Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

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Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 2200002A13Rik-201ENSMUST00000206633 709 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccdc18Q640L5 AC131795.1-201ENSMUST00000219632 426 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccdc18Q640L5 Gm25515-201ENSMUST00000083858 157 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccdc18Q640L5 Nup93-202ENSMUST00000109547 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccdc18Q640L5 Ddx6-201ENSMUST00000170489 6065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccdc18Q640L5 Dclk1-208ENSMUST00000198437 4315 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccdc18Q640L5 Olfr750-202ENSMUST00000216202 5789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccdc18Q640L5 Zfp459-201ENSMUST00000056470 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccdc18Q640L5 Gm18796-201ENSMUST00000190440 1767 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccdc18Q640L5 4921524L21Rik-201ENSMUST00000044829 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccdc18Q640L5 Csn2-206ENSMUST00000197422 1329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccdc18Q640L5 Iqch-202ENSMUST00000080527 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccdc18Q640L5 Myt1-202ENSMUST00000108756 5509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccdc18Q640L5 Olfr691-202ENSMUST00000213290 2327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccdc18Q640L5 4921528I07Rik-202ENSMUST00000213446 3798 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccdc18Q640L5 Sh3rf2-202ENSMUST00000074679 4444 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ccdc18Q640L5 2310044K18Rik-201ENSMUST00000125131 618 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ccdc18Q640L5 Klra5-201ENSMUST00000014683 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ccdc18Q640L5 Gm45350-201ENSMUST00000210560 509 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ccdc18Q640L5 Gm26130-201ENSMUST00000083171 138 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Ccdc18Q640L5 Cbx3-ps4-201ENSMUST00000091531 549 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Ccdc18Q640L5 1700034E13Rik-201ENSMUST00000091904 439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ccdc18Q640L5 Mast4-212ENSMUST00000171791 7647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
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Ccdc18Q640L5 Clasp1-218ENSMUST00000190571 7910 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ccdc18Q640L5 Pik3r4-201ENSMUST00000065778 4711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ccdc18Q640L5 Lipn-201ENSMUST00000025682 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Ccdc18Q640L5 Eml1-201ENSMUST00000054955 3879 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
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Ccdc18Q640L5 Cdhr3-201ENSMUST00000095774 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
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Ccdc18Q640L5 Cdh23-203ENSMUST00000105462 10592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
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Ccdc18Q640L5 Oxgr1-201ENSMUST00000058213 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
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Ccdc18Q640L5 Itih4-202ENSMUST00000078490 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
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Ccdc18Q640L5 Senp1-201ENSMUST00000044189 6575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ccdc18Q640L5 Tbpl2-201ENSMUST00000080453 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
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Ccdc18Q640L5 Clasp2-207ENSMUST00000214522 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
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Ccdc18Q640L5 Cep55-201ENSMUST00000096096 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
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Ccdc18Q640L5 Ttc38-203ENSMUST00000146088 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
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Ccdc18Q640L5 Spaca7-201ENSMUST00000010579 762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ccdc18Q640L5 Gm8424-201ENSMUST00000117716 988 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Ccdc18Q640L5 Gm11848-201ENSMUST00000121207 973 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Ccdc18Q640L5 AA645442-201ENSMUST00000156020 285 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
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Ccdc18Q640L5 Gm17079-201ENSMUST00000167231 666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ccdc18Q640L5 Mir6952-201ENSMUST00000185092 61 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Ccdc18Q640L5 Gm17824-201ENSMUST00000197690 805 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Ccdc18Q640L5 Spaca7-202ENSMUST00000209428 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ccdc18Q640L5 Gm7706-201ENSMUST00000209946 388 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ccdc18Q640L5 AC170913.1-201ENSMUST00000221418 758 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ccdc18Q640L5 Ep400-204ENSMUST00000112436 10685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ccdc18Q640L5 Vmn1r199-202ENSMUST00000227685 5713 ntAPPRIS P2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ccdc18Q640L5 Slc17a4-202ENSMUST00000110407 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ccdc18Q640L5 Gm37510-201ENSMUST00000194151 4762 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Ccdc18Q640L5 AC162181.1-201ENSMUST00000221643 3728 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ccdc18Q640L5 Tbcel-203ENSMUST00000125995 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ccdc18Q640L5 Gm27179-201ENSMUST00000184652 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ccdc18Q640L5 Olfr1333-202ENSMUST00000214477 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ccdc18Q640L5 Gm7961-201ENSMUST00000201338 1436 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Ccdc18Q640L5 Atp8b5-202ENSMUST00000102953 2609 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ccdc18Q640L5 Trim16-201ENSMUST00000055006 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ccdc18Q640L5 Adgrl2-212ENSMUST00000198779 4592 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ccdc18Q640L5 Gabra1-205ENSMUST00000205546 4045 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ccdc18Q640L5 Osbpl3-202ENSMUST00000090019 4039 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ccdc18Q640L5 Tpx2-202ENSMUST00000109816 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
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