Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Gm5601-201ENSMUST00000118909 972 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 Gm6654-201ENSMUST00000118950 348 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 Gm15349-201ENSMUST00000121154 204 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 Gm6451-201ENSMUST00000121488 717 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 Gm15096-201ENSMUST00000121918 878 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 4931413K12Rik-201ENSMUST00000142068 1282 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 Gm14664-201ENSMUST00000142919 437 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 A330102I10Rik-203ENSMUST00000145801 737 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 Gm16343-201ENSMUST00000162027 410 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 Gm21877-201ENSMUST00000185640 694 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 Gm29099-201ENSMUST00000187370 760 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 Gm29464-201ENSMUST00000187692 513 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 1700020M21Rik-201ENSMUST00000188320 644 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 Gm37349-201ENSMUST00000194205 624 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 Gm43048-201ENSMUST00000196101 388 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 4930417O13Rik-204ENSMUST00000205000 999 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 D530018E20Rik-201ENSMUST00000205107 958 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 Gm36696-201ENSMUST00000205418 438 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 Gm45431-201ENSMUST00000210143 588 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 AC174082.2-201ENSMUST00000222094 543 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 9130015A21Rik-202ENSMUST00000222153 837 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 AC133203.1-201ENSMUST00000228241 301 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 AC123665.3-201ENSMUST00000228735 1216 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 Gm2840-201ENSMUST00000048361 411 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 Fpr2-201ENSMUST00000064068 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 Mir106b-201ENSMUST00000083580 82 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 Olfr1306-201ENSMUST00000099607 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 Wdr12-201ENSMUST00000027173 10012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 Vmn2r-ps159-203ENSMUST00000189559 2560 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 Trmt5-201ENSMUST00000116420 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 Gpr165-201ENSMUST00000033554 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 Gm13040-202ENSMUST00000169056 2104 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 Olfr93-203ENSMUST00000219235 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 AC117232.2-201ENSMUST00000219469 2917 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 Gm9752-201ENSMUST00000048965 2659 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 Cphx1-204ENSMUST00000184016 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 BC067074-201ENSMUST00000078163 3546 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 Ctnna2-206ENSMUST00000162273 3277 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 Ccdc83-203ENSMUST00000107221 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 Tlr1-202ENSMUST00000197315 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 F830045P16Rik-201ENSMUST00000050309 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 Tnr-202ENSMUST00000192069 12202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 Gm11541-201ENSMUST00000069852 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 Slc22a8-202ENSMUST00000170817 3398 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 4930502E18Rik-201ENSMUST00000069209 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 Mef2c-228ENSMUST00000199450 2862 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 Olfr734-203ENSMUST00000217152 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 Serpind1-202ENSMUST00000161034 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 Dcaf1-203ENSMUST00000161758 5539 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 Zfp110-205ENSMUST00000168247 2499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 Atp2b1-201ENSMUST00000020107 7130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 Birc6-223ENSMUST00000183224 14562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 Gm28431-201ENSMUST00000185592 2166 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 Gm28681-201ENSMUST00000187387 2166 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 Igkv5-43-201ENSMUST00000103368 379 ntAPPRIS P1 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 Tcrg-V6-201ENSMUST00000103555 403 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 Fabp12-203ENSMUST00000119761 548 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 Gm12400-201ENSMUST00000120915 1003 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 Gm15596-201ENSMUST00000121139 784 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 Gm15242-201ENSMUST00000122459 283 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 Gm13715-201ENSMUST00000136578 411 ntTSL 3 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 Gm13963-201ENSMUST00000143525 892 ntTSL 3 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 Gm28958-201ENSMUST00000185864 703 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 Gm8883-201ENSMUST00000187594 454 ntTSL 3 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 Gm7804-202ENSMUST00000194187 854 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 Trav7-1-201ENSMUST00000198019 337 ntAPPRIS P1 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 Trav13n-1-201ENSMUST00000198359 331 ntAPPRIS P1 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 Gm3511-201ENSMUST00000199823 204 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 Gm20234-201ENSMUST00000214134 717 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 Gm18112-201ENSMUST00000219862 1195 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 Olfr1129-201ENSMUST00000081034 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 Tnfrsf22-201ENSMUST00000075588 4170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 Deup1-202ENSMUST00000115592 2918 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 5830416I19Rik-201ENSMUST00000198687 2627 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 Atm-201ENSMUST00000118282 10006 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 Kpna2-201ENSMUST00000018506 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 Gja10-201ENSMUST00000056517 2117 ntAPPRIS P2 BASIC7.18□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 Slc38a6-208ENSMUST00000153941 3927 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 Sh3d19-201ENSMUST00000107664 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 Tshr-202ENSMUST00000021346 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 Zfp638-202ENSMUST00000113835 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 Nr1h5-203ENSMUST00000196983 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 Shprh-202ENSMUST00000054814 7225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 Arnt-205ENSMUST00000107161 4260 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 Gm5157-201ENSMUST00000185914 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 Gm10439-201ENSMUST00000101181 1977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 Masp1-201ENSMUST00000089883 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 Gin1-201ENSMUST00000027571 2494 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 Syt14-203ENSMUST00000195354 7882 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 Gm10855-201ENSMUST00000100426 2541 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 Cd36-204ENSMUST00000170051 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 Trbv13-3-201ENSMUST00000103271 340 ntAPPRIS P1 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 Igkv4-57-1-201ENSMUST00000103356 373 ntAPPRIS P1 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 Iglc2-201ENSMUST00000103749 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 Gm22284-201ENSMUST00000104132 132 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 Olfr585-201ENSMUST00000104881 1030 ntAPPRIS P1 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 Gm14741-201ENSMUST00000120777 1009 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 Gm12920-201ENSMUST00000121818 1186 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 Gm16052-201ENSMUST00000129681 505 ntTSL 2 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Trim71Q1PSW8 Tnfsf13os-201ENSMUST00000140371 816 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
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