Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE13

Ccdc17, Coiled-coil domain-containing protein 17, mousemouse

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Length 565 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc17Q8CE13 Trrap-202ENSMUST00000094120 12456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Ccdc17Q8CE13 Nyap2-204ENSMUST00000123720 3471 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Ccdc17Q8CE13 AC116476.1-201ENSMUST00000226274 2318 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc17Q8CE13 Gm29450-201ENSMUST00000189657 1497 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc17Q8CE13 Gm29278-202ENSMUST00000189701 1497 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc17Q8CE13 Gm9874-202ENSMUST00000194957 1464 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc17Q8CE13 Dnase1-201ENSMUST00000006136 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc17Q8CE13 Akr1c20-202ENSMUST00000080361 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc17Q8CE13 Vmn2r58-201ENSMUST00000171671 2589 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc17Q8CE13 Trim30c-201ENSMUST00000106828 1716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc17Q8CE13 Mmp10-201ENSMUST00000034488 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc17Q8CE13 Apol10a-202ENSMUST00000119997 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc17Q8CE13 AC138284.1-201ENSMUST00000214258 3236 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc17Q8CE13 Gm42820-201ENSMUST00000200084 3063 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc17Q8CE13 Lilra6-202ENSMUST00000090689 1977 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc17Q8CE13 Gm15638-203ENSMUST00000154775 2945 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc17Q8CE13 Gm37896-201ENSMUST00000195611 2791 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc17Q8CE13 Adam28-203ENSMUST00000224039 2638 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc17Q8CE13 Iglc2-201ENSMUST00000103749 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc17Q8CE13 Olfr1196-201ENSMUST00000104892 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc17Q8CE13 Gm13732-201ENSMUST00000117753 535 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc17Q8CE13 Gm11445-201ENSMUST00000119101 532 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc17Q8CE13 4930448K20Rik-201ENSMUST00000120570 998 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc17Q8CE13 Gm13940-201ENSMUST00000121023 301 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc17Q8CE13 Gm15845-201ENSMUST00000130244 996 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc17Q8CE13 2610204G07Rik-201ENSMUST00000131215 992 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc17Q8CE13 Gm25395-201ENSMUST00000157343 272 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc17Q8CE13 Mir1929-201ENSMUST00000158635 93 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc17Q8CE13 Gm17212-201ENSMUST00000166666 259 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc17Q8CE13 Obox3-204ENSMUST00000173912 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc17Q8CE13 Gm2888-202ENSMUST00000178577 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc17Q8CE13 4930556G22Rik-201ENSMUST00000185689 741 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc17Q8CE13 Gm29043-201ENSMUST00000186371 623 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc17Q8CE13 Gm28147-201ENSMUST00000187133 621 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc17Q8CE13 Gm29363-201ENSMUST00000189365 621 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc17Q8CE13 S100a6-203ENSMUST00000198128 464 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc17Q8CE13 Gm43377-201ENSMUST00000201640 455 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc17Q8CE13 Gm33586-201ENSMUST00000210768 892 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc17Q8CE13 Olfr882-ps1-201ENSMUST00000211842 450 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc17Q8CE13 AC108846.4-201ENSMUST00000216783 341 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc17Q8CE13 Gm4042-201ENSMUST00000216946 637 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc17Q8CE13 Gm19073-201ENSMUST00000219978 555 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc17Q8CE13 AC156576.3-201ENSMUST00000221940 452 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc17Q8CE13 AC140477.3-201ENSMUST00000222271 475 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc17Q8CE13 AC134917.2-201ENSMUST00000223354 124 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc17Q8CE13 Cypt1-201ENSMUST00000024026 672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc17Q8CE13 5530400C23Rik-201ENSMUST00000048459 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc17Q8CE13 Zfp865-202ENSMUST00000076791 1129 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc17Q8CE13 1700084J12Rik-201ENSMUST00000079057 734 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc17Q8CE13 Olfr1197-201ENSMUST00000099815 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc17Q8CE13 Clec2g-201ENSMUST00000000254 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc17Q8CE13 Olfr1241-202ENSMUST00000214743 2328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc17Q8CE13 Lonrf2-201ENSMUST00000039612 5077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc17Q8CE13 Cnot2-203ENSMUST00000105267 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc17Q8CE13 Tatdn1-201ENSMUST00000110155 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc17Q8CE13 Gm15229-201ENSMUST00000146636 1398 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc17Q8CE13 Scn1a-202ENSMUST00000094951 5946 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc17Q8CE13 Hsd11b1-201ENSMUST00000016338 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc17Q8CE13 Tlr1-202ENSMUST00000197315 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc17Q8CE13 Olfr1388-202ENSMUST00000215226 3034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc17Q8CE13 Olfr1392-203ENSMUST00000214170 3507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc17Q8CE13 Olfr1392-205ENSMUST00000214598 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc17Q8CE13 Gm3591-201ENSMUST00000164408 1745 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Ccdc17Q8CE13 Slc6a20a-203ENSMUST00000171647 3894 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc17Q8CE13 Stat4-201ENSMUST00000027277 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc17Q8CE13 Gramd2-203ENSMUST00000128944 3705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc17Q8CE13 Gm9575-201ENSMUST00000122140 1339 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc17Q8CE13 Msn-201ENSMUST00000117399 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc17Q8CE13 Zwint-202ENSMUST00000105431 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc17Q8CE13 Dthd1-201ENSMUST00000170704 2427 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc17Q8CE13 Gm45786-201ENSMUST00000213021 2278 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc17Q8CE13 Vgll1-201ENSMUST00000033465 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc17Q8CE13 Sin3a-204ENSMUST00000167715 4961 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc17Q8CE13 Gm43483-201ENSMUST00000196724 2860 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc17Q8CE13 Gm43019-201ENSMUST00000196948 2863 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc17Q8CE13 Agbl1-202ENSMUST00000107442 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc17Q8CE13 Gm26144-201ENSMUST00000104475 132 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc17Q8CE13 Olfr1094-201ENSMUST00000105211 1147 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc17Q8CE13 Gm13333-201ENSMUST00000119424 781 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc17Q8CE13 Gm15164-201ENSMUST00000122203 271 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc17Q8CE13 Gm15543-201ENSMUST00000141307 361 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc17Q8CE13 Gm12440-201ENSMUST00000155224 1070 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc17Q8CE13 Mir1953-201ENSMUST00000157866 89 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc17Q8CE13 Spink10-205ENSMUST00000162365 1076 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc17Q8CE13 Gm17118-201ENSMUST00000164032 335 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc17Q8CE13 Kcnj13-202ENSMUST00000174179 261 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc17Q8CE13 Mir3078-201ENSMUST00000175231 87 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc17Q8CE13 Gm27602-201ENSMUST00000183861 111 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc17Q8CE13 Gm37355-201ENSMUST00000193345 606 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc17Q8CE13 2310046K23Rik-201ENSMUST00000193521 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc17Q8CE13 Gm36965-201ENSMUST00000193797 394 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc17Q8CE13 9430087J23Rik-201ENSMUST00000195414 1152 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc17Q8CE13 Gm5717-201ENSMUST00000198243 1062 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc17Q8CE13 Gm42543-201ENSMUST00000198756 353 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc17Q8CE13 Gm7285-201ENSMUST00000198801 580 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc17Q8CE13 Gm42983-201ENSMUST00000199879 815 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc17Q8CE13 Gm44411-201ENSMUST00000204172 349 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc17Q8CE13 Gm26911-202ENSMUST00000204244 763 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc17Q8CE13 4930513N20Rik-201ENSMUST00000207466 1265 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Ccdc17Q8CE13 Gm45626-201ENSMUST00000210093 361 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
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