Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDN8

Ccdc38, Coiled-coil domain-containing protein 38, mousemouse

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Length 563 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc38Q8CDN8 Gm29470-201ENSMUST00000188007 696 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Ccdc38Q8CDN8 Gm4785-201ENSMUST00000191025 751 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Ccdc38Q8CDN8 Shisa5-214ENSMUST00000198708 771 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Ccdc38Q8CDN8 Gm31663-202ENSMUST00000208481 1190 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Ccdc38Q8CDN8 4930465I24Rik-201ENSMUST00000209697 426 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Ccdc38Q8CDN8 Olfr1333-202ENSMUST00000214477 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Ccdc38Q8CDN8 Acp2-201ENSMUST00000002172 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Ccdc38Q8CDN8 CT009718.2-202ENSMUST00000222092 704 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Ccdc38Q8CDN8 AC154718.1-201ENSMUST00000226676 250 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Ccdc38Q8CDN8 AC133283.1-201ENSMUST00000228443 859 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Ccdc38Q8CDN8 Klk1b8-201ENSMUST00000072204 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Ccdc38Q8CDN8 Itih4-202ENSMUST00000078490 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Ccdc38Q8CDN8 Cmah-207ENSMUST00000224657 3124 ntAPPRIS P1 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Ccdc38Q8CDN8 Slc30a7-201ENSMUST00000067485 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Ccdc38Q8CDN8 P2ry14-203ENSMUST00000196081 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Ccdc38Q8CDN8 Etv1-203ENSMUST00000160244 2032 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Ccdc38Q8CDN8 C030029H02Rik-202ENSMUST00000210356 2980 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.2
Ccdc38Q8CDN8 Gm43880-201ENSMUST00000203635 2162 ntBASIC7.59□□□□□ -1.2
Ccdc38Q8CDN8 4930402F06Rik-202ENSMUST00000113010 1372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.2
Ccdc38Q8CDN8 Cenpw-202ENSMUST00000216853 4143 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.2
Ccdc38Q8CDN8 Rbfox1-201ENSMUST00000056416 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Ccdc38Q8CDN8 Hyal4-201ENSMUST00000031691 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Ccdc38Q8CDN8 Col6a6-201ENSMUST00000060896 3954 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Ccdc38Q8CDN8 Macrod2os2-201ENSMUST00000143227 3566 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Ccdc38Q8CDN8 Usp8-201ENSMUST00000028841 4145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Ccdc38Q8CDN8 Atp13a4-202ENSMUST00000057018 4054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Ccdc38Q8CDN8 A230028O05Rik-201ENSMUST00000181655 2793 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Ccdc38Q8CDN8 Lrrc51-203ENSMUST00000106963 835 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Ccdc38Q8CDN8 Lrrc51-204ENSMUST00000106964 872 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Ccdc38Q8CDN8 Smpx-203ENSMUST00000112521 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Ccdc38Q8CDN8 Gm13463-201ENSMUST00000119020 233 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Ccdc38Q8CDN8 Gm14156-201ENSMUST00000121538 483 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Ccdc38Q8CDN8 Gm13237-201ENSMUST00000122151 635 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Ccdc38Q8CDN8 Gm4887-201ENSMUST00000122230 1053 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Ccdc38Q8CDN8 Gm14097-201ENSMUST00000147868 470 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Ccdc38Q8CDN8 Gm25277-201ENSMUST00000157266 324 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Ccdc38Q8CDN8 Gm16006-201ENSMUST00000160938 566 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Ccdc38Q8CDN8 Gm25574-201ENSMUST00000175245 249 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Ccdc38Q8CDN8 Gm24756-201ENSMUST00000177002 96 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Ccdc38Q8CDN8 2010309G21Rik-201ENSMUST00000198927 458 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Ccdc38Q8CDN8 Zfp799-203ENSMUST00000201876 632 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Ccdc38Q8CDN8 Gm5305-201ENSMUST00000204010 746 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Ccdc38Q8CDN8 Gm45045-201ENSMUST00000207368 218 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Ccdc38Q8CDN8 Gm45732-201ENSMUST00000212460 586 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Ccdc38Q8CDN8 AC107453.3-201ENSMUST00000228205 639 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Ccdc38Q8CDN8 AC125117.2-201ENSMUST00000228344 1140 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Ccdc38Q8CDN8 Olfr1305-201ENSMUST00000099608 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Ccdc38Q8CDN8 Lrrc37a-201ENSMUST00000153273 9647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Ccdc38Q8CDN8 Gm45457-201ENSMUST00000209931 3089 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Ccdc38Q8CDN8 Scaper-202ENSMUST00000214747 5231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Ccdc38Q8CDN8 Tdrkh-207ENSMUST00000197901 2652 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Ccdc38Q8CDN8 Gm43190-201ENSMUST00000187850 1779 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Ccdc38Q8CDN8 Gm37429-201ENSMUST00000193807 1799 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Ccdc38Q8CDN8 Ranbp6-201ENSMUST00000099525 4575 ntAPPRIS P1 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Ccdc38Q8CDN8 Cd44-201ENSMUST00000005218 5614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Ccdc38Q8CDN8 9830132P13Rik-201ENSMUST00000198240 4187 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Ccdc38Q8CDN8 Gm38811-201ENSMUST00000203781 3478 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Ccdc38Q8CDN8 4930449A18Rik-201ENSMUST00000094228 2071 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Ccdc38Q8CDN8 Dsg1b-201ENSMUST00000076737 3965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Ccdc38Q8CDN8 Clasp1-202ENSMUST00000070989 7767 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Ccdc38Q8CDN8 Abca8b-201ENSMUST00000020948 7423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Ccdc38Q8CDN8 Hrasls-201ENSMUST00000089824 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Ccdc38Q8CDN8 Gm45949-201ENSMUST00000221550 1895 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Ccdc38Q8CDN8 Gm43187-201ENSMUST00000200652 2397 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Ccdc38Q8CDN8 Cd44-207ENSMUST00000111194 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
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Ccdc38Q8CDN8 Pde10a-208ENSMUST00000115724 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Ccdc38Q8CDN8 Il1a-201ENSMUST00000028882 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Ccdc38Q8CDN8 Clcn5-201ENSMUST00000004428 8390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
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Ccdc38Q8CDN8 Arhgap15-201ENSMUST00000055776 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Ccdc38Q8CDN8 Olfr121-202ENSMUST00000174675 1494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Ccdc38Q8CDN8 Asap1-206ENSMUST00000175799 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Ccdc38Q8CDN8 Olfr1396-204ENSMUST00000215553 4237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Ccdc38Q8CDN8 AC163354.1-201ENSMUST00000220620 1630 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Ccdc38Q8CDN8 Olfr694-203ENSMUST00000216118 5035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Ccdc38Q8CDN8 Vmn1r90-201ENSMUST00000185220 7144 ntAPPRIS P2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Ccdc38Q8CDN8 Igsf10-203ENSMUST00000194546 8393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Ccdc38Q8CDN8 Lpin2-203ENSMUST00000126681 4167 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Ccdc38Q8CDN8 Vmn2r-ps159-201ENSMUST00000074107 2716 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Ccdc38Q8CDN8 Zfp748-202ENSMUST00000181892 5293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Ccdc38Q8CDN8 Pde10a-207ENSMUST00000115722 3673 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Ccdc38Q8CDN8 Gm25379-201ENSMUST00000104338 114 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Ccdc38Q8CDN8 Gm13871-201ENSMUST00000107318 936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Ccdc38Q8CDN8 Gm11757-201ENSMUST00000107320 936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Ccdc38Q8CDN8 Gm11758-201ENSMUST00000107326 936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Ccdc38Q8CDN8 Gm15105-201ENSMUST00000117777 204 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Ccdc38Q8CDN8 Gm8624-201ENSMUST00000118083 432 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Ccdc38Q8CDN8 Gm13900-201ENSMUST00000119402 498 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Ccdc38Q8CDN8 Gm11198-201ENSMUST00000119771 974 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Ccdc38Q8CDN8 Gm12152-201ENSMUST00000122465 684 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Ccdc38Q8CDN8 Gm16984-201ENSMUST00000130003 982 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Ccdc38Q8CDN8 Mir1929-201ENSMUST00000158635 93 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Ccdc38Q8CDN8 Gm20549-201ENSMUST00000174804 429 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Ccdc38Q8CDN8 Mir8120-201ENSMUST00000185035 139 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Ccdc38Q8CDN8 Gm28801-201ENSMUST00000188761 449 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Ccdc38Q8CDN8 Gm26413-201ENSMUST00000196783 126 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Ccdc38Q8CDN8 Gm2287-201ENSMUST00000197417 1084 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
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