Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 Gm26197-201ENSMUST00000175033 115 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Sox12Q04890 4930461G14Rik-201ENSMUST00000181967 843 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sox12Q04890 Klk1b7-ps-202ENSMUST00000183762 619 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Sox12Q04890 Gm29000-202ENSMUST00000185562 571 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sox12Q04890 Gm17946-201ENSMUST00000186856 538 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Sox12Q04890 Ighv2-8-201ENSMUST00000193935 262 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Sox12Q04890 Tshb-205ENSMUST00000197322 476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sox12Q04890 Gm43467-201ENSMUST00000197441 437 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Sox12Q04890 Gm17660-203ENSMUST00000198485 522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sox12Q04890 Gm4734-201ENSMUST00000200117 777 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Sox12Q04890 Gm42903-201ENSMUST00000202607 481 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sox12Q04890 Gm43026-201ENSMUST00000202972 325 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Sox12Q04890 Gm18402-201ENSMUST00000203834 586 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Sox12Q04890 Gm30504-203ENSMUST00000209762 1048 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sox12Q04890 Gm35177-201ENSMUST00000216525 623 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sox12Q04890 Gm16497-202ENSMUST00000223480 557 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sox12Q04890 AC134254.3-201ENSMUST00000223533 575 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Sox12Q04890 AC154335.1-201ENSMUST00000224744 395 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Sox12Q04890 AC090496.1-201ENSMUST00000226020 260 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Sox12Q04890 Rpl37a-201ENSMUST00000059980 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sox12Q04890 Krtdap-201ENSMUST00000098559 470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sox12Q04890 Tom1l1-203ENSMUST00000107868 2093 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sox12Q04890 Ndrg1-201ENSMUST00000005256 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sox12Q04890 CT010465.1-202ENSMUST00000221816 1355 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sox12Q04890 R3hdm2-205ENSMUST00000105251 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sox12Q04890 Ctnnd1-210ENSMUST00000111684 6021 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sox12Q04890 Arsg-201ENSMUST00000020928 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sox12Q04890 Wdr89-202ENSMUST00000187307 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sox12Q04890 Gm13108-201ENSMUST00000122287 1455 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Sox12Q04890 Efcab1-201ENSMUST00000090277 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sox12Q04890 Uox-201ENSMUST00000029837 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sox12Q04890 Abca8a-202ENSMUST00000100287 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sox12Q04890 Abca8a-204ENSMUST00000106664 5617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sox12Q04890 Dad1-202ENSMUST00000128231 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sox12Q04890 Kcns3-202ENSMUST00000164495 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sox12Q04890 3930402G23Rik-201ENSMUST00000040608 3086 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sox12Q04890 Cx3cl1-201ENSMUST00000034230 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sox12Q04890 Pttg1-204ENSMUST00000117446 1674 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sox12Q04890 H2-M10.6-201ENSMUST00000041398 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sox12Q04890 Gm26625-201ENSMUST00000181519 2538 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sox12Q04890 Stau2-207ENSMUST00000131257 3616 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sox12Q04890 Olfr655-203ENSMUST00000215538 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sox12Q04890 Olfr655-204ENSMUST00000216750 2010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sox12Q04890 Btnl5-ps-201ENSMUST00000097346 1751 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Sox12Q04890 Gm37903-201ENSMUST00000192122 2381 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Sox12Q04890 Rps24-201ENSMUST00000112384 468 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sox12Q04890 Zscan22-202ENSMUST00000117189 2995 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sox12Q04890 Gm16205-201ENSMUST00000117720 1027 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Sox12Q04890 Gm11878-201ENSMUST00000117908 400 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Sox12Q04890 Rps24-ps3-201ENSMUST00000118723 402 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Sox12Q04890 Gm12780-201ENSMUST00000122458 645 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Sox12Q04890 Gm25292-201ENSMUST00000122797 322 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Sox12Q04890 Gm12064-201ENSMUST00000133819 533 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sox12Q04890 Gm11646-201ENSMUST00000135857 397 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sox12Q04890 Gm13269-201ENSMUST00000143458 655 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sox12Q04890 Gm16566-201ENSMUST00000160387 910 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Sox12Q04890 Apol11a-201ENSMUST00000172191 1132 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sox12Q04890 4930518C09Rik-201ENSMUST00000172700 478 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sox12Q04890 Esp4-201ENSMUST00000178498 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sox12Q04890 Gm27288-201ENSMUST00000184215 80 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Sox12Q04890 Gm27597-201ENSMUST00000184365 80 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Sox12Q04890 Gm27506-201ENSMUST00000184558 80 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Sox12Q04890 Gm27529-201ENSMUST00000184975 80 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Sox12Q04890 Gm27907-201ENSMUST00000185101 80 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Sox12Q04890 Gm29018-202ENSMUST00000191356 313 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sox12Q04890 1700081B01Rik-202ENSMUST00000197543 648 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sox12Q04890 Prb3-ps-201ENSMUST00000204675 1111 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Sox12Q04890 Gm33882-201ENSMUST00000208990 651 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Sox12Q04890 Rpl32l-201ENSMUST00000216127 399 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Sox12Q04890 Gm6150-202ENSMUST00000219888 2977 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sox12Q04890 Olfr906-201ENSMUST00000045493 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sox12Q04890 Olfr738-201ENSMUST00000058972 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sox12Q04890 Ak6-202ENSMUST00000084721 1222 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sox12Q04890 Gm10222-201ENSMUST00000088336 294 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Sox12Q04890 Ccdc162-201ENSMUST00000019955 1891 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sox12Q04890 Anln-201ENSMUST00000040912 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sox12Q04890 Mad2l1-201ENSMUST00000101343 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sox12Q04890 C330024D21Rik-203ENSMUST00000202828 1714 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sox12Q04890 Rpusd1-201ENSMUST00000047273 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sox12Q04890 Gng7-201ENSMUST00000092285 3362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sox12Q04890 Gm45182-201ENSMUST00000207579 2404 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Sox12Q04890 Pabpc5-201ENSMUST00000040961 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sox12Q04890 Gm29154-211ENSMUST00000213655 1499 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sox12Q04890 Ccdc186-202ENSMUST00000118592 6445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sox12Q04890 Henmt1-203ENSMUST00000106586 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sox12Q04890 Zmynd8-206ENSMUST00000109269 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sox12Q04890 A630009H07Rik-201ENSMUST00000208485 2159 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sox12Q04890 Mns1-201ENSMUST00000034746 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sox12Q04890 Csn1s2b-202ENSMUST00000101057 1668 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sox12Q04890 4933431G14Rik-201ENSMUST00000205571 1670 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sox12Q04890 Gm12430-201ENSMUST00000121539 1322 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Sox12Q04890 Ccnd1-201ENSMUST00000093962 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sox12Q04890 Lrrcc1-201ENSMUST00000091325 3391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sox12Q04890 Dnm3-201ENSMUST00000070330 4601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sox12Q04890 Gm42661-201ENSMUST00000202364 1442 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Sox12Q04890 Gm42561-201ENSMUST00000202563 1442 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Sox12Q04890 Gm34069-201ENSMUST00000214060 2441 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sox12Q04890 Brcc3-201ENSMUST00000033544 4310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sox12Q04890 Ncoa7-210ENSMUST00000217138 2192 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sox12Q04890 Rab5b-201ENSMUST00000000727 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.7 ms