Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

Predictions only

Length 2,009 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 AC159196.3-201ENSMUST00000224307 1841 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccdc88cQ6VGS5 AC153512.1-201ENSMUST00000218961 1603 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccdc88cQ6VGS5 Adgrl3-206ENSMUST00000118034 4947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccdc88cQ6VGS5 Gm4922-202ENSMUST00000216654 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr54-203ENSMUST00000217480 5048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccdc88cQ6VGS5 Asxl2-201ENSMUST00000092003 11934 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccdc88cQ6VGS5 Gm43421-201ENSMUST00000200044 2905 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccdc88cQ6VGS5 Cyp2c67-201ENSMUST00000067328 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccdc88cQ6VGS5 Mrpl48-208ENSMUST00000150042 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccdc88cQ6VGS5 Irgm1-201ENSMUST00000049519 2259 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccdc88cQ6VGS5 Gdi2-209ENSMUST00000223396 4303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccdc88cQ6VGS5 Gm25346-201ENSMUST00000104509 128 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccdc88cQ6VGS5 Xlr-203ENSMUST00000114810 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccdc88cQ6VGS5 Gm4992-201ENSMUST00000120256 768 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccdc88cQ6VGS5 Gm15750-201ENSMUST00000120970 616 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccdc88cQ6VGS5 Scgn-202ENSMUST00000142826 470 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccdc88cQ6VGS5 Gm14640-201ENSMUST00000145800 437 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccdc88cQ6VGS5 Gm6726-201ENSMUST00000172786 681 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccdc88cQ6VGS5 n-R5s209-201ENSMUST00000179494 119 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccdc88cQ6VGS5 Gm7952-201ENSMUST00000180540 984 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccdc88cQ6VGS5 Gm28586-201ENSMUST00000189857 456 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccdc88cQ6VGS5 AC147782.1-201ENSMUST00000219169 475 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccdc88cQ6VGS5 Xlr-201ENSMUST00000067763 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccdc88cQ6VGS5 Mrgprb5-201ENSMUST00000094389 1037 ntAPPRIS P1 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccdc88cQ6VGS5 Gm26843-201ENSMUST00000212304 2859 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccdc88cQ6VGS5 Gm16344-201ENSMUST00000150084 1567 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccdc88cQ6VGS5 Gm21036-201ENSMUST00000207544 2611 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccdc88cQ6VGS5 4930503L19Rik-204ENSMUST00000212155 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccdc88cQ6VGS5 Ppp1r9a-212ENSMUST00000177456 3975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccdc88cQ6VGS5 Osbpl9-219ENSMUST00000194478 2903 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccdc88cQ6VGS5 Xpo4-201ENSMUST00000089482 3456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr1272-202ENSMUST00000117141 2442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Ccdc88cQ6VGS5 AC155710.1-201ENSMUST00000219913 1353 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Ccdc88cQ6VGS5 Utp20-201ENSMUST00000004470 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
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Ccdc88cQ6VGS5 Tial1-211ENSMUST00000165023 2003 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ccdc88cQ6VGS5 Adam28-202ENSMUST00000111072 3025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ccdc88cQ6VGS5 Xrn1-201ENSMUST00000034981 5499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm11504-201ENSMUST00000120211 173 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Ccdc88cQ6VGS5 Scnm1-202ENSMUST00000173462 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ccdc88cQ6VGS5 Gm21761-201ENSMUST00000179502 516 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Ccdc88cQ6VGS5 9430087J23Rik-201ENSMUST00000195414 1152 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
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Ccdc88cQ6VGS5 4930522N08Rik-201ENSMUST00000031274 916 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
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Ccdc88cQ6VGS5 Gcc2-201ENSMUST00000057659 6547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm12292-201ENSMUST00000122911 2433 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
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Ccdc88cQ6VGS5 Olfr1155-203ENSMUST00000215903 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
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Ccdc88cQ6VGS5 Osbpl3-204ENSMUST00000114468 6494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm15348-201ENSMUST00000151188 3655 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
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Ccdc88cQ6VGS5 AC140288.1-201ENSMUST00000226329 503 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Ccdc88cQ6VGS5 Plek-201ENSMUST00000020321 3896 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ccdc88cQ6VGS5 Gm14373-201ENSMUST00000122467 2158 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Ccdc88cQ6VGS5 Daw1-203ENSMUST00000113436 1351 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ccdc88cQ6VGS5 Ugt2b37-201ENSMUST00000075858 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ccdc88cQ6VGS5 Csde1-201ENSMUST00000029446 4318 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ccdc88cQ6VGS5 Uba1y-201ENSMUST00000115894 3981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ccdc88cQ6VGS5 Dcaf1-201ENSMUST00000055009 4967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ccdc88cQ6VGS5 C030034L19Rik-201ENSMUST00000180874 2032 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ccdc88cQ6VGS5 C3ar1-201ENSMUST00000042081 4305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ccdc88cQ6VGS5 Gm8113-201ENSMUST00000160298 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ccdc88cQ6VGS5 Stat1-201ENSMUST00000070968 5151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ccdc88cQ6VGS5 Slc8a1-203ENSMUST00000163680 2913 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ccdc88cQ6VGS5 Slc8a1-201ENSMUST00000086538 2913 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Ccdc88cQ6VGS5 Psd3-201ENSMUST00000038959 11319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Ccdc88cQ6VGS5 Gm14018-201ENSMUST00000119042 455 ntBASIC7.4□□□□□ -1.23
Ccdc88cQ6VGS5 Sms-ps-201ENSMUST00000121773 1101 ntBASIC7.4□□□□□ -1.23
Ccdc88cQ6VGS5 Gm13299-201ENSMUST00000133644 425 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Ccdc88cQ6VGS5 Gm16196-201ENSMUST00000137730 464 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Ccdc88cQ6VGS5 Gm13307-202ENSMUST00000142990 425 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Ccdc88cQ6VGS5 Gm11107-201ENSMUST00000165414 505 ntBASIC7.4□□□□□ -1.23
Ccdc88cQ6VGS5 Gm21560-202ENSMUST00000177670 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Ccdc88cQ6VGS5 Gm3269-202ENSMUST00000178137 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Ccdc88cQ6VGS5 Gm3099-202ENSMUST00000178274 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Ccdc88cQ6VGS5 Gm3642-202ENSMUST00000179296 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Ccdc88cQ6VGS5 Gm3594-203ENSMUST00000179747 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Ccdc88cQ6VGS5 Gm28620-201ENSMUST00000190463 439 ntBASIC7.4□□□□□ -1.23
Ccdc88cQ6VGS5 Gm5694-201ENSMUST00000195648 641 ntBASIC7.4□□□□□ -1.23
Ccdc88cQ6VGS5 Gm43160-201ENSMUST00000196453 421 ntBASIC7.4□□□□□ -1.23
Ccdc88cQ6VGS5 Gm43391-203ENSMUST00000198110 1001 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.9 ms