Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6U5

Gtpbp6, Putative GTP-binding protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp6Q3U6U5 Mitf-207ENSMUST00000203884 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gtpbp6Q3U6U5 Gm8267-201ENSMUST00000165003 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gtpbp6Q3U6U5 Gpr171-201ENSMUST00000085040 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gtpbp6Q3U6U5 Phf21a-204ENSMUST00000111290 6332 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gtpbp6Q3U6U5 Phf21a-203ENSMUST00000090586 6310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gtpbp6Q3U6U5 Krtap16-1-201ENSMUST00000105050 1888 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gtpbp6Q3U6U5 Ikbkap-201ENSMUST00000030140 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gtpbp6Q3U6U5 Sept2-215ENSMUST00000179353 3219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
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Gtpbp6Q3U6U5 Zscan4e-202ENSMUST00000210521 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gtpbp6Q3U6U5 Hdac7-207ENSMUST00000120683 3701 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
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Gtpbp6Q3U6U5 Gm14731-201ENSMUST00000119216 376 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
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Gtpbp6Q3U6U5 Gm13348-201ENSMUST00000147324 690 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
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Gtpbp6Q3U6U5 Gm20234-201ENSMUST00000214134 717 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
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Gtpbp6Q3U6U5 Hhip-201ENSMUST00000079038 9074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Gtpbp6Q3U6U5 Scmh1-204ENSMUST00000106301 2584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
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Gtpbp6Q3U6U5 Gm26562-201ENSMUST00000181113 2010 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
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Gtpbp6Q3U6U5 4930417H01Rik-201ENSMUST00000123403 1233 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Gtpbp6Q3U6U5 Gm22604-201ENSMUST00000157604 311 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
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Gtpbp6Q3U6U5 Gm17047-201ENSMUST00000167709 430 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Gtpbp6Q3U6U5 Gm3208-201ENSMUST00000168281 427 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Gtpbp6Q3U6U5 Gm26197-201ENSMUST00000175033 115 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Gtpbp6Q3U6U5 1700010L04Rik-202ENSMUST00000178848 786 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
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