Protein–RNA interactions for Protein: Q8C006

Trim35, Tripartite motif-containing protein 35, mousemouse

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Length 501 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim35Q8C006 Stx12-201ENSMUST00000030698 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Trim35Q8C006 AC163040.1-201ENSMUST00000222979 4288 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Trim35Q8C006 Gm17980-201ENSMUST00000217977 2349 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Trim35Q8C006 Gm42678-201ENSMUST00000197163 2221 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Trim35Q8C006 Nasp-202ENSMUST00000030457 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Trim35Q8C006 Gna14-201ENSMUST00000025602 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Trim35Q8C006 Muc6-201ENSMUST00000062451 8650 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Trim35Q8C006 Tmx2-202ENSMUST00000111664 1926 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Trim35Q8C006 Gm29571-201ENSMUST00000191547 1909 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Trim35Q8C006 Myo6-202ENSMUST00000076140 7663 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Trim35Q8C006 Olfr1174-ps-201ENSMUST00000213348 1738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Trim35Q8C006 Zbtb8os-204ENSMUST00000141235 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Trim35Q8C006 Muc4-201ENSMUST00000096106 11277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Trim35Q8C006 Gm13361-201ENSMUST00000119977 1431 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Trim35Q8C006 Olfr300-ps1-201ENSMUST00000174262 2395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Trim35Q8C006 Gm37769-201ENSMUST00000193753 2369 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Trim35Q8C006 Ncam1-204ENSMUST00000193547 6050 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Trim35Q8C006 Fam198b-201ENSMUST00000029567 6627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Trim35Q8C006 Lypd4-201ENSMUST00000079306 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Trim35Q8C006 Papolg-202ENSMUST00000102863 2171 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Trim35Q8C006 Plagl2-202ENSMUST00000109795 5571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Trim35Q8C006 Gm38059-201ENSMUST00000193746 1999 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Trim35Q8C006 Zfp112-202ENSMUST00000120006 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Trim35Q8C006 CT009546.2-201ENSMUST00000223012 3476 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Trim35Q8C006 Ces1e-203ENSMUST00000176282 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Trim35Q8C006 Nim1k-201ENSMUST00000178142 4103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Trim35Q8C006 Gm37780-201ENSMUST00000194117 1873 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Trim35Q8C006 Sept2-213ENSMUST00000168776 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Trim35Q8C006 Trpc4-205ENSMUST00000200048 3170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Trim35Q8C006 Loxhd1-201ENSMUST00000035501 3814 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Trim35Q8C006 Ppp4r1l-ps-205ENSMUST00000141051 4466 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Trim35Q8C006 Bcl2l11-202ENSMUST00000089634 2301 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Trim35Q8C006 AC140393.1-201ENSMUST00000227959 1581 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Trim35Q8C006 Taf8-201ENSMUST00000067103 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Trim35Q8C006 Wdr37-201ENSMUST00000021572 4526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Trim35Q8C006 Mir124a-1hg-201ENSMUST00000180610 4103 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Trim35Q8C006 Syt11-201ENSMUST00000090945 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Trim35Q8C006 Gm38340-201ENSMUST00000195039 4008 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Trim35Q8C006 Zfp819-202ENSMUST00000116324 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Trim35Q8C006 Pkd1l3-201ENSMUST00000057344 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Trim35Q8C006 Gm17184-201ENSMUST00000111864 462 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Trim35Q8C006 Itpa-ps1-201ENSMUST00000117207 597 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Trim35Q8C006 Gm13215-201ENSMUST00000117559 472 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Trim35Q8C006 Pcna-ps1-201ENSMUST00000118453 738 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Trim35Q8C006 Hsd17b13-203ENSMUST00000120320 1118 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Trim35Q8C006 Pde7a-203ENSMUST00000121951 382 ntTSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Trim35Q8C006 Gm21814-201ENSMUST00000144085 291 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Trim35Q8C006 C130080G10Rik-204ENSMUST00000155185 954 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Trim35Q8C006 Gm24499-201ENSMUST00000158446 104 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Trim35Q8C006 Gm23820-201ENSMUST00000158450 300 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Trim35Q8C006 Gm17022-201ENSMUST00000166415 922 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Trim35Q8C006 Gm17158-201ENSMUST00000168150 493 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Trim35Q8C006 Commd3-212ENSMUST00000171845 938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Trim35Q8C006 Gm22690-201ENSMUST00000175054 110 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Trim35Q8C006 Ap3s1-ps2-201ENSMUST00000178107 579 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Trim35Q8C006 Gm9457-201ENSMUST00000180176 372 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Trim35Q8C006 Kif4-ps-202ENSMUST00000185083 652 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Trim35Q8C006 4930556G22Rik-201ENSMUST00000185689 741 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Trim35Q8C006 C430002N11Rik-202ENSMUST00000189067 1029 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Trim35Q8C006 Gm29014-201ENSMUST00000191422 326 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Trim35Q8C006 Gm28499-201ENSMUST00000191576 666 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Trim35Q8C006 Gm32447-201ENSMUST00000194265 697 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Trim35Q8C006 Gm38289-201ENSMUST00000194273 597 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Trim35Q8C006 Gm5845-201ENSMUST00000195812 796 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Trim35Q8C006 Gm43480-201ENSMUST00000201201 416 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Trim35Q8C006 Gm44072-201ENSMUST00000203666 383 ntTSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Trim35Q8C006 Olfr139-203ENSMUST00000206280 1059 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Trim35Q8C006 2610306O10Rik-201ENSMUST00000206512 612 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Trim35Q8C006 Gm18124-201ENSMUST00000210695 706 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
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Trim35Q8C006 Tnfrsf14-205ENSMUST00000219534 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Trim35Q8C006 4930503E24Rik-202ENSMUST00000219657 942 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Trim35Q8C006 AC121357.1-201ENSMUST00000227365 608 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Trim35Q8C006 Dbil5-201ENSMUST00000040806 581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Trim35Q8C006 Defb2-201ENSMUST00000006745 305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Trim35Q8C006 Olfr875-201ENSMUST00000080634 1004 ntAPPRIS P1 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Trim35Q8C006 Hist1h2bb-201ENSMUST00000099703 508 ntAPPRIS P1 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Trim35Q8C006 Hsd17b13-201ENSMUST00000048118 1708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Trim35Q8C006 Chrm1-201ENSMUST00000035444 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Trim35Q8C006 Olfr157-201ENSMUST00000214281 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Trim35Q8C006 Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 6642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Trim35Q8C006 Gucy2d-203ENSMUST00000206435 3634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Trim35Q8C006 Vps45-201ENSMUST00000015891 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Trim35Q8C006 Aldh1l1-201ENSMUST00000032175 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Trim35Q8C006 D830026I12Rik-203ENSMUST00000151170 1607 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Trim35Q8C006 Gm44284-201ENSMUST00000203836 3444 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Trim35Q8C006 Zic4-201ENSMUST00000066384 3891 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Trim35Q8C006 Helz2-201ENSMUST00000094203 9162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Trim35Q8C006 Pogz-205ENSMUST00000107270 6399 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Trim35Q8C006 Gm9314-201ENSMUST00000199881 1528 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Trim35Q8C006 AC140299.1-201ENSMUST00000217855 1510 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Trim35Q8C006 Gm44570-201ENSMUST00000207526 3698 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Trim35Q8C006 Luc7l-202ENSMUST00000114976 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Trim35Q8C006 Gigyf2-205ENSMUST00000172794 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Trim35Q8C006 Gm8300-201ENSMUST00000110152 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Trim35Q8C006 Olfr467-203ENSMUST00000214253 1855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Trim35Q8C006 Cep63-211ENSMUST00000216281 1791 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Trim35Q8C006 Gpm6b-208ENSMUST00000112233 2949 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Trim35Q8C006 Pvr-201ENSMUST00000043517 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Trim35Q8C006 Wasf1-201ENSMUST00000019975 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
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