprtQ99M80 4930405G09Rik-201ENSMUST00000207912 1060 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
PtprtQ99M80 Gm9292-201ENSMUST00000222008 710 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
PtprtQ99M80 CT025566.1-202ENSMUST00000224800 2511 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
PtprtQ99M80 Myo15-203ENSMUST00000094135 11715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
PtprtQ99M80 Olfr478-202ENSMUST00000210173 2477 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
PtprtQ99M80 Zfp780b-203ENSMUST00000205874 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PtprtQ99M80 Atad5-202ENSMUST00000108239 7266 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
PtprtQ99M80 Atad5-201ENSMUST00000017694 7272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PtprtQ99M80 Mir124-2hg-201ENSMUST00000185804 3844 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
PtprtQ99M80 Map3k19-205ENSMUST00000208183 4865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
PtprtQ99M80 Myof-202ENSMUST00000172095 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
PtprtQ99M80 Tmc3-203ENSMUST00000164944 3306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
PtprtQ99M80 Gm28475-201ENSMUST00000187645 1497 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
PtprtQ99M80 Gm13872-202ENSMUST00000143995 1408 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PtprtQ99M80 Itk-201ENSMUST00000020664 4272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PtprtQ99M80 Med12l-206ENSMUST00000199659 11006 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
PtprtQ99M80 Nt5c1b-220ENSMUST00000223534 1798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
PtprtQ99M80 Gm10466-201ENSMUST00000101450 2466 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PtprtQ99M80 Gm33680-202ENSMUST00000219411 3401 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PtprtQ99M80 Pitpnc1-201ENSMUST00000040380 5478 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PtprtQ99M80 Dcdc5-201ENSMUST00000037284 3093 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PtprtQ99M80 Gm28403-201ENSMUST00000188743 2710 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PtprtQ99M80 Gm732-201ENSMUST00000101290 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PtprtQ99M80 Wdhd1-204ENSMUST00000187531 4260 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
PtprtQ99M80 Slc25a40-202ENSMUST00000170496 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PtprtQ99M80 Bank1-201ENSMUST00000041577 3268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PtprtQ99M80 Gpr158-201ENSMUST00000055946 7171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PtprtQ99M80 Rabgap1-202ENSMUST00000066055 4247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PtprtQ99M80 Gm24855-201ENSMUST00000104848 97 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
PtprtQ99M80 Gm13610-201ENSMUST00000128298 951 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PtprtQ99M80 Gm11368-201ENSMUST00000139576 609 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
PtprtQ99M80 Gm22636-201ENSMUST00000158142 275 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
PtprtQ99M80 Gm26570-201ENSMUST00000180672 342 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
PtprtQ99M80 Mir3473e-201ENSMUST00000183932 110 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
PtprtQ99M80 Gm28364-201ENSMUST00000187908 334 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
PtprtQ99M80 1700108F19Rik-203ENSMUST00000188798 619 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PtprtQ99M80 1700108F19Rik-206ENSMUST00000191266 857 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PtprtQ99M80 Gm6119-201ENSMUST00000193443 1206 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
PtprtQ99M80 Gm19182-201ENSMUST00000207139 577 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
PtprtQ99M80 Olfr565-ps1-201ENSMUST00000209824 944 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
PtprtQ99M80 Gm45782-201ENSMUST00000212670 366 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
PtprtQ99M80 Trappc1-201ENSMUST00000060956 628 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
PtprtQ99M80 1700019A02Rik-201ENSMUST00000072235 646 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PtprtQ99M80 Olfr1387-201ENSMUST00000073824 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
PtprtQ99M80 Gm25682-201ENSMUST00000083942 164 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
PtprtQ99M80 Defa31-201ENSMUST00000098896 377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PtprtQ99M80 Wipf3-205ENSMUST00000163746 4102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
PtprtQ99M80 Olfr1509-206ENSMUST00000215030 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
PtprtQ99M80 Slc17a4-202ENSMUST00000110407 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PtprtQ99M80 Gm43750-201ENSMUST00000199027 2493 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
PtprtQ99M80 Ptpro-202ENSMUST00000167002 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PtprtQ99M80 Adamtsl1-209ENSMUST00000141889 7805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
PtprtQ99M80 Gm38416-201ENSMUST00000209648 3565 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PtprtQ99M80 Chrna2-201ENSMUST00000022620 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PtprtQ99M80 1700015I17Rik-201ENSMUST00000209585 2099 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
PtprtQ99M80 Scoc-201ENSMUST00000081506 1791 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PtprtQ99M80 Gm37690-202ENSMUST00000192684 1497 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
PtprtQ99M80 Tdrkh-201ENSMUST00000045245 2642 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PtprtQ99M80 Zfp78-201ENSMUST00000086323 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
PtprtQ99M80 Eif2ak4-204ENSMUST00000110870 5116 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PtprtQ99M80 Tcaf3-201ENSMUST00000069023 3110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PtprtQ99M80 Pcdh15-227ENSMUST00000152655 3860 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PtprtQ99M80 Scn8a-213ENSMUST00000201549 7120 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
PtprtQ99M80 Ank3-208ENSMUST00000182029 3825 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PtprtQ99M80 Gm44777-202ENSMUST00000206492 1889 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
PtprtQ99M80 Pbrm1-205ENSMUST00000112092 5009 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
PtprtQ99M80 Kmo-202ENSMUST00000097458 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
PtprtQ99M80 Olfr92-202ENSMUST00000214994 2073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 129.8 ms